RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.82■■□□□ 1.4
MSC-AS1-204ENST00000518916 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARHGEF11O15085 1522 aa23.82■■□□□ 1.4
MSC-AS1-204ENST00000518916 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.8■■□□□ 1.4
MSC-AS1-204ENST00000518916 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.78■■□□□ 1.4
MSC-AS1-204ENST00000518916 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.72■■□□□ 1.39
MSC-AS1-204ENST00000518916 GRIN2AQ12879 1464 aa23.71■■□□□ 1.39
MSC-AS1-204ENST00000518916 NUP160Q12769 1436 aa23.67■■□□□ 1.38
MSC-AS1-204ENST00000518916 CEP162Q5TB80 1403 aa23.65■■□□□ 1.38
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARAP1Q96P48 1450 aa23.61■■□□□ 1.37
MSC-AS1-204ENST00000518916 CEP170Q5SW79 1584 aa23.57■■□□□ 1.36
MSC-AS1-204ENST00000518916 CLIP1P30622 1438 aa23.56■■□□□ 1.36
MSC-AS1-204ENST00000518916 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.55■■□□□ 1.36
MSC-AS1-204ENST00000518916 IQGAP2Q13576 1575 aa23.55■■□□□ 1.36
MSC-AS1-204ENST00000518916 SHROOM2Q13796 1616 aa23.51■■□□□ 1.35
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.5■■□□□ 1.35
MSC-AS1-204ENST00000518916 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
MSC-AS1-204ENST00000518916 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.48■■□□□ 1.35
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.41■■□□□ 1.34
MSC-AS1-204ENST00000518916 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.4■■□□□ 1.34
MSC-AS1-204ENST00000518916 SAMD9Q5K651 1589 aa23.4■■□□□ 1.34
MSC-AS1-204ENST00000518916 JPH4Q96JJ6 628 aa23.39■■□□□ 1.33
MSC-AS1-204ENST00000518916 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.38■■□□□ 1.33
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
MSC-AS1-204ENST00000518916 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.31■■□□□ 1.32
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIAA0556O60303 1618 aa23.3■■□□□ 1.32
MSC-AS1-204ENST00000518916 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.28■■□□□ 1.32
MSC-AS1-204ENST00000518916 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.27■■□□□ 1.32
MSC-AS1-204ENST00000518916 DISP1Q96F81 1524 aa23.25■■□□□ 1.31
MSC-AS1-204ENST00000518916 P3H3Q8IVL6 736 aa23.24■■□□□ 1.31
MSC-AS1-204ENST00000518916 FMN1Q68DA7 1419 aa23.23■■□□□ 1.31
MSC-AS1-204ENST00000518916 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
MSC-AS1-204ENST00000518916 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.13■■□□□ 1.29
MSC-AS1-204ENST00000518916 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.1■■□□□ 1.29
MSC-AS1-204ENST00000518916 APLP2Q06481 763 aa23.09■■□□□ 1.29
MSC-AS1-204ENST00000518916 HECW1Q76N89 1606 aa23.08■■□□□ 1.28
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
MSC-AS1-204ENST00000518916 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.04■■□□□ 1.28
MSC-AS1-204ENST00000518916 PTPRGP23470 1445 aa23.03■■□□□ 1.28
MSC-AS1-204ENST00000518916 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.01■■□□□ 1.27
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADCY10Q96PN6 1610 aa23■■□□□ 1.27
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAP3K1Q13233 1512 aa22.99■■□□□ 1.27
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
MSC-AS1-204ENST00000518916 TIAM1Q13009 1591 aa22.98■■□□□ 1.27
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAPKBP1O60336 1514 aa22.98■■□□□ 1.27
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCA8O94911 1581 aa22.97■■□□□ 1.27
MSC-AS1-204ENST00000518916 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.94■■□□□ 1.26
MSC-AS1-204ENST00000518916 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
MSC-AS1-204ENST00000518916 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MSC-AS1-204ENST00000518916 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MSC-AS1-204ENST00000518916 UACAQ9BZF9 1416 aa22.89■■□□□ 1.25
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCC2Q92887 1545 aa22.88■■□□□ 1.25
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.88■■□□□ 1.25
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.87■■□□□ 1.25
MSC-AS1-204ENST00000518916 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
MSC-AS1-204ENST00000518916 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.84■■□□□ 1.25
MSC-AS1-204ENST00000518916 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.82■■□□□ 1.24
MSC-AS1-204ENST00000518916 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.82■■□□□ 1.24
MSC-AS1-204ENST00000518916 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.8■■□□□ 1.24
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARID3CA6NKF2 412 aa22.79■■□□□ 1.24
MSC-AS1-204ENST00000518916 DIP2BQ9P265 1576 aa22.79■■□□□ 1.24
MSC-AS1-204ENST00000518916 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
MSC-AS1-204ENST00000518916 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
MSC-AS1-204ENST00000518916 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
MSC-AS1-204ENST00000518916 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.75■■□□□ 1.23
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATP10BO94823 1461 aa22.74■■□□□ 1.23
MSC-AS1-204ENST00000518916 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
MSC-AS1-204ENST00000518916 ASXL2Q76L83 1435 aa22.73■■□□□ 1.23
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.72■■□□□ 1.23
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MSC-AS1-204ENST00000518916 GLI2P10070 1586 aa22.71■■□□□ 1.23
MSC-AS1-204ENST00000518916 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIF14Q15058 1648 aa22.64■■□□□ 1.22
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.64■■□□□ 1.21
MSC-AS1-204ENST00000518916 NCOA2Q15596 1464 aa22.63■■□□□ 1.21
MSC-AS1-204ENST00000518916 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.58■■□□□ 1.2
MSC-AS1-204ENST00000518916 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.56■■□□□ 1.2
MSC-AS1-204ENST00000518916 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.55■■□□□ 1.2
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.53■■□□□ 1.2
MSC-AS1-204ENST00000518916 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
MSC-AS1-204ENST00000518916 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.53■■□□□ 1.2
MSC-AS1-204ENST00000518916 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.5■■□□□ 1.19
MSC-AS1-204ENST00000518916 TSPOAP1O95153 1857 aa22.5■■□□□ 1.19
MSC-AS1-204ENST00000518916 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.49■■□□□ 1.19
MSC-AS1-204ENST00000518916 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.48■■□□□ 1.19
MSC-AS1-204ENST00000518916 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.44■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.44■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.44■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 MIA2Q96PC5 1412 aa22.44■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.43■■□□□ 1.18
MSC-AS1-204ENST00000518916 KDM6BO15054 1643 aa22.43■■□□□ 1.18
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