RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 SHROOM2Q13796 1616 aa23.98■■□□□ 1.43
PDGFRB-202ENST00000517488 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PDGFRB-202ENST00000517488 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.93■■□□□ 1.42
PDGFRB-202ENST00000517488 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.85■■□□□ 1.41
PDGFRB-202ENST00000517488 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PDGFRB-202ENST00000517488 PRXQ9BXM0 1461 aa23.75■■□□□ 1.39
PDGFRB-202ENST00000517488 IQGAP2Q13576 1575 aa23.71■■□□□ 1.39
PDGFRB-202ENST00000517488 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.71■■□□□ 1.39
PDGFRB-202ENST00000517488 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.71■■□□□ 1.39
PDGFRB-202ENST00000517488 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.67■■□□□ 1.38
PDGFRB-202ENST00000517488 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PDGFRB-202ENST00000517488 PTPRGP23470 1445 aa23.66■■□□□ 1.38
PDGFRB-202ENST00000517488 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.64■■□□□ 1.37
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PDGFRB-202ENST00000517488 DISP1Q96F81 1524 aa23.63■■□□□ 1.37
PDGFRB-202ENST00000517488 EEA1Q15075 1411 aa23.61■■□□□ 1.37
PDGFRB-202ENST00000517488 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.61■■□□□ 1.37
PDGFRB-202ENST00000517488 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
PDGFRB-202ENST00000517488 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.56■■□□□ 1.36
PDGFRB-202ENST00000517488 KIAA0556O60303 1618 aa23.5■■□□□ 1.35
PDGFRB-202ENST00000517488 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.48■■□□□ 1.35
PDGFRB-202ENST00000517488 UACAQ9BZF9 1416 aa23.48■■□□□ 1.35
PDGFRB-202ENST00000517488 GOLGA3Q08378 1498 aa23.45■■□□□ 1.34
PDGFRB-202ENST00000517488 MAPKBP1O60336 1514 aa23.44■■□□□ 1.34
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCC2Q92887 1545 aa23.43■■□□□ 1.34
PDGFRB-202ENST00000517488 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.43■■□□□ 1.34
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.43■■□□□ 1.34
PDGFRB-202ENST00000517488 P3H3Q8IVL6 736 aa23.41■■□□□ 1.34
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.41■■□□□ 1.34
PDGFRB-202ENST00000517488 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.37■■□□□ 1.33
PDGFRB-202ENST00000517488 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.36■■□□□ 1.33
PDGFRB-202ENST00000517488 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF21BO75037 1637 aa23.34■■□□□ 1.33
PDGFRB-202ENST00000517488 ASXL2Q76L83 1435 aa23.33■■□□□ 1.33
PDGFRB-202ENST00000517488 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.33■■□□□ 1.33
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.32■■□□□ 1.32
PDGFRB-202ENST00000517488 DIP2BQ9P265 1576 aa23.31■■□□□ 1.32
PDGFRB-202ENST00000517488 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCA8O94911 1581 aa23.27■■□□□ 1.32
PDGFRB-202ENST00000517488 SAMD9Q5K651 1589 aa23.27■■□□□ 1.32
PDGFRB-202ENST00000517488 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.22■■□□□ 1.31
PDGFRB-202ENST00000517488 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PDGFRB-202ENST00000517488 ARID3CA6NKF2 412 aa23.21■■□□□ 1.31
PDGFRB-202ENST00000517488 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PDGFRB-202ENST00000517488 GLI2P10070 1586 aa23.15■■□□□ 1.3
PDGFRB-202ENST00000517488 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.15■■□□□ 1.3
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP10BO94823 1461 aa23.14■■□□□ 1.29
PDGFRB-202ENST00000517488 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.13■■□□□ 1.29
PDGFRB-202ENST00000517488 KCNH8Q96L42 1107 aa23.12■■□□□ 1.29
PDGFRB-202ENST00000517488 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.08■■□□□ 1.28
PDGFRB-202ENST00000517488 TSPOAP1O95153 1857 aa23.07■■□□□ 1.28
PDGFRB-202ENST00000517488 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.05■■□□□ 1.28
PDGFRB-202ENST00000517488 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PDGFRB-202ENST00000517488 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PDGFRB-202ENST00000517488 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PDGFRB-202ENST00000517488 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23■■□□□ 1.27
PDGFRB-202ENST00000517488 CD109Q6YHK3 1445 aa22.99■■□□□ 1.27
PDGFRB-202ENST00000517488 KDM6BO15054 1643 aa22.97■■□□□ 1.27
PDGFRB-202ENST00000517488 FMN1Q68DA7 1419 aa22.96■■□□□ 1.27
PDGFRB-202ENST00000517488 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.95■■□□□ 1.26
PDGFRB-202ENST00000517488 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PDGFRB-202ENST00000517488 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.93■■□□□ 1.26
PDGFRB-202ENST00000517488 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.92■■□□□ 1.26
PDGFRB-202ENST00000517488 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PDGFRB-202ENST00000517488 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.87■■□□□ 1.25
PDGFRB-202ENST00000517488 CLIP1P30622 1438 aa22.86■■□□□ 1.25
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.83■■□□□ 1.25
PDGFRB-202ENST00000517488 HECW1Q76N89 1606 aa22.81■■□□□ 1.24
PDGFRB-202ENST00000517488 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.78■■□□□ 1.24
PDGFRB-202ENST00000517488 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.77■■□□□ 1.24
PDGFRB-202ENST00000517488 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PDGFRB-202ENST00000517488 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PDGFRB-202ENST00000517488 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
PDGFRB-202ENST00000517488 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.74■■□□□ 1.23
PDGFRB-202ENST00000517488 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.72■■□□□ 1.23
PDGFRB-202ENST00000517488 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PDGFRB-202ENST00000517488 NEO1Q92859 1461 aa22.72■■□□□ 1.23
PDGFRB-202ENST00000517488 CEP162Q5TB80 1403 aa22.71■■□□□ 1.23
PDGFRB-202ENST00000517488 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.69■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.69■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 RAPGEF3O95398 923 aa22.69■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.67■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.66■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 FANCAO15360 1455 aa22.65■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.65■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 PLCH2O75038 1416 aa22.65■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 AKNAQ7Z591 1439 aa22.65■■□□□ 1.22
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF14Q15058 1648 aa22.61■■□□□ 1.21
PDGFRB-202ENST00000517488 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
PDGFRB-202ENST00000517488 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.57■■□□□ 1.2
PDGFRB-202ENST00000517488 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.55■■□□□ 1.2
PDGFRB-202ENST00000517488 ADGRL1O94910 1474 aa22.54■■□□□ 1.2
PDGFRB-202ENST00000517488 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.53■■□□□ 1.2
PDGFRB-202ENST00000517488 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.52■■□□□ 1.2
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.49■■□□□ 1.19
PDGFRB-202ENST00000517488 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.48■■□□□ 1.19
PDGFRB-202ENST00000517488 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.47■■□□□ 1.19
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