RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515066.6

AP3S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 3 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 2

Gene AP3S1, Length 1,670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1-208ENST00000515066 FBLN2P98095 1184 aa27.23■■□□□ 1.95
AP3S1-208ENST00000515066 NUP160Q12769 1436 aa27.21■■□□□ 1.95
AP3S1-208ENST00000515066 IQGAP2Q13576 1575 aa27.14■■□□□ 1.93
AP3S1-208ENST00000515066 CEP162Q5TB80 1403 aa27.13■■□□□ 1.93
AP3S1-208ENST00000515066 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.12■■□□□ 1.93
AP3S1-208ENST00000515066 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.03■■□□□ 1.92
AP3S1-208ENST00000515066 CLIP1P30622 1438 aa27.03■■□□□ 1.92
AP3S1-208ENST00000515066 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27■■□□□ 1.91
AP3S1-208ENST00000515066 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
AP3S1-208ENST00000515066 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.98■■□□□ 1.91
AP3S1-208ENST00000515066 SAMD9Q5K651 1589 aa26.98■■□□□ 1.91
AP3S1-208ENST00000515066 SHROOM2Q13796 1616 aa26.96■■□□□ 1.91
AP3S1-208ENST00000515066 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.96■■□□□ 1.91
AP3S1-208ENST00000515066 ARAP1Q96P48 1450 aa26.9■■□□□ 1.9
AP3S1-208ENST00000515066 DISP1Q96F81 1524 aa26.89■■□□□ 1.9
AP3S1-208ENST00000515066 KIAA0556O60303 1618 aa26.88■■□□□ 1.89
AP3S1-208ENST00000515066 JPH4Q96JJ6 628 aa26.88■■□□□ 1.89
AP3S1-208ENST00000515066 OSCARQ8IYS5 282 aa26.87■■□□□ 1.89
AP3S1-208ENST00000515066 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.82■■□□□ 1.88
AP3S1-208ENST00000515066 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
AP3S1-208ENST00000515066 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.78■■□□□ 1.88
AP3S1-208ENST00000515066 P3H3Q8IVL6 736 aa26.78■■□□□ 1.88
AP3S1-208ENST00000515066 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.75■■□□□ 1.87
AP3S1-208ENST00000515066 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.74■■□□□ 1.87
AP3S1-208ENST00000515066 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
AP3S1-208ENST00000515066 FMN1Q68DA7 1419 aa26.65■■□□□ 1.86
AP3S1-208ENST00000515066 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.57■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.56■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.56■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 ARHGEF11O15085 1522 aa26.55■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.54■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 PTPRGP23470 1445 aa26.54■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.53■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 ABCA8O94911 1581 aa26.53■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
AP3S1-208ENST00000515066 HECW1Q76N89 1606 aa26.49■■□□□ 1.83
AP3S1-208ENST00000515066 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.49■■□□□ 1.83
AP3S1-208ENST00000515066 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.49■■□□□ 1.83
AP3S1-208ENST00000515066 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.49■■□□□ 1.83
AP3S1-208ENST00000515066 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
AP3S1-208ENST00000515066 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.45■■□□□ 1.82
AP3S1-208ENST00000515066 TIAM1Q13009 1591 aa26.42■■□□□ 1.82
AP3S1-208ENST00000515066 UACAQ9BZF9 1416 aa26.41■■□□□ 1.82
AP3S1-208ENST00000515066 MAP3K1Q13233 1512 aa26.4■■□□□ 1.82
AP3S1-208ENST00000515066 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
AP3S1-208ENST00000515066 ABCC2Q92887 1545 aa26.39■■□□□ 1.82
AP3S1-208ENST00000515066 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
AP3S1-208ENST00000515066 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
AP3S1-208ENST00000515066 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.36■■□□□ 1.81
AP3S1-208ENST00000515066 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.36■■□□□ 1.81
AP3S1-208ENST00000515066 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.35■■□□□ 1.81
AP3S1-208ENST00000515066 APLP2Q06481 763 aa26.29■■□□□ 1.8
AP3S1-208ENST00000515066 ATP10BO94823 1461 aa26.29■■□□□ 1.8
AP3S1-208ENST00000515066 ARID3CA6NKF2 412 aa26.28■■□□□ 1.8
AP3S1-208ENST00000515066 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.26■■□□□ 1.8
AP3S1-208ENST00000515066 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
AP3S1-208ENST00000515066 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.26■■□□□ 1.79
AP3S1-208ENST00000515066 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.26■■□□□ 1.79
AP3S1-208ENST00000515066 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
AP3S1-208ENST00000515066 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
AP3S1-208ENST00000515066 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.18■■□□□ 1.78
AP3S1-208ENST00000515066 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.18■■□□□ 1.78
AP3S1-208ENST00000515066 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.14■■□□□ 1.78
AP3S1-208ENST00000515066 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
AP3S1-208ENST00000515066 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
AP3S1-208ENST00000515066 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
AP3S1-208ENST00000515066 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
AP3S1-208ENST00000515066 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.09■■□□□ 1.77
AP3S1-208ENST00000515066 KIF14Q15058 1648 aa26.08■■□□□ 1.76
AP3S1-208ENST00000515066 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
AP3S1-208ENST00000515066 NCOA2Q15596 1464 aa26.04■■□□□ 1.76
AP3S1-208ENST00000515066 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.03■■□□□ 1.76
AP3S1-208ENST00000515066 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26■■□□□ 1.75
AP3S1-208ENST00000515066 ASXL2Q76L83 1435 aa26■■□□□ 1.75
AP3S1-208ENST00000515066 MAPKBP1O60336 1514 aa25.98■■□□□ 1.75
AP3S1-208ENST00000515066 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.98■■□□□ 1.75
AP3S1-208ENST00000515066 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
AP3S1-208ENST00000515066 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.95■■□□□ 1.74
AP3S1-208ENST00000515066 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.93■■□□□ 1.74
AP3S1-208ENST00000515066 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.93■■□□□ 1.74
AP3S1-208ENST00000515066 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
AP3S1-208ENST00000515066 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.89■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.88■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.86■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 KCNH8Q96L42 1107 aa25.85■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.85■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 PREX2Q70Z35 1606 aa25.84■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.84■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.83■■□□□ 1.73
AP3S1-208ENST00000515066 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.83■■□□□ 1.72
AP3S1-208ENST00000515066 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
AP3S1-208ENST00000515066 DIP2BQ9P265 1576 aa25.79■■□□□ 1.72
AP3S1-208ENST00000515066 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.78■■□□□ 1.72
AP3S1-208ENST00000515066 MIA2Q96PC5 1412 aa25.78■■□□□ 1.72
AP3S1-208ENST00000515066 GLI2P10070 1586 aa25.75■■□□□ 1.71
AP3S1-208ENST00000515066 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.74■■□□□ 1.71
AP3S1-208ENST00000515066 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
AP3S1-208ENST00000515066 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.72■■□□□ 1.71
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