RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526117.5

LMX1B-203, Transcript of LIM homeobox transcription factor 1 beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMX1B, Length 1,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMX1B-203ENST00000526117 PRXQ9BXM0 1461 aa29.01■■■□□ 2.23
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LMX1B-203ENST00000526117 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.9■■■□□ 2.22
LMX1B-203ENST00000526117 JPH4Q96JJ6 628 aa28.86■■■□□ 2.21
LMX1B-203ENST00000526117 IQGAP2Q13576 1575 aa28.84■■■□□ 2.21
LMX1B-203ENST00000526117 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.82■■■□□ 2.2
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LMX1B-203ENST00000526117 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.73■■■□□ 2.19
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LMX1B-203ENST00000526117 PTPRGP23470 1445 aa28.49■■■□□ 2.15
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LMX1B-203ENST00000526117 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.72■■■□□ 2.03
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LMX1B-203ENST00000526117 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.67■■■□□ 2.02
LMX1B-203ENST00000526117 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.66■■■□□ 2.02
LMX1B-203ENST00000526117 KCNH8Q96L42 1107 aa27.65■■■□□ 2.02
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LMX1B-203ENST00000526117 KIF14Q15058 1648 aa27.54■■■□□ 2
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LMX1B-203ENST00000526117 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
LMX1B-203ENST00000526117 FANCAO15360 1455 aa27.38■■□□□ 1.97
LMX1B-203ENST00000526117 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.36■■□□□ 1.97
LMX1B-203ENST00000526117 PREX2Q70Z35 1606 aa27.33■■□□□ 1.97
LMX1B-203ENST00000526117 AKNAQ7Z591 1439 aa27.31■■□□□ 1.96
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LMX1B-203ENST00000526117 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.26■■□□□ 1.95
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