RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525334.5

TSPAN4-215, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN4, Length 860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-215ENST00000525334 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.45■■■□□ 2.63
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TSPAN4-215ENST00000525334 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
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TSPAN4-215ENST00000525334 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.11■■■□□ 2.57
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TSPAN4-215ENST00000525334 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.03■■■□□ 2.56
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TSPAN4-215ENST00000525334 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.82■■■□□ 2.52
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TSPAN4-215ENST00000525334 ARID3CA6NKF2 412 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPAN4-215ENST00000525334 ATP10BO94823 1461 aa30.38■■■□□ 2.45
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TSPAN4-215ENST00000525334 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.05■■■□□ 2.4
TSPAN4-215ENST00000525334 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
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TSPAN4-215ENST00000525334 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.87■■■□□ 2.37
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TSPAN4-215ENST00000525334 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
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TSPAN4-215ENST00000525334 ADGRL1O94910 1474 aa29.61■■■□□ 2.33
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TSPAN4-215ENST00000525334 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.59■■■□□ 2.33
TSPAN4-215ENST00000525334 PREX2Q70Z35 1606 aa29.57■■■□□ 2.32
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