RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514663.5

PACRGL-232, Transcript of parkin coregulated like, humanhuman

TSL 4

Gene PACRGL, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGL-232ENST00000514663 CUL7Q14999 1698 aa38.94■■■■□ 3.82
PACRGL-232ENST00000514663 JPH4Q96JJ6 628 aa38.91■■■■□ 3.82
PACRGL-232ENST00000514663 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.78■■■■□ 3.8
PACRGL-232ENST00000514663 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.7■■■■□ 3.79
PACRGL-232ENST00000514663 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.56■■■■□ 3.76
PACRGL-232ENST00000514663 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.55■■■■□ 3.76
PACRGL-232ENST00000514663 IQGAP2Q13576 1575 aa38.45■■■■□ 3.75
PACRGL-232ENST00000514663 MAPKBP1O60336 1514 aa38.42■■■■□ 3.74
PACRGL-232ENST00000514663 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.4■■■■□ 3.74
PACRGL-232ENST00000514663 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.34■■■■□ 3.73
PACRGL-232ENST00000514663 PTPRGP23470 1445 aa38.33■■■■□ 3.73
PACRGL-232ENST00000514663 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.32■■■■□ 3.73
PACRGL-232ENST00000514663 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.32■■■■□ 3.72
PACRGL-232ENST00000514663 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.3■■■■□ 3.72
PACRGL-232ENST00000514663 DIP2BQ9P265 1576 aa38.29■■■■□ 3.72
PACRGL-232ENST00000514663 DISP1Q96F81 1524 aa38.28■■■■□ 3.72
PACRGL-232ENST00000514663 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.24■■■■□ 3.71
PACRGL-232ENST00000514663 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.22■■■■□ 3.71
PACRGL-232ENST00000514663 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
PACRGL-232ENST00000514663 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.15■■■■□ 3.7
PACRGL-232ENST00000514663 ABCC2Q92887 1545 aa38.15■■■■□ 3.7
PACRGL-232ENST00000514663 KIAA0556O60303 1618 aa38.13■■■■□ 3.69
PACRGL-232ENST00000514663 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.11■■■■□ 3.69
PACRGL-232ENST00000514663 PRXQ9BXM0 1461 aa38.1■■■■□ 3.69
PACRGL-232ENST00000514663 UACAQ9BZF9 1416 aa38.07■■■■□ 3.69
PACRGL-232ENST00000514663 TSPOAP1O95153 1857 aa38.03■■■■□ 3.68
PACRGL-232ENST00000514663 ASXL2Q76L83 1435 aa37.99■■■■□ 3.67
PACRGL-232ENST00000514663 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.95■■■■□ 3.67
PACRGL-232ENST00000514663 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.94■■■■□ 3.66
PACRGL-232ENST00000514663 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
PACRGL-232ENST00000514663 GLI2P10070 1586 aa37.89■■■■□ 3.66
PACRGL-232ENST00000514663 GOLGA3Q08378 1498 aa37.87■■■■□ 3.65
PACRGL-232ENST00000514663 KDM6BO15054 1643 aa37.86■■■■□ 3.65
PACRGL-232ENST00000514663 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
PACRGL-232ENST00000514663 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
PACRGL-232ENST00000514663 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
PACRGL-232ENST00000514663 ABCA8O94911 1581 aa37.78■■■■□ 3.64
PACRGL-232ENST00000514663 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.77■■■■□ 3.64
PACRGL-232ENST00000514663 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.72■■■■□ 3.63
PACRGL-232ENST00000514663 EEA1Q15075 1411 aa37.67■■■■□ 3.62
PACRGL-232ENST00000514663 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.65■■■■□ 3.62
PACRGL-232ENST00000514663 SAMD9Q5K651 1589 aa37.62■■■■□ 3.61
PACRGL-232ENST00000514663 P3H3Q8IVL6 736 aa37.55■■■■□ 3.6
PACRGL-232ENST00000514663 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
PACRGL-232ENST00000514663 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.5■■■■□ 3.59
PACRGL-232ENST00000514663 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
PACRGL-232ENST00000514663 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.45■■■■□ 3.59
PACRGL-232ENST00000514663 KIF21BO75037 1637 aa37.44■■■■□ 3.58
PACRGL-232ENST00000514663 ATP10BO94823 1461 aa37.43■■■■□ 3.58
PACRGL-232ENST00000514663 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.39■■■■□ 3.58
PACRGL-232ENST00000514663 KCNH8Q96L42 1107 aa37.39■■■■□ 3.58
PACRGL-232ENST00000514663 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.38■■■■□ 3.57
PACRGL-232ENST00000514663 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.38■■■■□ 3.57
PACRGL-232ENST00000514663 CD109Q6YHK3 1445 aa37.37■■■■□ 3.57
PACRGL-232ENST00000514663 ARID3CA6NKF2 412 aa37.36■■■■□ 3.57
PACRGL-232ENST00000514663 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.31■■■■□ 3.56
PACRGL-232ENST00000514663 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.3■■■■□ 3.56
PACRGL-232ENST00000514663 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
PACRGL-232ENST00000514663 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
PACRGL-232ENST00000514663 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.22■■■■□ 3.55
PACRGL-232ENST00000514663 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.22■■■■□ 3.55
PACRGL-232ENST00000514663 ADGRL1O94910 1474 aa37.13■■■■□ 3.54
PACRGL-232ENST00000514663 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.08■■■■□ 3.53
PACRGL-232ENST00000514663 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
PACRGL-232ENST00000514663 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
PACRGL-232ENST00000514663 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.05■■■■□ 3.52
PACRGL-232ENST00000514663 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
PACRGL-232ENST00000514663 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.96■■■■□ 3.51
PACRGL-232ENST00000514663 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.95■■■■□ 3.51
PACRGL-232ENST00000514663 NEO1Q92859 1461 aa36.94■■■■□ 3.5
PACRGL-232ENST00000514663 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
PACRGL-232ENST00000514663 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.91■■■■□ 3.5
PACRGL-232ENST00000514663 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
PACRGL-232ENST00000514663 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.87■■■■□ 3.49
PACRGL-232ENST00000514663 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.86■■■■□ 3.49
PACRGL-232ENST00000514663 FMN1Q68DA7 1419 aa36.85■■■■□ 3.49
PACRGL-232ENST00000514663 RAPGEF3O95398 923 aa36.82■■■■□ 3.48
PACRGL-232ENST00000514663 HECW1Q76N89 1606 aa36.81■■■■□ 3.48
PACRGL-232ENST00000514663 RICTORQ6R327 1708 aa36.74■■■■□ 3.47
PACRGL-232ENST00000514663 FANCAO15360 1455 aa36.74■■■■□ 3.47
PACRGL-232ENST00000514663 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.74■■■■□ 3.47
PACRGL-232ENST00000514663 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.73■■■■□ 3.47
PACRGL-232ENST00000514663 AKNAQ7Z591 1439 aa36.72■■■■□ 3.47
PACRGL-232ENST00000514663 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
PACRGL-232ENST00000514663 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
PACRGL-232ENST00000514663 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.62■■■■□ 3.45
PACRGL-232ENST00000514663 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.62■■■■□ 3.45
PACRGL-232ENST00000514663 KIF14Q15058 1648 aa36.62■■■■□ 3.45
PACRGL-232ENST00000514663 PLCH2O75038 1416 aa36.6■■■■□ 3.45
PACRGL-232ENST00000514663 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.59■■■■□ 3.45
PACRGL-232ENST00000514663 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.58■■■■□ 3.45
PACRGL-232ENST00000514663 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.58■■■■□ 3.45
PACRGL-232ENST00000514663 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
PACRGL-232ENST00000514663 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.56■■■■□ 3.44
PACRGL-232ENST00000514663 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
PACRGL-232ENST00000514663 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
PACRGL-232ENST00000514663 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.51■■■■□ 3.43
PACRGL-232ENST00000514663 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.47■■■■□ 3.43
PACRGL-232ENST00000514663 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.46■■■■□ 3.43
PACRGL-232ENST00000514663 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.46■■■■□ 3.43
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