RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529273.1

ROM1-204, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene ROM1, Length 249 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-204ENST00000529273 CUL7Q14999 1698 aa47.68■■■■■ 5.22
ROM1-204ENST00000529273 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.67■■■■■ 5.22
ROM1-204ENST00000529273 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.61■■■■■ 5.21
ROM1-204ENST00000529273 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.56■■■■■ 5.2
ROM1-204ENST00000529273 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.2■■■■■ 5.15
ROM1-204ENST00000529273 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.13■■■■■ 5.14
ROM1-204ENST00000529273 IQGAP2Q13576 1575 aa47.12■■■■■ 5.13
ROM1-204ENST00000529273 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.09■■■■■ 5.13
ROM1-204ENST00000529273 PTPRGP23470 1445 aa47.07■■■■■ 5.13
ROM1-204ENST00000529273 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.05■■■■■ 5.12
ROM1-204ENST00000529273 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
ROM1-204ENST00000529273 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.01■■■■■ 5.12
ROM1-204ENST00000529273 MAPKBP1O60336 1514 aa46.91■■■■■ 5.1
ROM1-204ENST00000529273 DISP1Q96F81 1524 aa46.9■■■■■ 5.1
ROM1-204ENST00000529273 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.87■■■■■ 5.09
ROM1-204ENST00000529273 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.85■■■■■ 5.09
ROM1-204ENST00000529273 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.85■■■■■ 5.09
ROM1-204ENST00000529273 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.84■■■■■ 5.09
ROM1-204ENST00000529273 PRXQ9BXM0 1461 aa46.83■■■■■ 5.09
ROM1-204ENST00000529273 ABCC2Q92887 1545 aa46.71■■■■■ 5.07
ROM1-204ENST00000529273 UACAQ9BZF9 1416 aa46.71■■■■■ 5.07
ROM1-204ENST00000529273 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.69■■■■■ 5.06
ROM1-204ENST00000529273 DIP2BQ9P265 1576 aa46.69■■■■■ 5.06
ROM1-204ENST00000529273 KIAA0556O60303 1618 aa46.68■■■■■ 5.06
ROM1-204ENST00000529273 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.65■■■■■ 5.06
ROM1-204ENST00000529273 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.65■■■■■ 5.06
ROM1-204ENST00000529273 GOLGA3Q08378 1498 aa46.55■■■■■ 5.04
ROM1-204ENST00000529273 ASXL2Q76L83 1435 aa46.53■■■■■ 5.04
ROM1-204ENST00000529273 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.49■■■■■ 5.03
ROM1-204ENST00000529273 EEA1Q15075 1411 aa46.47■■■■■ 5.03
ROM1-204ENST00000529273 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.46■■■■■ 5.03
ROM1-204ENST00000529273 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.35■■■■■ 5.01
ROM1-204ENST00000529273 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
ROM1-204ENST00000529273 GLI2P10070 1586 aa46.29■■■■■ 5
ROM1-204ENST00000529273 TSPOAP1O95153 1857 aa46.28■■■■■ 5
ROM1-204ENST00000529273 P3H3Q8IVL6 736 aa46.27■■■■■ 5
ROM1-204ENST00000529273 ABCA8O94911 1581 aa46.25■■■■■ 4.99
ROM1-204ENST00000529273 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
ROM1-204ENST00000529273 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.21■■■■■ 4.99
ROM1-204ENST00000529273 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.16■■■■■ 4.98
ROM1-204ENST00000529273 KDM6BO15054 1643 aa46.16■■■■■ 4.98
ROM1-204ENST00000529273 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.12■■■■■ 4.97
ROM1-204ENST00000529273 SAMD9Q5K651 1589 aa46.08■■■■■ 4.97
ROM1-204ENST00000529273 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
ROM1-204ENST00000529273 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
ROM1-204ENST00000529273 KIF21BO75037 1637 aa46.01■■■■■ 4.96
ROM1-204ENST00000529273 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.01■■■■■ 4.96
ROM1-204ENST00000529273 ARID3CA6NKF2 412 aa45.98■■■■■ 4.95
ROM1-204ENST00000529273 KCNH8Q96L42 1107 aa45.98■■■■■ 4.95
ROM1-204ENST00000529273 ATP10BO94823 1461 aa45.93■■■■■ 4.94
ROM1-204ENST00000529273 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.92■■■■■ 4.94
ROM1-204ENST00000529273 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.86■■■■■ 4.93
ROM1-204ENST00000529273 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.84■■■■■ 4.93
ROM1-204ENST00000529273 CD109Q6YHK3 1445 aa45.83■■■■■ 4.93
ROM1-204ENST00000529273 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.82■■■■■ 4.93
ROM1-204ENST00000529273 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.81■■■■■ 4.92
ROM1-204ENST00000529273 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
ROM1-204ENST00000529273 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.74■■■■■ 4.91
ROM1-204ENST00000529273 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.73■■■■■ 4.91
ROM1-204ENST00000529273 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.72■■■■■ 4.91
ROM1-204ENST00000529273 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.72■■■■■ 4.91
ROM1-204ENST00000529273 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
ROM1-204ENST00000529273 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
ROM1-204ENST00000529273 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.61■■■■■ 4.89
ROM1-204ENST00000529273 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.51■■■■■ 4.88
ROM1-204ENST00000529273 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.49■■■■■ 4.87
ROM1-204ENST00000529273 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.44■■■■■ 4.87
ROM1-204ENST00000529273 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.37■■■■■ 4.85
ROM1-204ENST00000529273 FMN1Q68DA7 1419 aa45.37■■■■■ 4.85
ROM1-204ENST00000529273 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.36■■■■■ 4.85
ROM1-204ENST00000529273 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
ROM1-204ENST00000529273 ADGRL1O94910 1474 aa45.3■■■■■ 4.84
ROM1-204ENST00000529273 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
ROM1-204ENST00000529273 NEO1Q92859 1461 aa45.28■■■■■ 4.84
ROM1-204ENST00000529273 HECW1Q76N89 1606 aa45.19■■■■■ 4.83
ROM1-204ENST00000529273 RAPGEF3O95398 923 aa45.19■■■■■ 4.82
ROM1-204ENST00000529273 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.18■■■■■ 4.82
ROM1-204ENST00000529273 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
ROM1-204ENST00000529273 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.08■■■■■ 4.81
ROM1-204ENST00000529273 FANCAO15360 1455 aa45.06■■■■■ 4.8
ROM1-204ENST00000529273 AKNAQ7Z591 1439 aa45.04■■■■■ 4.8
ROM1-204ENST00000529273 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.98■■■■■ 4.79
ROM1-204ENST00000529273 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
ROM1-204ENST00000529273 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.95■■■■■ 4.79
ROM1-204ENST00000529273 PLCH2O75038 1416 aa44.95■■■■■ 4.79
ROM1-204ENST00000529273 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.94■■■■■ 4.79
ROM1-204ENST00000529273 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
ROM1-204ENST00000529273 CLIP1P30622 1438 aa44.92■■■■■ 4.78
ROM1-204ENST00000529273 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
ROM1-204ENST00000529273 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.86■■■■■ 4.77
ROM1-204ENST00000529273 KIF14Q15058 1648 aa44.83■■■■■ 4.77
ROM1-204ENST00000529273 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.82■■■■■ 4.77
ROM1-204ENST00000529273 RICTORQ6R327 1708 aa44.81■■■■■ 4.76
ROM1-204ENST00000529273 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.81■■■■■ 4.76
ROM1-204ENST00000529273 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.78■■■■■ 4.76
ROM1-204ENST00000529273 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.75■■■■■ 4.75
ROM1-204ENST00000529273 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
ROM1-204ENST00000529273 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.73■■■■■ 4.75
ROM1-204ENST00000529273 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.71■■■■■ 4.75
ROM1-204ENST00000529273 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.7■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms