RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528063.5

CNIH2-202, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CNIH2, Length 1,142 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2-202ENST00000528063 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
CNIH2-202ENST00000528063 JPH4Q96JJ6 628 aa42.3■■■■■ 4.36
CNIH2-202ENST00000528063 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.22■■■■■ 4.35
CNIH2-202ENST00000528063 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.2■■■■■ 4.35
CNIH2-202ENST00000528063 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.91■■■■■ 4.3
CNIH2-202ENST00000528063 IQGAP2Q13576 1575 aa41.9■■■■■ 4.3
CNIH2-202ENST00000528063 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.9■■■■■ 4.3
CNIH2-202ENST00000528063 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.84■■■■■ 4.29
CNIH2-202ENST00000528063 DISP1Q96F81 1524 aa41.74■■■■■ 4.27
CNIH2-202ENST00000528063 PTPRGP23470 1445 aa41.68■■■■■ 4.26
CNIH2-202ENST00000528063 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.67■■■■■ 4.26
CNIH2-202ENST00000528063 PRXQ9BXM0 1461 aa41.66■■■■■ 4.26
CNIH2-202ENST00000528063 MAPKBP1O60336 1514 aa41.66■■■■■ 4.26
CNIH2-202ENST00000528063 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.65■■■■■ 4.26
CNIH2-202ENST00000528063 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
CNIH2-202ENST00000528063 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.64■■■■■ 4.26
CNIH2-202ENST00000528063 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.64■■■■■ 4.26
CNIH2-202ENST00000528063 KIAA0556O60303 1618 aa41.57■■■■■ 4.25
CNIH2-202ENST00000528063 DIP2BQ9P265 1576 aa41.55■■■■■ 4.24
CNIH2-202ENST00000528063 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.55■■■■■ 4.24
CNIH2-202ENST00000528063 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.5■■■■■ 4.23
CNIH2-202ENST00000528063 ABCC2Q92887 1545 aa41.45■■■■■ 4.23
CNIH2-202ENST00000528063 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.43■■■■■ 4.22
CNIH2-202ENST00000528063 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.42■■■■■ 4.22
CNIH2-202ENST00000528063 UACAQ9BZF9 1416 aa41.4■■■■■ 4.22
CNIH2-202ENST00000528063 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.33■■■■■ 4.21
CNIH2-202ENST00000528063 TSPOAP1O95153 1857 aa41.29■■■■■ 4.2
CNIH2-202ENST00000528063 ASXL2Q76L83 1435 aa41.27■■■■■ 4.2
CNIH2-202ENST00000528063 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.27■■■■■ 4.2
CNIH2-202ENST00000528063 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.19
CNIH2-202ENST00000528063 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.24■■■■■ 4.19
CNIH2-202ENST00000528063 GOLGA3Q08378 1498 aa41.21■■■■■ 4.19
CNIH2-202ENST00000528063 EEA1Q15075 1411 aa41.18■■■■■ 4.18
CNIH2-202ENST00000528063 ABCA8O94911 1581 aa41.17■■■■■ 4.18
CNIH2-202ENST00000528063 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
CNIH2-202ENST00000528063 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
CNIH2-202ENST00000528063 GLI2P10070 1586 aa41.12■■■■■ 4.17
CNIH2-202ENST00000528063 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.1■■■■■ 4.17
CNIH2-202ENST00000528063 SAMD9Q5K651 1589 aa41.09■■■■■ 4.17
CNIH2-202ENST00000528063 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
CNIH2-202ENST00000528063 P3H3Q8IVL6 736 aa41.04■■■■■ 4.16
CNIH2-202ENST00000528063 KIF21BO75037 1637 aa41■■■■■ 4.15
CNIH2-202ENST00000528063 KDM6BO15054 1643 aa40.99■■■■■ 4.15
CNIH2-202ENST00000528063 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.98■■■■■ 4.15
CNIH2-202ENST00000528063 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.93■■■■■ 4.14
CNIH2-202ENST00000528063 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
CNIH2-202ENST00000528063 ARID3CA6NKF2 412 aa40.81■■■■■ 4.12
CNIH2-202ENST00000528063 ATP10BO94823 1461 aa40.8■■■■■ 4.12
CNIH2-202ENST00000528063 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.8■■■■■ 4.12
CNIH2-202ENST00000528063 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.79■■■■■ 4.12
CNIH2-202ENST00000528063 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
CNIH2-202ENST00000528063 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.74■■■■■ 4.11
CNIH2-202ENST00000528063 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.69■■■■■ 4.1
CNIH2-202ENST00000528063 KCNH8Q96L42 1107 aa40.68■■■■■ 4.1
CNIH2-202ENST00000528063 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CNIH2-202ENST00000528063 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.63■■■■■ 4.1
CNIH2-202ENST00000528063 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.62■■■■■ 4.09
CNIH2-202ENST00000528063 CD109Q6YHK3 1445 aa40.59■■■■■ 4.09
CNIH2-202ENST00000528063 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
CNIH2-202ENST00000528063 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.57■■■■■ 4.09
CNIH2-202ENST00000528063 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
CNIH2-202ENST00000528063 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.49■■■■■ 4.07
CNIH2-202ENST00000528063 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.47■■■■■ 4.07
CNIH2-202ENST00000528063 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.43■■■■■ 4.06
CNIH2-202ENST00000528063 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
CNIH2-202ENST00000528063 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
CNIH2-202ENST00000528063 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
CNIH2-202ENST00000528063 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.26■■■■■ 4.03
CNIH2-202ENST00000528063 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.24■■■■■ 4.03
CNIH2-202ENST00000528063 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.21■■■■■ 4.03
CNIH2-202ENST00000528063 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
CNIH2-202ENST00000528063 FMN1Q68DA7 1419 aa40.2■■■■■ 4.03
CNIH2-202ENST00000528063 ADGRL1O94910 1474 aa40.19■■■■■ 4.03
CNIH2-202ENST00000528063 HECW1Q76N89 1606 aa40.19■■■■■ 4.02
CNIH2-202ENST00000528063 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.17■■■■■ 4.02
CNIH2-202ENST00000528063 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.14■■■■■ 4.02
CNIH2-202ENST00000528063 NEO1Q92859 1461 aa40.13■■■■■ 4.01
CNIH2-202ENST00000528063 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
CNIH2-202ENST00000528063 RAPGEF3O95398 923 aa40.05■■■■■ 4
CNIH2-202ENST00000528063 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
CNIH2-202ENST00000528063 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.03■■■■■ 4
CNIH2-202ENST00000528063 KIF14Q15058 1648 aa40.02■■■■■ 4
CNIH2-202ENST00000528063 RICTORQ6R327 1708 aa39.97■■■■□ 3.99
CNIH2-202ENST00000528063 FANCAO15360 1455 aa39.97■■■■□ 3.99
CNIH2-202ENST00000528063 AKNAQ7Z591 1439 aa39.94■■■■□ 3.98
CNIH2-202ENST00000528063 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.91■■■■□ 3.98
CNIH2-202ENST00000528063 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.91■■■■□ 3.98
CNIH2-202ENST00000528063 CLIP1P30622 1438 aa39.89■■■■□ 3.98
CNIH2-202ENST00000528063 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CNIH2-202ENST00000528063 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.87■■■■□ 3.97
CNIH2-202ENST00000528063 PLCH2O75038 1416 aa39.86■■■■□ 3.97
CNIH2-202ENST00000528063 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
CNIH2-202ENST00000528063 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.77■■■■□ 3.96
CNIH2-202ENST00000528063 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.77■■■■□ 3.96
CNIH2-202ENST00000528063 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.75■■■■□ 3.95
CNIH2-202ENST00000528063 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.75■■■■□ 3.95
CNIH2-202ENST00000528063 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
CNIH2-202ENST00000528063 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.75■■■■□ 3.95
CNIH2-202ENST00000528063 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.72■■■■□ 3.95
CNIH2-202ENST00000528063 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.72■■■■□ 3.95
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