RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 SHROOM2Q13796 1616 aa30.81■■■□□ 2.52
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PTPRK-218ENST00000525459 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.61■■■□□ 2.49
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PTPRK-218ENST00000525459 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.2■■■□□ 2.27
PTPRK-218ENST00000525459 NCOA2Q15596 1464 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRK-218ENST00000525459 PLCH2O75038 1416 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPRK-218ENST00000525459 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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PTPRK-218ENST00000525459 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.14■■■□□ 2.25
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