RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521836.1

TCEA1-209, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-209ENST00000521836 CUL7Q14999 1698 aa41.95■■■■■ 4.31
TCEA1-209ENST00000521836 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.91■■■■■ 4.3
TCEA1-209ENST00000521836 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.85■■■■■ 4.29
TCEA1-209ENST00000521836 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.77■■■■■ 4.28
TCEA1-209ENST00000521836 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.72■■■■■ 4.27
TCEA1-209ENST00000521836 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.52■■■■■ 4.24
TCEA1-209ENST00000521836 PTPRGP23470 1445 aa41.45■■■■■ 4.23
TCEA1-209ENST00000521836 MAPKBP1O60336 1514 aa41.44■■■■■ 4.23
TCEA1-209ENST00000521836 IQGAP2Q13576 1575 aa41.43■■■■■ 4.22
TCEA1-209ENST00000521836 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.42■■■■■ 4.22
TCEA1-209ENST00000521836 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.41■■■■■ 4.22
TCEA1-209ENST00000521836 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.39■■■■■ 4.22
TCEA1-209ENST00000521836 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.39■■■■■ 4.22
TCEA1-209ENST00000521836 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.39■■■■■ 4.22
TCEA1-209ENST00000521836 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.38■■■■■ 4.21
TCEA1-209ENST00000521836 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
TCEA1-209ENST00000521836 DIP2BQ9P265 1576 aa41.2■■■■■ 4.19
TCEA1-209ENST00000521836 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
TCEA1-209ENST00000521836 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.18■■■■■ 4.18
TCEA1-209ENST00000521836 ABCC2Q92887 1545 aa41.17■■■■■ 4.18
TCEA1-209ENST00000521836 DISP1Q96F81 1524 aa41.16■■■■■ 4.18
TCEA1-209ENST00000521836 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.15■■■■■ 4.18
TCEA1-209ENST00000521836 UACAQ9BZF9 1416 aa41.12■■■■■ 4.17
TCEA1-209ENST00000521836 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.05■■■■■ 4.16
TCEA1-209ENST00000521836 KIAA0556O60303 1618 aa41■■■■■ 4.15
TCEA1-209ENST00000521836 GOLGA3Q08378 1498 aa40.99■■■■■ 4.15
TCEA1-209ENST00000521836 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.98■■■■■ 4.15
TCEA1-209ENST00000521836 PRXQ9BXM0 1461 aa40.98■■■■■ 4.15
TCEA1-209ENST00000521836 ASXL2Q76L83 1435 aa40.98■■■■■ 4.15
TCEA1-209ENST00000521836 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.92■■■■■ 4.14
TCEA1-209ENST00000521836 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
TCEA1-209ENST00000521836 GLI2P10070 1586 aa40.88■■■■■ 4.13
TCEA1-209ENST00000521836 TSPOAP1O95153 1857 aa40.87■■■■■ 4.13
TCEA1-209ENST00000521836 KDM6BO15054 1643 aa40.85■■■■■ 4.13
TCEA1-209ENST00000521836 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.8■■■■■ 4.12
TCEA1-209ENST00000521836 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
TCEA1-209ENST00000521836 EEA1Q15075 1411 aa40.73■■■■■ 4.11
TCEA1-209ENST00000521836 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
TCEA1-209ENST00000521836 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.64■■■■■ 4.1
TCEA1-209ENST00000521836 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.64■■■■■ 4.1
TCEA1-209ENST00000521836 ABCA8O94911 1581 aa40.62■■■■■ 4.09
TCEA1-209ENST00000521836 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.59■■■■■ 4.09
TCEA1-209ENST00000521836 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
TCEA1-209ENST00000521836 P3H3Q8IVL6 736 aa40.47■■■■■ 4.07
TCEA1-209ENST00000521836 KCNH8Q96L42 1107 aa40.45■■■■■ 4.07
TCEA1-209ENST00000521836 SAMD9Q5K651 1589 aa40.4■■■■■ 4.06
TCEA1-209ENST00000521836 CD109Q6YHK3 1445 aa40.4■■■■■ 4.06
TCEA1-209ENST00000521836 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.38■■■■■ 4.05
TCEA1-209ENST00000521836 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.36■■■■■ 4.05
TCEA1-209ENST00000521836 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.33■■■■■ 4.05
TCEA1-209ENST00000521836 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
TCEA1-209ENST00000521836 ATP10BO94823 1461 aa40.31■■■■■ 4.04
TCEA1-209ENST00000521836 KIF21BO75037 1637 aa40.24■■■■■ 4.03
TCEA1-209ENST00000521836 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.24■■■■■ 4.03
TCEA1-209ENST00000521836 ARID3CA6NKF2 412 aa40.24■■■■■ 4.03
TCEA1-209ENST00000521836 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
TCEA1-209ENST00000521836 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
TCEA1-209ENST00000521836 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
TCEA1-209ENST00000521836 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.16■■■■■ 4.02
TCEA1-209ENST00000521836 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.14■■■■■ 4.02
TCEA1-209ENST00000521836 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.12■■■■■ 4.01
TCEA1-209ENST00000521836 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.09■■■■■ 4.01
TCEA1-209ENST00000521836 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.08■■■■■ 4.01
TCEA1-209ENST00000521836 ADGRL1O94910 1474 aa40.07■■■■■ 4.01
TCEA1-209ENST00000521836 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
TCEA1-209ENST00000521836 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.05■■■■■ 4
TCEA1-209ENST00000521836 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.04■■■■■ 4
TCEA1-209ENST00000521836 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
TCEA1-209ENST00000521836 NEO1Q92859 1461 aa39.95■■■■□ 3.99
TCEA1-209ENST00000521836 FMN1Q68DA7 1419 aa39.85■■■■□ 3.97
TCEA1-209ENST00000521836 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.82■■■■□ 3.97
TCEA1-209ENST00000521836 RAPGEF3O95398 923 aa39.75■■■■□ 3.95
TCEA1-209ENST00000521836 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
TCEA1-209ENST00000521836 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.7■■■■□ 3.95
TCEA1-209ENST00000521836 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
TCEA1-209ENST00000521836 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.7■■■■□ 3.95
TCEA1-209ENST00000521836 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.68■■■■□ 3.944e-8■■■■■ 52.5
TCEA1-209ENST00000521836 HECW1Q76N89 1606 aa39.68■■■■□ 3.94
TCEA1-209ENST00000521836 FANCAO15360 1455 aa39.66■■■■□ 3.94
TCEA1-209ENST00000521836 AKNAQ7Z591 1439 aa39.65■■■■□ 3.94
TCEA1-209ENST00000521836 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
TCEA1-209ENST00000521836 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
TCEA1-209ENST00000521836 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.56■■■■□ 3.92
TCEA1-209ENST00000521836 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.55■■■■□ 3.92
TCEA1-209ENST00000521836 PLCH2O75038 1416 aa39.53■■■■□ 3.92
TCEA1-209ENST00000521836 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
TCEA1-209ENST00000521836 RICTORQ6R327 1708 aa39.47■■■■□ 3.91
TCEA1-209ENST00000521836 CLIP1P30622 1438 aa39.47■■■■□ 3.91
TCEA1-209ENST00000521836 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.46■■■■□ 3.91
TCEA1-209ENST00000521836 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.43■■■■□ 3.9
TCEA1-209ENST00000521836 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
TCEA1-209ENST00000521836 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.42■■■■□ 3.9
TCEA1-209ENST00000521836 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.42■■■■□ 3.9
TCEA1-209ENST00000521836 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.41■■■■□ 3.9
TCEA1-209ENST00000521836 KIF14Q15058 1648 aa39.4■■■■□ 3.9
TCEA1-209ENST00000521836 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.4■■■■□ 3.9
TCEA1-209ENST00000521836 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.38■■■■□ 3.89
TCEA1-209ENST00000521836 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.37■■■■□ 3.89
TCEA1-209ENST00000521836 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.37■■■■□ 3.89
TCEA1-209ENST00000521836 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.36■■■■□ 3.89
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