RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522519.5

MSC-AS1-208, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 1,537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-208ENST00000522519 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.11■■□□□ 1.77
MSC-AS1-208ENST00000522519 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.09■■□□□ 1.77
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARHGEF11O15085 1522 aa26.08■■□□□ 1.77
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIF21BO75037 1637 aa26.07■■□□□ 1.76
MSC-AS1-208ENST00000522519 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.04■■□□□ 1.76
MSC-AS1-208ENST00000522519 IQGAP2Q13576 1575 aa26.01■■□□□ 1.75
MSC-AS1-208ENST00000522519 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.95■■□□□ 1.74
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARAP1Q96P48 1450 aa25.88■■□□□ 1.73
MSC-AS1-208ENST00000522519 JPH4Q96JJ6 628 aa25.88■■□□□ 1.73
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MSC-AS1-208ENST00000522519 GOLGA3Q08378 1498 aa25.84■■□□□ 1.73
MSC-AS1-208ENST00000522519 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.84■■□□□ 1.73
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIAA0556O60303 1618 aa25.77■■□□□ 1.72
MSC-AS1-208ENST00000522519 DISP1Q96F81 1524 aa25.76■■□□□ 1.71
MSC-AS1-208ENST00000522519 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.73■■□□□ 1.71
MSC-AS1-208ENST00000522519 SAMD9Q5K651 1589 aa25.71■■□□□ 1.71
MSC-AS1-208ENST00000522519 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.68■■□□□ 1.7
MSC-AS1-208ENST00000522519 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.68■■□□□ 1.7
MSC-AS1-208ENST00000522519 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
MSC-AS1-208ENST00000522519 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.62■■□□□ 1.69
MSC-AS1-208ENST00000522519 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.6■■□□□ 1.69
MSC-AS1-208ENST00000522519 PTPRGP23470 1445 aa25.56■■□□□ 1.68
MSC-AS1-208ENST00000522519 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.56■■□□□ 1.68
MSC-AS1-208ENST00000522519 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
MSC-AS1-208ENST00000522519 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.46■■□□□ 1.67
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCC2Q92887 1545 aa25.46■■□□□ 1.67
MSC-AS1-208ENST00000522519 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.46■■□□□ 1.67
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCA8O94911 1581 aa25.46■■□□□ 1.67
MSC-AS1-208ENST00000522519 P3H3Q8IVL6 736 aa25.44■■□□□ 1.66
MSC-AS1-208ENST00000522519 UACAQ9BZF9 1416 aa25.43■■□□□ 1.66
MSC-AS1-208ENST00000522519 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.43■■□□□ 1.66
MSC-AS1-208ENST00000522519 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.41■■□□□ 1.66
MSC-AS1-208ENST00000522519 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.4■■□□□ 1.66
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MSC-AS1-208ENST00000522519 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.37■■□□□ 1.65
MSC-AS1-208ENST00000522519 CLIP1P30622 1438 aa25.35■■□□□ 1.65
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAPKBP1O60336 1514 aa25.33■■□□□ 1.64
MSC-AS1-208ENST00000522519 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
MSC-AS1-208ENST00000522519 CEP162Q5TB80 1403 aa25.31■■□□□ 1.64
MSC-AS1-208ENST00000522519 FMN1Q68DA7 1419 aa25.28■■□□□ 1.64
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.27■■□□□ 1.64
MSC-AS1-208ENST00000522519 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.25■■□□□ 1.63
MSC-AS1-208ENST00000522519 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
MSC-AS1-208ENST00000522519 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
MSC-AS1-208ENST00000522519 HECW1Q76N89 1606 aa25.24■■□□□ 1.63
MSC-AS1-208ENST00000522519 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MSC-AS1-208ENST00000522519 DIP2BQ9P265 1576 aa25.18■■□□□ 1.62
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATP10BO94823 1461 aa25.16■■□□□ 1.62
MSC-AS1-208ENST00000522519 ASXL2Q76L83 1435 aa25.16■■□□□ 1.62
MSC-AS1-208ENST00000522519 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.12■■□□□ 1.61
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.11■■□□□ 1.61
MSC-AS1-208ENST00000522519 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.11■■□□□ 1.61
MSC-AS1-208ENST00000522519 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
MSC-AS1-208ENST00000522519 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.1■■□□□ 1.61
MSC-AS1-208ENST00000522519 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARID3CA6NKF2 412 aa25.08■■□□□ 1.61
MSC-AS1-208ENST00000522519 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
MSC-AS1-208ENST00000522519 GLI2P10070 1586 aa25.06■■□□□ 1.6
MSC-AS1-208ENST00000522519 TSPOAP1O95153 1857 aa25.04■■□□□ 1.6
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.03■■□□□ 1.6
MSC-AS1-208ENST00000522519 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.01■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.01■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.96■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.95■■□□□ 1.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.89■■□□□ 1.58
MSC-AS1-208ENST00000522519 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.89■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIF14Q15058 1648 aa24.89■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 KCNH8Q96L42 1107 aa24.87■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 TIAM1Q13009 1591 aa24.87■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.87■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.84■■□□□ 1.57
MSC-AS1-208ENST00000522519 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.79■■□□□ 1.56
MSC-AS1-208ENST00000522519 CD109Q6YHK3 1445 aa24.79■■□□□ 1.56
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAP3K1Q13233 1512 aa24.79■■□□□ 1.56
MSC-AS1-208ENST00000522519 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.77■■□□□ 1.56
MSC-AS1-208ENST00000522519 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.76■■□□□ 1.55
MSC-AS1-208ENST00000522519 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
MSC-AS1-208ENST00000522519 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.73■■□□□ 1.55
MSC-AS1-208ENST00000522519 PREX2Q70Z35 1606 aa24.72■■□□□ 1.55
MSC-AS1-208ENST00000522519 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.72■■□□□ 1.55
MSC-AS1-208ENST00000522519 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.71■■□□□ 1.55
MSC-AS1-208ENST00000522519 KDM6BO15054 1643 aa24.7■■□□□ 1.54
MSC-AS1-208ENST00000522519 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.69■■□□□ 1.54
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.68■■□□□ 1.54
MSC-AS1-208ENST00000522519 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.66■■□□□ 1.54
MSC-AS1-208ENST00000522519 PLCH2O75038 1416 aa24.63■■□□□ 1.53
MSC-AS1-208ENST00000522519 NEO1Q92859 1461 aa24.63■■□□□ 1.53
MSC-AS1-208ENST00000522519 FANCAO15360 1455 aa24.62■■□□□ 1.53
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.6■■□□□ 1.53
MSC-AS1-208ENST00000522519 APLP2Q06481 763 aa24.6■■□□□ 1.53
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