RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 SYNJ2O15056 1496 aa33.01■■■□□ 2.88
CLDN23-201ENST00000519106 GRIN2AQ12879 1464 aa32.99■■■□□ 2.87
CLDN23-201ENST00000519106 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.92■■■□□ 2.86
CLDN23-201ENST00000519106 ARAP1Q96P48 1450 aa32.87■■■□□ 2.85
CLDN23-201ENST00000519106 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.82■■■□□ 2.85
CLDN23-201ENST00000519106 P3H3Q8IVL6 736 aa32.82■■■□□ 2.84
CLDN23-201ENST00000519106 IQGAP2Q13576 1575 aa32.81■■■□□ 2.84
CLDN23-201ENST00000519106 CEP170Q5SW79 1584 aa32.79■■■□□ 2.84
CLDN23-201ENST00000519106 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.78■■■□□ 2.84
CLDN23-201ENST00000519106 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.74■■■□□ 2.83
CLDN23-201ENST00000519106 CHD1O14646 1710 aa32.74■■■□□ 2.83
CLDN23-201ENST00000519106 NUP160Q12769 1436 aa32.73■■■□□ 2.83
CLDN23-201ENST00000519106 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
CLDN23-201ENST00000519106 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.7■■■□□ 2.82
CLDN23-201ENST00000519106 SAMD9Q5K651 1589 aa32.67■■■□□ 2.82
CLDN23-201ENST00000519106 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.62■■■□□ 2.81
CLDN23-201ENST00000519106 APLP2Q06481 763 aa32.56■■■□□ 2.8
CLDN23-201ENST00000519106 JPH4Q96JJ6 628 aa32.56■■■□□ 2.8
CLDN23-201ENST00000519106 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CLDN23-201ENST00000519106 DISP1Q96F81 1524 aa32.51■■■□□ 2.79
CLDN23-201ENST00000519106 FMN1Q68DA7 1419 aa32.5■■■□□ 2.79
CLDN23-201ENST00000519106 KIAA0556O60303 1618 aa32.47■■■□□ 2.79
CLDN23-201ENST00000519106 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
CLDN23-201ENST00000519106 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
CLDN23-201ENST00000519106 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.4■■■□□ 2.78
CLDN23-201ENST00000519106 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.39■■■□□ 2.78
CLDN23-201ENST00000519106 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CLDN23-201ENST00000519106 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.36■■■□□ 2.77
CLDN23-201ENST00000519106 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.36■■■□□ 2.77
CLDN23-201ENST00000519106 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CLDN23-201ENST00000519106 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.33■■■□□ 2.77
CLDN23-201ENST00000519106 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
CLDN23-201ENST00000519106 SHROOM2Q13796 1616 aa32.3■■■□□ 2.76
CLDN23-201ENST00000519106 TIAM1Q13009 1591 aa32.26■■■□□ 2.75
CLDN23-201ENST00000519106 OSCARQ8IYS5 282 aa32.25■■■□□ 2.75
CLDN23-201ENST00000519106 MAP3K1Q13233 1512 aa32.23■■■□□ 2.75
CLDN23-201ENST00000519106 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.18■■■□□ 2.74
CLDN23-201ENST00000519106 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.17■■■□□ 2.74
CLDN23-201ENST00000519106 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.17■■■□□ 2.74
CLDN23-201ENST00000519106 HECW1Q76N89 1606 aa32.16■■■□□ 2.74
CLDN23-201ENST00000519106 ARID3CA6NKF2 412 aa32.14■■■□□ 2.74
CLDN23-201ENST00000519106 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.14■■■□□ 2.74
CLDN23-201ENST00000519106 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.13■■■□□ 2.73
CLDN23-201ENST00000519106 PTPRGP23470 1445 aa32.13■■■□□ 2.73
CLDN23-201ENST00000519106 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.13■■■□□ 2.73
CLDN23-201ENST00000519106 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CLDN23-201ENST00000519106 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.07■■■□□ 2.72
CLDN23-201ENST00000519106 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
CLDN23-201ENST00000519106 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CLDN23-201ENST00000519106 HRCP23327 699 aa32.04■■■□□ 2.72
CLDN23-201ENST00000519106 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.01■■■□□ 2.71
CLDN23-201ENST00000519106 ABCA8O94911 1581 aa32.01■■■□□ 2.71
CLDN23-201ENST00000519106 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CLDN23-201ENST00000519106 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CLDN23-201ENST00000519106 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.93■■■□□ 2.7
CLDN23-201ENST00000519106 UACAQ9BZF9 1416 aa31.92■■■□□ 2.7
CLDN23-201ENST00000519106 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.88■■■□□ 2.69
CLDN23-201ENST00000519106 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.86■■■□□ 2.69
CLDN23-201ENST00000519106 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CLDN23-201ENST00000519106 ATP10BO94823 1461 aa31.84■■■□□ 2.69
CLDN23-201ENST00000519106 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
CLDN23-201ENST00000519106 ABCC2Q92887 1545 aa31.8■■■□□ 2.68
CLDN23-201ENST00000519106 NCOA2Q15596 1464 aa31.79■■■□□ 2.68
CLDN23-201ENST00000519106 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CLDN23-201ENST00000519106 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.74■■■□□ 2.67
CLDN23-201ENST00000519106 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.73■■■□□ 2.67
CLDN23-201ENST00000519106 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
CLDN23-201ENST00000519106 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.71■■■□□ 2.67
CLDN23-201ENST00000519106 ARHGEF11O15085 1522 aa31.69■■■□□ 2.66
CLDN23-201ENST00000519106 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.64■■■□□ 2.66
CLDN23-201ENST00000519106 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.64■■■□□ 2.65
CLDN23-201ENST00000519106 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CLDN23-201ENST00000519106 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.62■■■□□ 2.65
CLDN23-201ENST00000519106 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.61■■■□□ 2.65
CLDN23-201ENST00000519106 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CLDN23-201ENST00000519106 KIF14Q15058 1648 aa31.59■■■□□ 2.65
CLDN23-201ENST00000519106 ITGAEP38570 1179 aa31.58■■■□□ 2.65
CLDN23-201ENST00000519106 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.51■■■□□ 2.63
CLDN23-201ENST00000519106 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.51■■■□□ 2.63
CLDN23-201ENST00000519106 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.51■■■□□ 2.63
CLDN23-201ENST00000519106 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.47■■■□□ 2.63
CLDN23-201ENST00000519106 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.47■■■□□ 2.63
CLDN23-201ENST00000519106 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.47■■■□□ 2.63
CLDN23-201ENST00000519106 KCNH8Q96L42 1107 aa31.47■■■□□ 2.63
CLDN23-201ENST00000519106 MIA2Q96PC5 1412 aa31.46■■■□□ 2.63
CLDN23-201ENST00000519106 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.44■■■□□ 2.62
CLDN23-201ENST00000519106 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CLDN23-201ENST00000519106 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
CLDN23-201ENST00000519106 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CLDN23-201ENST00000519106 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.39■■■□□ 2.62
CLDN23-201ENST00000519106 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CLDN23-201ENST00000519106 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.36■■■□□ 2.61
CLDN23-201ENST00000519106 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CLDN23-201ENST00000519106 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.34■■■□□ 2.61
CLDN23-201ENST00000519106 ASXL2Q76L83 1435 aa31.33■■■□□ 2.61
CLDN23-201ENST00000519106 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.32■■■□□ 2.6
CLDN23-201ENST00000519106 PTPRKQ15262 1439 aa31.27■■■□□ 2.6
CLDN23-201ENST00000519106 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms