RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523270.1

CNOT8-223, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, human

TSL 4

Gene CNOT8, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT8-223	ENST00000523270	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.89	■■■■□ 3.18
CNOT8-223	ENST00000523270	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.88	■■■■□ 3.17
CNOT8-223	ENST00000523270	JPH4	Q96JJ6	628 aa		34.88	■■■■□ 3.17
CNOT8-223	ENST00000523270	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		34.82	■■■■□ 3.16
CNOT8-223	ENST00000523270	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.7	■■■■□ 3.15
CNOT8-223	ENST00000523270	PRX	Q9BXM0	1461 aa		34.68	■■■■□ 3.14
CNOT8-223	ENST00000523270	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.62	■■■■□ 3.13
CNOT8-223	ENST00000523270	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		34.59	■■■■□ 3.13
CNOT8-223	ENST00000523270	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		34.52	■■■■□ 3.12
CNOT8-223	ENST00000523270	DISP1	Q96F81	1524 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CNOT8-223	ENST00000523270	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CNOT8-223	ENST00000523270	EEA1	Q15075	1411 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CNOT8-223	ENST00000523270	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	34.48	■■■■□ 3.11
CNOT8-223	ENST00000523270	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CNOT8-223	ENST00000523270	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CNOT8-223	ENST00000523270	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	34.44	■■■■□ 3.1
CNOT8-223	ENST00000523270	KIAA0556	O60303	1618 aa		34.41	■■■■□ 3.1
CNOT8-223	ENST00000523270	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		34.4	■■■■□ 3.1
CNOT8-223	ENST00000523270	PTPRG	P23470	1445 aa		34.39	■■■■□ 3.1
CNOT8-223	ENST00000523270	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	34.38	■■■■□ 3.09
CNOT8-223	ENST00000523270	KIF21B	O75037	1637 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CNOT8-223	ENST00000523270	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CNOT8-223	ENST00000523270	GOLGA3	Q08378	1498 aa		34.21	■■■■□ 3.07
CNOT8-223	ENST00000523270	MAPKBP1	O60336	1514 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CNOT8-223	ENST00000523270	UACA	Q9BZF9	1416 aa		34.18	■■■■□ 3.06
CNOT8-223	ENST00000523270	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		34.17	■■■■□ 3.06
CNOT8-223	ENST00000523270	ABCC2	Q92887	1545 aa		34.17	■■■■□ 3.06
CNOT8-223	ENST00000523270	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	34.16	■■■■□ 3.06
CNOT8-223	ENST00000523270	SAMD9	Q5K651	1589 aa		34.12	■■■■□ 3.05
CNOT8-223	ENST00000523270	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		34.08	■■■■□ 3.05
CNOT8-223	ENST00000523270	DIP2B	Q9P265	1576 aa		34.07	■■■■□ 3.05
CNOT8-223	ENST00000523270	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		34.07	■■■■□ 3.04
CNOT8-223	ENST00000523270	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		34.07	■■■■□ 3.04
CNOT8-223	ENST00000523270	P3H3	Q8IVL6	736 aa		34.05	■■■■□ 3.04
CNOT8-223	ENST00000523270	ABCA8	O94911	1581 aa		34.04	■■■■□ 3.04
CNOT8-223	ENST00000523270	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		34.03	■■■■□ 3.04
CNOT8-223	ENST00000523270	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	34.02	■■■■□ 3.04
CNOT8-223	ENST00000523270	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	34	■■■■□ 3.03
CNOT8-223	ENST00000523270	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.97	■■■■□ 3.03
CNOT8-223	ENST00000523270	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.96	■■■■□ 3.03
CNOT8-223	ENST00000523270	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CNOT8-223	ENST00000523270	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
CNOT8-223	ENST00000523270	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.85	■■■■□ 3.01
CNOT8-223	ENST00000523270	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.84	■■■■□ 3.01
CNOT8-223	ENST00000523270	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.82	■■■■□ 3
CNOT8-223	ENST00000523270	GLI2	P10070	1586 aa		33.79	■■■■□ 3
CNOT8-223	ENST00000523270	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
CNOT8-223	ENST00000523270	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.76	■■■□□ 2.99
CNOT8-223	ENST00000523270	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.76	■■■□□ 2.99
CNOT8-223	ENST00000523270	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
CNOT8-223	ENST00000523270	ATP10B	O94823	1461 aa		33.73	■■■□□ 2.99
CNOT8-223	ENST00000523270	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.72	■■■□□ 2.99
CNOT8-223	ENST00000523270	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
CNOT8-223	ENST00000523270	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CNOT8-223	ENST00000523270	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CNOT8-223	ENST00000523270	KDM6B	O15054	1643 aa		33.54	■■■□□ 2.96
CNOT8-223	ENST00000523270	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.53	■■■□□ 2.96
CNOT8-223	ENST00000523270	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CNOT8-223	ENST00000523270	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
CNOT8-223	ENST00000523270	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
CNOT8-223	ENST00000523270	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
CNOT8-223	ENST00000523270	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CNOT8-223	ENST00000523270	CD109	Q6YHK3	1445 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CNOT8-223	ENST00000523270	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CNOT8-223	ENST00000523270	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CNOT8-223	ENST00000523270	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CNOT8-223	ENST00000523270	CLIP1	P30622	1438 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CNOT8-223	ENST00000523270	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CNOT8-223	ENST00000523270	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
CNOT8-223	ENST00000523270	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
CNOT8-223	ENST00000523270	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
CNOT8-223	ENST00000523270	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CNOT8-223	ENST00000523270	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CNOT8-223	ENST00000523270	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		33.26	■■■□□ 2.91
CNOT8-223	ENST00000523270	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	33.25	■■■□□ 2.91
CNOT8-223	ENST00000523270	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CNOT8-223	ENST00000523270	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CNOT8-223	ENST00000523270	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CNOT8-223	ENST00000523270	KIF14	Q15058	1648 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CNOT8-223	ENST00000523270	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CNOT8-223	ENST00000523270	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CNOT8-223	ENST00000523270	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
CNOT8-223	ENST00000523270	NEO1	Q92859	1461 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CNOT8-223	ENST00000523270	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
CNOT8-223	ENST00000523270	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CNOT8-223	ENST00000523270	FANCA	O15360	1455 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CNOT8-223	ENST00000523270	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CNOT8-223	ENST00000523270	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.01	■■■□□ 2.88
CNOT8-223	ENST00000523270	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		33	■■■□□ 2.87
CNOT8-223	ENST00000523270	PLCH2	O75038	1416 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CNOT8-223	ENST00000523270	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CNOT8-223	ENST00000523270	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CNOT8-223	ENST00000523270	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CNOT8-223	ENST00000523270	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CNOT8-223	ENST00000523270	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CNOT8-223	ENST00000523270	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CNOT8-223	ENST00000523270	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CNOT8-223	ENST00000523270	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CNOT8-223	ENST00000523270	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CNOT8-223	ENST00000523270	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.85	■■■□□ 2.85

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