RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522497.1

CHTF8-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF8, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF8-209ENST00000522497 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.63■■■■■ 4.25
CHTF8-209ENST00000522497 CUL7Q14999 1698 aa41.59■■■■■ 4.25
CHTF8-209ENST00000522497 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.52■■■■■ 4.24
CHTF8-209ENST00000522497 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.5■■■■■ 4.23
CHTF8-209ENST00000522497 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.27■■■■■ 4.2
CHTF8-209ENST00000522497 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.15■■■■■ 4.18
CHTF8-209ENST00000522497 PTPRGP23470 1445 aa41.13■■■■■ 4.17
CHTF8-209ENST00000522497 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.12■■■■■ 4.17
CHTF8-209ENST00000522497 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.12■■■■■ 4.17
CHTF8-209ENST00000522497 IQGAP2Q13576 1575 aa41.12■■■■■ 4.17
CHTF8-209ENST00000522497 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.09■■■■■ 4.17
CHTF8-209ENST00000522497 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
CHTF8-209ENST00000522497 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.06■■■■■ 4.16
CHTF8-209ENST00000522497 MAPKBP1O60336 1514 aa41.06■■■■■ 4.16
CHTF8-209ENST00000522497 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.04■■■■■ 4.16
CHTF8-209ENST00000522497 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.02■■■■■ 4.16
CHTF8-209ENST00000522497 DISP1Q96F81 1524 aa40.93■■■■■ 4.14
CHTF8-209ENST00000522497 DIP2BQ9P265 1576 aa40.88■■■■■ 4.13
CHTF8-209ENST00000522497 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.88■■■■■ 4.13
CHTF8-209ENST00000522497 ABCC2Q92887 1545 aa40.83■■■■■ 4.13
CHTF8-209ENST00000522497 UACAQ9BZF9 1416 aa40.79■■■■■ 4.12
CHTF8-209ENST00000522497 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.78■■■■■ 4.12
CHTF8-209ENST00000522497 PRXQ9BXM0 1461 aa40.75■■■■■ 4.11
CHTF8-209ENST00000522497 KIAA0556O60303 1618 aa40.72■■■■■ 4.11
CHTF8-209ENST00000522497 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.69■■■■■ 4.1
CHTF8-209ENST00000522497 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
CHTF8-209ENST00000522497 ASXL2Q76L83 1435 aa40.68■■■■■ 4.1
CHTF8-209ENST00000522497 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.65■■■■■ 4.1
CHTF8-209ENST00000522497 GOLGA3Q08378 1498 aa40.6■■■■■ 4.09
CHTF8-209ENST00000522497 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.59■■■■■ 4.09
CHTF8-209ENST00000522497 TSPOAP1O95153 1857 aa40.59■■■■■ 4.09
CHTF8-209ENST00000522497 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.58■■■■■ 4.09
CHTF8-209ENST00000522497 GLI2P10070 1586 aa40.5■■■■■ 4.07
CHTF8-209ENST00000522497 KDM6BO15054 1643 aa40.48■■■■■ 4.07
CHTF8-209ENST00000522497 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
CHTF8-209ENST00000522497 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
CHTF8-209ENST00000522497 EEA1Q15075 1411 aa40.38■■■■■ 4.05
CHTF8-209ENST00000522497 ABCA8O94911 1581 aa40.35■■■■■ 4.05
CHTF8-209ENST00000522497 P3H3Q8IVL6 736 aa40.35■■■■■ 4.05
CHTF8-209ENST00000522497 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
CHTF8-209ENST00000522497 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
CHTF8-209ENST00000522497 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.3■■■■■ 4.04
CHTF8-209ENST00000522497 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.27■■■■■ 4.04
CHTF8-209ENST00000522497 KCNH8Q96L42 1107 aa40.2■■■■■ 4.03
CHTF8-209ENST00000522497 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.18■■■■■ 4.02
CHTF8-209ENST00000522497 SAMD9Q5K651 1589 aa40.15■■■■■ 4.02
CHTF8-209ENST00000522497 ARID3CA6NKF2 412 aa40.13■■■■■ 4.01
CHTF8-209ENST00000522497 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
CHTF8-209ENST00000522497 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
CHTF8-209ENST00000522497 ATP10BO94823 1461 aa40.07■■■■■ 4.01
CHTF8-209ENST00000522497 CD109Q6YHK3 1445 aa40.07■■■■■ 4
CHTF8-209ENST00000522497 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.05■■■■■ 4
CHTF8-209ENST00000522497 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.03■■■■■ 4
CHTF8-209ENST00000522497 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.01■■■■■ 4
CHTF8-209ENST00000522497 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40■■■■□ 3.99
CHTF8-209ENST00000522497 KIF21BO75037 1637 aa39.99■■■■□ 3.99
CHTF8-209ENST00000522497 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.96■■■■□ 3.99
CHTF8-209ENST00000522497 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.94■■■■□ 3.98
CHTF8-209ENST00000522497 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
CHTF8-209ENST00000522497 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
CHTF8-209ENST00000522497 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.85■■■■□ 3.97
CHTF8-209ENST00000522497 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
CHTF8-209ENST00000522497 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
CHTF8-209ENST00000522497 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.81■■■■□ 3.96
CHTF8-209ENST00000522497 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.76■■■■□ 3.95
CHTF8-209ENST00000522497 ADGRL1O94910 1474 aa39.74■■■■□ 3.95
CHTF8-209ENST00000522497 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.71■■■■□ 3.95
CHTF8-209ENST00000522497 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.69■■■■□ 3.94
CHTF8-209ENST00000522497 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.67■■■■□ 3.94
CHTF8-209ENST00000522497 NEO1Q92859 1461 aa39.56■■■■□ 3.92
CHTF8-209ENST00000522497 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.53■■■■□ 3.92
CHTF8-209ENST00000522497 RAPGEF3O95398 923 aa39.52■■■■□ 3.92
CHTF8-209ENST00000522497 FMN1Q68DA7 1419 aa39.5■■■■□ 3.91
CHTF8-209ENST00000522497 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
CHTF8-209ENST00000522497 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
CHTF8-209ENST00000522497 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.43■■■■□ 3.91e-5■■■■□ 25.8
CHTF8-209ENST00000522497 HECW1Q76N89 1606 aa39.36■■■■□ 3.89
CHTF8-209ENST00000522497 AKNAQ7Z591 1439 aa39.35■■■■□ 3.89
CHTF8-209ENST00000522497 FANCAO15360 1455 aa39.35■■■■□ 3.89
CHTF8-209ENST00000522497 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.34■■■■□ 3.89
CHTF8-209ENST00000522497 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
CHTF8-209ENST00000522497 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.32■■■■□ 3.88
CHTF8-209ENST00000522497 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
CHTF8-209ENST00000522497 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.28■■■■□ 3.88
CHTF8-209ENST00000522497 PLCH2O75038 1416 aa39.23■■■■□ 3.87
CHTF8-209ENST00000522497 RICTORQ6R327 1708 aa39.19■■■■□ 3.86
CHTF8-209ENST00000522497 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
CHTF8-209ENST00000522497 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
CHTF8-209ENST00000522497 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.13■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.11■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 CLIP1P30622 1438 aa39.1■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.1■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.1■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.09■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 KIF14Q15058 1648 aa39.09■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.09■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.08■■■■□ 3.85
CHTF8-209ENST00000522497 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.06■■■■□ 3.84
CHTF8-209ENST00000522497 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.06■■■■□ 3.84
CHTF8-209ENST00000522497 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms