RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527987.1

SIGIRR-210, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene SIGIRR, Length 803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-210ENST00000527987 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.01■■■□□ 2.72
SIGIRR-210ENST00000527987 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.98■■■□□ 2.71
SIGIRR-210ENST00000527987 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
SIGIRR-210ENST00000527987 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.92■■■□□ 2.7
SIGIRR-210ENST00000527987 IQGAP2Q13576 1575 aa31.92■■■□□ 2.7
SIGIRR-210ENST00000527987 PRXQ9BXM0 1461 aa31.91■■■□□ 2.7
SIGIRR-210ENST00000527987 JPH4Q96JJ6 628 aa31.87■■■□□ 2.69
SIGIRR-210ENST00000527987 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.82■■■□□ 2.68
SIGIRR-210ENST00000527987 EEA1Q15075 1411 aa31.78■■■□□ 2.68
SIGIRR-210ENST00000527987 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
SIGIRR-210ENST00000527987 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.73■■■□□ 2.67
SIGIRR-210ENST00000527987 DISP1Q96F81 1524 aa31.7■■■□□ 2.66
SIGIRR-210ENST00000527987 KIAA0556O60303 1618 aa31.66■■■□□ 2.66
SIGIRR-210ENST00000527987 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.65■■■□□ 2.66
SIGIRR-210ENST00000527987 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.65■■■□□ 2.66
SIGIRR-210ENST00000527987 KIF21BO75037 1637 aa31.64■■■□□ 2.66
SIGIRR-210ENST00000527987 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.58■■■□□ 2.65
SIGIRR-210ENST00000527987 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
SIGIRR-210ENST00000527987 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.52■■■□□ 2.64
SIGIRR-210ENST00000527987 PTPRGP23470 1445 aa31.48■■■□□ 2.63
SIGIRR-210ENST00000527987 SAMD9Q5K651 1589 aa31.45■■■□□ 2.63
SIGIRR-210ENST00000527987 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.43■■■□□ 2.62
SIGIRR-210ENST00000527987 GOLGA3Q08378 1498 aa31.43■■■□□ 2.62
SIGIRR-210ENST00000527987 MAPKBP1O60336 1514 aa31.4■■■□□ 2.62
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCC2Q92887 1545 aa31.38■■■□□ 2.61
SIGIRR-210ENST00000527987 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.37■■■□□ 2.61
SIGIRR-210ENST00000527987 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
SIGIRR-210ENST00000527987 UACAQ9BZF9 1416 aa31.32■■■□□ 2.6
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCA8O94911 1581 aa31.3■■■□□ 2.6
SIGIRR-210ENST00000527987 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
SIGIRR-210ENST00000527987 DIP2BQ9P265 1576 aa31.27■■■□□ 2.6
SIGIRR-210ENST00000527987 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.27■■■□□ 2.6
SIGIRR-210ENST00000527987 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.24■■■□□ 2.59
SIGIRR-210ENST00000527987 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
SIGIRR-210ENST00000527987 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.2■■■□□ 2.59
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.2■■■□□ 2.58
SIGIRR-210ENST00000527987 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.13■■■□□ 2.57
SIGIRR-210ENST00000527987 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.12■■■□□ 2.57
SIGIRR-210ENST00000527987 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.12■■■□□ 2.57
SIGIRR-210ENST00000527987 ASXL2Q76L83 1435 aa31.11■■■□□ 2.57
SIGIRR-210ENST00000527987 P3H3Q8IVL6 736 aa31.11■■■□□ 2.57
SIGIRR-210ENST00000527987 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.08■■■□□ 2.57
SIGIRR-210ENST00000527987 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SIGIRR-210ENST00000527987 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
SIGIRR-210ENST00000527987 TSPOAP1O95153 1857 aa31.03■■■□□ 2.56
SIGIRR-210ENST00000527987 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.02■■■□□ 2.56
SIGIRR-210ENST00000527987 GLI2P10070 1586 aa31.02■■■□□ 2.56
SIGIRR-210ENST00000527987 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
SIGIRR-210ENST00000527987 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
SIGIRR-210ENST00000527987 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.97■■■□□ 2.55
SIGIRR-210ENST00000527987 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
SIGIRR-210ENST00000527987 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.96■■■□□ 2.55
SIGIRR-210ENST00000527987 ATP10BO94823 1461 aa30.93■■■□□ 2.54
SIGIRR-210ENST00000527987 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.84■■■□□ 2.53
SIGIRR-210ENST00000527987 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.84■■■□□ 2.53
SIGIRR-210ENST00000527987 HECW1Q76N89 1606 aa30.81■■■□□ 2.52
SIGIRR-210ENST00000527987 ARID3CA6NKF2 412 aa30.81■■■□□ 2.52
SIGIRR-210ENST00000527987 FMN1Q68DA7 1419 aa30.8■■■□□ 2.52
SIGIRR-210ENST00000527987 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
SIGIRR-210ENST00000527987 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.74■■■□□ 2.51
SIGIRR-210ENST00000527987 KDM6BO15054 1643 aa30.73■■■□□ 2.51
SIGIRR-210ENST00000527987 CLIP1P30622 1438 aa30.72■■■□□ 2.51
SIGIRR-210ENST00000527987 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.63■■■□□ 2.49
SIGIRR-210ENST00000527987 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.63■■■□□ 2.49
SIGIRR-210ENST00000527987 KCNH8Q96L42 1107 aa30.61■■■□□ 2.49
SIGIRR-210ENST00000527987 CEP162Q5TB80 1403 aa30.6■■■□□ 2.49
SIGIRR-210ENST00000527987 CD109Q6YHK3 1445 aa30.6■■■□□ 2.49
SIGIRR-210ENST00000527987 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.6■■■□□ 2.49
SIGIRR-210ENST00000527987 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.58■■■□□ 2.49
SIGIRR-210ENST00000527987 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.57■■■□□ 2.48
SIGIRR-210ENST00000527987 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
SIGIRR-210ENST00000527987 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
SIGIRR-210ENST00000527987 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.54■■■□□ 2.489e-8■■■□□ 16.1
SIGIRR-210ENST00000527987 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
SIGIRR-210ENST00000527987 KIF14Q15058 1648 aa30.52■■■□□ 2.48
SIGIRR-210ENST00000527987 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
SIGIRR-210ENST00000527987 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.5■■■□□ 2.47
SIGIRR-210ENST00000527987 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.48■■■□□ 2.47
SIGIRR-210ENST00000527987 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.45■■■□□ 2.47
SIGIRR-210ENST00000527987 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
SIGIRR-210ENST00000527987 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.43■■■□□ 2.46
SIGIRR-210ENST00000527987 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SIGIRR-210ENST00000527987 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.38■■■□□ 2.45
SIGIRR-210ENST00000527987 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.37■■■□□ 2.45
SIGIRR-210ENST00000527987 NEO1Q92859 1461 aa30.37■■■□□ 2.45
SIGIRR-210ENST00000527987 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.35■■■□□ 2.45
SIGIRR-210ENST00000527987 RICTORQ6R327 1708 aa30.3■■■□□ 2.44
SIGIRR-210ENST00000527987 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.3■■■□□ 2.44
SIGIRR-210ENST00000527987 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.3■■■□□ 2.44
SIGIRR-210ENST00000527987 FANCAO15360 1455 aa30.29■■■□□ 2.44
SIGIRR-210ENST00000527987 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.28■■■□□ 2.44
SIGIRR-210ENST00000527987 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
SIGIRR-210ENST00000527987 PREX2Q70Z35 1606 aa30.28■■■□□ 2.44
SIGIRR-210ENST00000527987 PLCH2O75038 1416 aa30.25■■■□□ 2.43
SIGIRR-210ENST00000527987 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.25■■■□□ 2.43
SIGIRR-210ENST00000527987 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.23■■■□□ 2.43
SIGIRR-210ENST00000527987 AKNAQ7Z591 1439 aa30.2■■■□□ 2.42
SIGIRR-210ENST00000527987 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.18■■■□□ 2.42
SIGIRR-210ENST00000527987 TIAM1Q13009 1591 aa30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms