RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527987.1

SIGIRR-210, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene SIGIRR, Length 803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-210ENST00000527987 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.35■■■■■ 5.01
SIGIRR-210ENST00000527987 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.39■■■■■ 4.22
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCC9O60706 1549 aa40.37■■■■■ 4.05
SIGIRR-210ENST00000527987 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.85■■■■□ 3.81
SIGIRR-210ENST00000527987 NACADO15069 1562 aa38.78■■■■□ 3.8
SIGIRR-210ENST00000527987 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
SIGIRR-210ENST00000527987 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.54■■■■□ 3.76
SIGIRR-210ENST00000527987 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.41■■■■□ 3.74
SIGIRR-210ENST00000527987 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.38■■■■□ 3.73
SIGIRR-210ENST00000527987 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.25■■■■□ 3.71
SIGIRR-210ENST00000527987 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.8■■■■□ 3.64
SIGIRR-210ENST00000527987 SCRIBQ14160 1630 aa37.69■■■■□ 3.62
SIGIRR-210ENST00000527987 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.63■■■■□ 3.61
SIGIRR-210ENST00000527987 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.6■■■■□ 3.61
SIGIRR-210ENST00000527987 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.29■■■■□ 3.56
SIGIRR-210ENST00000527987 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
SIGIRR-210ENST00000527987 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.62■■■■□ 3.45
SIGIRR-210ENST00000527987 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.27■■■■□ 3.4
SIGIRR-210ENST00000527987 SMARCA4P51532 1647 aa36.06■■■■□ 3.36
SIGIRR-210ENST00000527987 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
SIGIRR-210ENST00000527987 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.78■■■■□ 3.32
SIGIRR-210ENST00000527987 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.75■■■■□ 3.31
SIGIRR-210ENST00000527987 SMARCA2P51531 1590 aa35.74■■■■□ 3.31
SIGIRR-210ENST00000527987 NCAPD3P42695 1498 aa35.73■■■■□ 3.31
SIGIRR-210ENST00000527987 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.72■■■■□ 3.31
SIGIRR-210ENST00000527987 HMGXB3Q12766 1538 aa35.67■■■■□ 3.3
SIGIRR-210ENST00000527987 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
SIGIRR-210ENST00000527987 WIZO95785 1651 aa35.43■■■■□ 3.26
SIGIRR-210ENST00000527987 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
SIGIRR-210ENST00000527987 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
SIGIRR-210ENST00000527987 NESP48681 1621 aa34.98■■■■□ 3.19
SIGIRR-210ENST00000527987 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.88■■■■□ 3.17
SIGIRR-210ENST00000527987 ERCC6Q03468 1493 aa34.74■■■■□ 3.15
SIGIRR-210ENST00000527987 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.71■■■■□ 3.15
SIGIRR-210ENST00000527987 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.63■■■■□ 3.13
SIGIRR-210ENST00000527987 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
SIGIRR-210ENST00000527987 CUX2O14529 1486 aa34.56■■■■□ 3.12
SIGIRR-210ENST00000527987 PRDM2Q13029 1718 aa34.51■■■■□ 3.12
SIGIRR-210ENST00000527987 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.5■■■■□ 3.11
SIGIRR-210ENST00000527987 CFTRP13569 1480 aa34.5■■■■□ 3.11
SIGIRR-210ENST00000527987 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.49■■■■□ 3.11
SIGIRR-210ENST00000527987 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.31■■■■□ 3.08
SIGIRR-210ENST00000527987 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.27■■■■□ 3.08
SIGIRR-210ENST00000527987 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.26■■■■□ 3.07
SIGIRR-210ENST00000527987 WDR62O43379 1518 aa34.23■■■■□ 3.07
SIGIRR-210ENST00000527987 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.21■■■■□ 3.07
SIGIRR-210ENST00000527987 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
SIGIRR-210ENST00000527987 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
SIGIRR-210ENST00000527987 TOPBP1Q92547 1522 aa33.79■■■■□ 3
SIGIRR-210ENST00000527987 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.79■■■■□ 3
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCC8Q09428 1581 aa33.68■■■□□ 2.98
SIGIRR-210ENST00000527987 CUX1P39880 1505 aa33.56■■■□□ 2.96
SIGIRR-210ENST00000527987 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
SIGIRR-210ENST00000527987 IFT140Q96RY7 1462 aa33.53■■■□□ 2.96
SIGIRR-210ENST00000527987 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
SIGIRR-210ENST00000527987 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
SIGIRR-210ENST00000527987 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
SIGIRR-210ENST00000527987 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.41■■■□□ 2.94
SIGIRR-210ENST00000527987 WDR97A6NE52 1622 aa33.35■■■□□ 2.93
SIGIRR-210ENST00000527987 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.32■■■□□ 2.92
SIGIRR-210ENST00000527987 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.32■■■□□ 2.92
SIGIRR-210ENST00000527987 SYNJ1O43426 1573 aa33.29■■■□□ 2.92
SIGIRR-210ENST00000527987 TOP2BQ02880 1626 aa33.26■■■□□ 2.91
SIGIRR-210ENST00000527987 SOGA1O94964 1423 aa33.23■■■□□ 2.91
SIGIRR-210ENST00000527987 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.19■■■□□ 2.9
SIGIRR-210ENST00000527987 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.18■■■□□ 2.95e-7■■■■■ 27.5
SIGIRR-210ENST00000527987 OSCARQ8IYS5 282 aa33.1■■■□□ 2.89
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.08■■■□□ 2.89
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.07■■■□□ 2.89
SIGIRR-210ENST00000527987 PBRM1Q86U86 1689 aa33.07■■■□□ 2.89
SIGIRR-210ENST00000527987 CHD1O14646 1710 aa33.07■■■□□ 2.88
SIGIRR-210ENST00000527987 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
SIGIRR-210ENST00000527987 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.93■■■□□ 2.86
SIGIRR-210ENST00000527987 GRIN2BQ13224 1484 aa32.92■■■□□ 2.86
SIGIRR-210ENST00000527987 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.91■■■□□ 2.86
SIGIRR-210ENST00000527987 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
SIGIRR-210ENST00000527987 TRIM41Q8WV44 630 aa32.78■■■□□ 2.84
SIGIRR-210ENST00000527987 ADAMTS12P58397 1594 aa32.75■■■□□ 2.83
SIGIRR-210ENST00000527987 SYNJ2O15056 1496 aa32.74■■■□□ 2.83
SIGIRR-210ENST00000527987 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.68■■■□□ 2.82
SIGIRR-210ENST00000527987 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.64■■■□□ 2.82
SIGIRR-210ENST00000527987 FBLN2P98095 1184 aa32.61■■■□□ 2.81
SIGIRR-210ENST00000527987 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.61■■■□□ 2.81
SIGIRR-210ENST00000527987 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.61■■■□□ 2.81
SIGIRR-210ENST00000527987 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.61■■■□□ 2.81
SIGIRR-210ENST00000527987 GRIN2AQ12879 1464 aa32.54■■■□□ 2.8
SIGIRR-210ENST00000527987 ARHGEF11O15085 1522 aa32.54■■■□□ 2.8
SIGIRR-210ENST00000527987 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
SIGIRR-210ENST00000527987 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.51■■■□□ 2.79
SIGIRR-210ENST00000527987 CEP170Q5SW79 1584 aa32.48■■■□□ 2.79
SIGIRR-210ENST00000527987 KIF27Q86VH2 1401 aa32.45■■■□□ 2.79
SIGIRR-210ENST00000527987 CUL7Q14999 1698 aa32.44■■■□□ 2.78
SIGIRR-210ENST00000527987 NUP160Q12769 1436 aa32.41■■■□□ 2.78
SIGIRR-210ENST00000527987 IGF1RP08069 1367 aa32.34■■■□□ 2.77
SIGIRR-210ENST00000527987 SHROOM2Q13796 1616 aa32.29■■■□□ 2.76
SIGIRR-210ENST00000527987 ARAP1Q96P48 1450 aa32.29■■■□□ 2.76
SIGIRR-210ENST00000527987 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.29■■■□□ 2.76
SIGIRR-210ENST00000527987 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.29■■■□□ 2.76
SIGIRR-210ENST00000527987 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.19■■■□□ 2.74
SIGIRR-210ENST00000527987 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.12■■■□□ 2.73
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