RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526290.1

TSTA3-204, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-204ENST00000526290 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.9■■■□□ 2.22
TSTA3-204ENST00000526290 CUL7Q14999 1698 aa28.9■■■□□ 2.22
TSTA3-204ENST00000526290 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.87■■■□□ 2.21
TSTA3-204ENST00000526290 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.85■■■□□ 2.21
TSTA3-204ENST00000526290 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
TSTA3-204ENST00000526290 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
TSTA3-204ENST00000526290 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.6■■■□□ 2.17
TSTA3-204ENST00000526290 PTPRGP23470 1445 aa28.6■■■□□ 2.17
TSTA3-204ENST00000526290 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.59■■■□□ 2.17
TSTA3-204ENST00000526290 IQGAP2Q13576 1575 aa28.58■■■□□ 2.17
TSTA3-204ENST00000526290 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.58■■■□□ 2.17
TSTA3-204ENST00000526290 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.53■■■□□ 2.16
TSTA3-204ENST00000526290 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.53■■■□□ 2.16
TSTA3-204ENST00000526290 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.52■■■□□ 2.16
TSTA3-204ENST00000526290 MAPKBP1O60336 1514 aa28.48■■■□□ 2.15
TSTA3-204ENST00000526290 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.47■■■□□ 2.15
TSTA3-204ENST00000526290 DISP1Q96F81 1524 aa28.43■■■□□ 2.14
TSTA3-204ENST00000526290 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.4■■■□□ 2.14
TSTA3-204ENST00000526290 DIP2BQ9P265 1576 aa28.37■■■□□ 2.13
TSTA3-204ENST00000526290 ABCC2Q92887 1545 aa28.36■■■□□ 2.13
TSTA3-204ENST00000526290 UACAQ9BZF9 1416 aa28.35■■■□□ 2.13
TSTA3-204ENST00000526290 PRXQ9BXM0 1461 aa28.34■■■□□ 2.13
TSTA3-204ENST00000526290 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.33■■■□□ 2.13
TSTA3-204ENST00000526290 KIAA0556O60303 1618 aa28.3■■■□□ 2.12
TSTA3-204ENST00000526290 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.29■■■□□ 2.12
TSTA3-204ENST00000526290 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.27■■■□□ 2.12
TSTA3-204ENST00000526290 ASXL2Q76L83 1435 aa28.26■■■□□ 2.12
TSTA3-204ENST00000526290 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TSTA3-204ENST00000526290 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.24■■■□□ 2.11
TSTA3-204ENST00000526290 GOLGA3Q08378 1498 aa28.23■■■□□ 2.11
TSTA3-204ENST00000526290 TSPOAP1O95153 1857 aa28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-204ENST00000526290 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-204ENST00000526290 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-204ENST00000526290 P3H3Q8IVL6 736 aa28.11■■■□□ 2.09
TSTA3-204ENST00000526290 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TSTA3-204ENST00000526290 GLI2P10070 1586 aa28.11■■■□□ 2.09
TSTA3-204ENST00000526290 KDM6BO15054 1643 aa28.1■■■□□ 2.09
TSTA3-204ENST00000526290 EEA1Q15075 1411 aa28.09■■■□□ 2.09
TSTA3-204ENST00000526290 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
TSTA3-204ENST00000526290 ABCA8O94911 1581 aa28.03■■■□□ 2.08
TSTA3-204ENST00000526290 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28■■■□□ 2.07
TSTA3-204ENST00000526290 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
TSTA3-204ENST00000526290 KCNH8Q96L42 1107 aa27.99■■■□□ 2.07
TSTA3-204ENST00000526290 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
TSTA3-204ENST00000526290 ARID3CA6NKF2 412 aa27.96■■■□□ 2.07
TSTA3-204ENST00000526290 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.96■■■□□ 2.07
TSTA3-204ENST00000526290 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.92■■■□□ 2.06
TSTA3-204ENST00000526290 SAMD9Q5K651 1589 aa27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-204ENST00000526290 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-204ENST00000526290 ATP10BO94823 1461 aa27.86■■■□□ 2.05
TSTA3-204ENST00000526290 CD109Q6YHK3 1445 aa27.85■■■□□ 2.05
TSTA3-204ENST00000526290 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TSTA3-204ENST00000526290 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.83■■■□□ 2.05
TSTA3-204ENST00000526290 KIF21BO75037 1637 aa27.82■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.8■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.79■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.78■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.78■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.77■■■□□ 2.04
TSTA3-204ENST00000526290 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
TSTA3-204ENST00000526290 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.68■■■□□ 2.02
TSTA3-204ENST00000526290 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.64■■■□□ 2.02
TSTA3-204ENST00000526290 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.61■■■□□ 2.01
TSTA3-204ENST00000526290 ADGRL1O94910 1474 aa27.58■■■□□ 2.01
TSTA3-204ENST00000526290 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.56■■■□□ 2
TSTA3-204ENST00000526290 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
TSTA3-204ENST00000526290 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.55■■■□□ 2
TSTA3-204ENST00000526290 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.5■■□□□ 1.99
TSTA3-204ENST00000526290 RAPGEF3O95398 923 aa27.49■■□□□ 1.99
TSTA3-204ENST00000526290 FMN1Q68DA7 1419 aa27.49■■□□□ 1.99
TSTA3-204ENST00000526290 NEO1Q92859 1461 aa27.48■■□□□ 1.99
TSTA3-204ENST00000526290 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TSTA3-204ENST00000526290 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
TSTA3-204ENST00000526290 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TSTA3-204ENST00000526290 HECW1Q76N89 1606 aa27.38■■□□□ 1.97
TSTA3-204ENST00000526290 AKNAQ7Z591 1439 aa27.35■■□□□ 1.97
TSTA3-204ENST00000526290 FANCAO15360 1455 aa27.35■■□□□ 1.97
TSTA3-204ENST00000526290 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.35■■□□□ 1.97
TSTA3-204ENST00000526290 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TSTA3-204ENST00000526290 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.29■■□□□ 1.96
TSTA3-204ENST00000526290 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.28■■□□□ 1.96
TSTA3-204ENST00000526290 PLCH2O75038 1416 aa27.27■■□□□ 1.96
TSTA3-204ENST00000526290 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
TSTA3-204ENST00000526290 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.23■■□□□ 1.95
TSTA3-204ENST00000526290 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
TSTA3-204ENST00000526290 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.21■■□□□ 1.95
TSTA3-204ENST00000526290 RICTORQ6R327 1708 aa27.21■■□□□ 1.95
TSTA3-204ENST00000526290 CLIP1P30622 1438 aa27.2■■□□□ 1.94
TSTA3-204ENST00000526290 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-204ENST00000526290 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-204ENST00000526290 KIF14Q15058 1648 aa27.18■■□□□ 1.94
TSTA3-204ENST00000526290 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.16■■□□□ 1.94
TSTA3-204ENST00000526290 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TSTA3-204ENST00000526290 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.14■■□□□ 1.94
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.13■■□□□ 1.93
TSTA3-204ENST00000526290 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.13■■□□□ 1.93
TSTA3-204ENST00000526290 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms