RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528032.5

ZNF48-204, Transcript of zinc finger protein 48, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF48, Length 555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48-204ENST00000528032 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.95■■■■■ 4.31
ZNF48-204ENST00000528032 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.9■■■■■ 4.3
ZNF48-204ENST00000528032 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.88■■■■■ 4.3
ZNF48-204ENST00000528032 JPH4Q96JJ6 628 aa41.87■■■■■ 4.29
ZNF48-204ENST00000528032 EEA1Q15075 1411 aa41.86■■■■■ 4.29
ZNF48-204ENST00000528032 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
ZNF48-204ENST00000528032 PRXQ9BXM0 1461 aa41.81■■■■■ 4.28
ZNF48-204ENST00000528032 IQGAP2Q13576 1575 aa41.76■■■■■ 4.27
ZNF48-204ENST00000528032 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.71■■■■■ 4.27
ZNF48-204ENST00000528032 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.63■■■■■ 4.25
ZNF48-204ENST00000528032 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.52■■■■■ 4.24
ZNF48-204ENST00000528032 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.52■■■■■ 4.24
ZNF48-204ENST00000528032 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
ZNF48-204ENST00000528032 KIF21BO75037 1637 aa41.43■■■■■ 4.22
ZNF48-204ENST00000528032 DISP1Q96F81 1524 aa41.43■■■■■ 4.22
ZNF48-204ENST00000528032 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.37■■■■■ 4.21
ZNF48-204ENST00000528032 KIAA0556O60303 1618 aa41.36■■■■■ 4.21
ZNF48-204ENST00000528032 PTPRGP23470 1445 aa41.33■■■■■ 4.21
ZNF48-204ENST00000528032 GOLGA3Q08378 1498 aa41.3■■■■■ 4.2
ZNF48-204ENST00000528032 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.24■■■■■ 4.19
ZNF48-204ENST00000528032 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
ZNF48-204ENST00000528032 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
ZNF48-204ENST00000528032 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.09■■■■■ 4.17
ZNF48-204ENST00000528032 SAMD9Q5K651 1589 aa41.08■■■■■ 4.17
ZNF48-204ENST00000528032 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.08■■■■■ 4.17
ZNF48-204ENST00000528032 UACAQ9BZF9 1416 aa41.07■■■■■ 4.16
ZNF48-204ENST00000528032 ABCC2Q92887 1545 aa41.03■■■■■ 4.16
ZNF48-204ENST00000528032 MAPKBP1O60336 1514 aa41.03■■■■■ 4.16
ZNF48-204ENST00000528032 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
ZNF48-204ENST00000528032 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.91■■■■■ 4.14
ZNF48-204ENST00000528032 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.89■■■■■ 4.14
ZNF48-204ENST00000528032 ABCA8O94911 1581 aa40.89■■■■■ 4.14
ZNF48-204ENST00000528032 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.89■■■■■ 4.14
ZNF48-204ENST00000528032 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.87■■■■■ 4.13
ZNF48-204ENST00000528032 P3H3Q8IVL6 736 aa40.86■■■■■ 4.13
ZNF48-204ENST00000528032 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
ZNF48-204ENST00000528032 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.81■■■■■ 4.12
ZNF48-204ENST00000528032 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.8■■■■■ 4.12
ZNF48-204ENST00000528032 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
ZNF48-204ENST00000528032 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.76■■■■■ 4.12
ZNF48-204ENST00000528032 DIP2BQ9P265 1576 aa40.76■■■■■ 4.12
ZNF48-204ENST00000528032 ASXL2Q76L83 1435 aa40.72■■■■■ 4.11
ZNF48-204ENST00000528032 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.68■■■■■ 4.1
ZNF48-204ENST00000528032 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.64■■■■■ 4.1
ZNF48-204ENST00000528032 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.63■■■■■ 4.09
ZNF48-204ENST00000528032 GLI2P10070 1586 aa40.55■■■■■ 4.08
ZNF48-204ENST00000528032 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.54■■■■■ 4.08
ZNF48-204ENST00000528032 ATP10BO94823 1461 aa40.51■■■■■ 4.07
ZNF48-204ENST00000528032 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.07
ZNF48-204ENST00000528032 FMN1Q68DA7 1419 aa40.5■■■■■ 4.07
ZNF48-204ENST00000528032 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
ZNF48-204ENST00000528032 ARID3CA6NKF2 412 aa40.4■■■■■ 4.06
ZNF48-204ENST00000528032 CLIP1P30622 1438 aa40.37■■■■■ 4.05
ZNF48-204ENST00000528032 TSPOAP1O95153 1857 aa40.36■■■■■ 4.05
ZNF48-204ENST00000528032 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.35■■■■■ 4.05
ZNF48-204ENST00000528032 HECW1Q76N89 1606 aa40.34■■■■■ 4.05
ZNF48-204ENST00000528032 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
ZNF48-204ENST00000528032 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
ZNF48-204ENST00000528032 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
ZNF48-204ENST00000528032 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.26■■■■■ 4.04
ZNF48-204ENST00000528032 KCNH8Q96L42 1107 aa40.24■■■■■ 4.03
ZNF48-204ENST00000528032 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
ZNF48-204ENST00000528032 CEP162Q5TB80 1403 aa40.18■■■■■ 4.02
ZNF48-204ENST00000528032 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.18■■■■■ 4.02
ZNF48-204ENST00000528032 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.16■■■■■ 4.02
ZNF48-204ENST00000528032 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
ZNF48-204ENST00000528032 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.14■■■■■ 4.02
ZNF48-204ENST00000528032 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.14■■■■■ 4.02
ZNF48-204ENST00000528032 CD109Q6YHK3 1445 aa40.14■■■■■ 4.02
ZNF48-204ENST00000528032 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
ZNF48-204ENST00000528032 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.11■■■■■ 4.01
ZNF48-204ENST00000528032 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.11■■■■■ 4.01
ZNF48-204ENST00000528032 KDM6BO15054 1643 aa40.1■■■■■ 4.01
ZNF48-204ENST00000528032 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.1■■■■■ 4.01
ZNF48-204ENST00000528032 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.08■■■■■ 4.01
ZNF48-204ENST00000528032 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.06■■■■■ 4
ZNF48-204ENST00000528032 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
ZNF48-204ENST00000528032 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.98
ZNF48-204ENST00000528032 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
ZNF48-204ENST00000528032 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.89■■■■□ 3.98
ZNF48-204ENST00000528032 KIF14Q15058 1648 aa39.86■■■■□ 3.97
ZNF48-204ENST00000528032 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.83■■■■□ 3.97
ZNF48-204ENST00000528032 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
ZNF48-204ENST00000528032 NEO1Q92859 1461 aa39.81■■■■□ 3.96
ZNF48-204ENST00000528032 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.76■■■■□ 3.96
ZNF48-204ENST00000528032 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.76■■■■□ 3.95
ZNF48-204ENST00000528032 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.73■■■■□ 3.95
ZNF48-204ENST00000528032 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.71■■■■□ 3.95
ZNF48-204ENST00000528032 FANCAO15360 1455 aa39.69■■■■□ 3.94
ZNF48-204ENST00000528032 PLCH2O75038 1416 aa39.69■■■■□ 3.94
ZNF48-204ENST00000528032 AKNAQ7Z591 1439 aa39.61■■■■□ 3.93
ZNF48-204ENST00000528032 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.57■■■■□ 3.92
ZNF48-204ENST00000528032 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.55■■■■□ 3.92
ZNF48-204ENST00000528032 PREX2Q70Z35 1606 aa39.53■■■■□ 3.92
ZNF48-204ENST00000528032 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.52■■■■□ 3.92
ZNF48-204ENST00000528032 TIAM1Q13009 1591 aa39.51■■■■□ 3.92
ZNF48-204ENST00000528032 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.51■■■■□ 3.92
ZNF48-204ENST00000528032 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
ZNF48-204ENST00000528032 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.5■■■■□ 3.91
ZNF48-204ENST00000528032 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.5■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms