RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514153.5

FAM149A-215, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene FAM149A, Length 2,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-215ENST00000514153 FBLN2P98095 1184 aa48.35■■■■■ 5.33
FAM149A-215ENST00000514153 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.34■■■■■ 5.33
FAM149A-215ENST00000514153 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa48.29■■■■■ 5.32
FAM149A-215ENST00000514153 ARAP1Q96P48 1450 aa48.23■■■■■ 5.31
FAM149A-215ENST00000514153 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.13■■■■■ 5.3
FAM149A-215ENST00000514153 IQGAP2Q13576 1575 aa48.11■■■■■ 5.29
FAM149A-215ENST00000514153 P3H3Q8IVL6 736 aa48.09■■■■■ 5.29
FAM149A-215ENST00000514153 CEP170Q5SW79 1584 aa48.09■■■■■ 5.29
FAM149A-215ENST00000514153 CHD1O14646 1710 aa48.03■■■■■ 5.28
FAM149A-215ENST00000514153 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.02■■■■■ 5.28
FAM149A-215ENST00000514153 EFCAB5A4FU69 1503 aa48.01■■■■■ 5.28
FAM149A-215ENST00000514153 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
FAM149A-215ENST00000514153 NUP160Q12769 1436 aa47.97■■■■■ 5.27
FAM149A-215ENST00000514153 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.96■■■■■ 5.27
FAM149A-215ENST00000514153 SAMD9Q5K651 1589 aa47.93■■■■■ 5.26
FAM149A-215ENST00000514153 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.82■■■■■ 5.25
FAM149A-215ENST00000514153 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
FAM149A-215ENST00000514153 APLP2Q06481 763 aa47.67■■■■■ 5.22
FAM149A-215ENST00000514153 DISP1Q96F81 1524 aa47.66■■■■■ 5.22
FAM149A-215ENST00000514153 JPH4Q96JJ6 628 aa47.65■■■■■ 5.22
FAM149A-215ENST00000514153 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.63■■■■■ 5.22
FAM149A-215ENST00000514153 KIAA0556O60303 1618 aa47.63■■■■■ 5.22
FAM149A-215ENST00000514153 FMN1Q68DA7 1419 aa47.61■■■■■ 5.21
FAM149A-215ENST00000514153 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.54■■■■■ 5.2
FAM149A-215ENST00000514153 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.47■■■■■ 5.19
FAM149A-215ENST00000514153 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.46■■■■■ 5.19
FAM149A-215ENST00000514153 PCGF6Q9BYE7 350 aa47.46■■■■■ 5.19
FAM149A-215ENST00000514153 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.19
FAM149A-215ENST00000514153 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.43■■■■■ 5.18
FAM149A-215ENST00000514153 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.4■■■■■ 5.18
FAM149A-215ENST00000514153 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.4■■■■■ 5.18
FAM149A-215ENST00000514153 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
FAM149A-215ENST00000514153 SHROOM2Q13796 1616 aa47.36■■■■■ 5.17
FAM149A-215ENST00000514153 TIAM1Q13009 1591 aa47.33■■■■■ 5.17
FAM149A-215ENST00000514153 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa47.25■■■■■ 5.15
FAM149A-215ENST00000514153 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.25■■■■■ 5.15
FAM149A-215ENST00000514153 MAP3K1Q13233 1512 aa47.24■■■■■ 5.15
FAM149A-215ENST00000514153 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.2■■■■■ 5.15
FAM149A-215ENST00000514153 HECW1Q76N89 1606 aa47.18■■■■■ 5.14
FAM149A-215ENST00000514153 OSCARQ8IYS5 282 aa47.14■■■■■ 5.14
FAM149A-215ENST00000514153 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.12■■■■■ 5.13
FAM149A-215ENST00000514153 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa47.12■■■■■ 5.13
FAM149A-215ENST00000514153 ARID3CA6NKF2 412 aa47.12■■■■■ 5.13
FAM149A-215ENST00000514153 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.11■■■■■ 5.13
FAM149A-215ENST00000514153 PTPRGP23470 1445 aa47.04■■■■■ 5.12
FAM149A-215ENST00000514153 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.03■■■■■ 5.12
FAM149A-215ENST00000514153 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
FAM149A-215ENST00000514153 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
FAM149A-215ENST00000514153 CCDC18Q5T9S5 1454 aa47.01■■■■■ 5.12
FAM149A-215ENST00000514153 ABCA8O94911 1581 aa46.94■■■■■ 5.1
FAM149A-215ENST00000514153 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.9■■■■■ 5.1
FAM149A-215ENST00000514153 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.85■■■■■ 5.09
FAM149A-215ENST00000514153 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.83■■■■■ 5.09
FAM149A-215ENST00000514153 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
FAM149A-215ENST00000514153 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.77■■■■■ 5.08
FAM149A-215ENST00000514153 UACAQ9BZF9 1416 aa46.75■■■■■ 5.07
FAM149A-215ENST00000514153 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.72■■■■■ 5.07
FAM149A-215ENST00000514153 ATP10BO94823 1461 aa46.66■■■■■ 5.06
FAM149A-215ENST00000514153 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.65■■■■■ 5.06
FAM149A-215ENST00000514153 NCOA2Q15596 1464 aa46.62■■■■■ 5.05
FAM149A-215ENST00000514153 ABCC2Q92887 1545 aa46.62■■■■■ 5.05
FAM149A-215ENST00000514153 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
FAM149A-215ENST00000514153 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
FAM149A-215ENST00000514153 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.53■■■■■ 5.04
FAM149A-215ENST00000514153 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
FAM149A-215ENST00000514153 ARHGEF11O15085 1522 aa46.48■■■■■ 5.03
FAM149A-215ENST00000514153 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.45■■■■■ 5.03
FAM149A-215ENST00000514153 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.43■■■■■ 5.02
FAM149A-215ENST00000514153 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.39■■■■■ 5.02
FAM149A-215ENST00000514153 MYOM3Q5VTT5 1437 aa46.38■■■■■ 5.02
FAM149A-215ENST00000514153 FGD6Q6ZV73 1430 aa46.37■■■■■ 5.01
FAM149A-215ENST00000514153 KIF14Q15058 1648 aa46.36■■■■■ 5.01
FAM149A-215ENST00000514153 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
FAM149A-215ENST00000514153 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
FAM149A-215ENST00000514153 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.31■■■■■ 5
FAM149A-215ENST00000514153 ITGAEP38570 1179 aa46.28■■■■■ 5
FAM149A-215ENST00000514153 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.19■■■■■ 4.98
FAM149A-215ENST00000514153 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.19■■■■■ 4.98
FAM149A-215ENST00000514153 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.19■■■■■ 4.98
FAM149A-215ENST00000514153 PTPN23Q9H3S7 1636 aa46.17■■■■■ 4.98
FAM149A-215ENST00000514153 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.1■■■■■ 4.97
FAM149A-215ENST00000514153 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP46.1■■■■■ 4.97
FAM149A-215ENST00000514153 MIA2Q96PC5 1412 aa46.09■■■■■ 4.97
FAM149A-215ENST00000514153 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.08■■■■■ 4.97
FAM149A-215ENST00000514153 KCNH8Q96L42 1107 aa46.07■■■■■ 4.96
FAM149A-215ENST00000514153 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.05■■■■■ 4.96
FAM149A-215ENST00000514153 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.04■■■■■ 4.96
FAM149A-215ENST00000514153 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
FAM149A-215ENST00000514153 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.02■■■■■ 4.96
FAM149A-215ENST00000514153 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
FAM149A-215ENST00000514153 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.97■■■■■ 4.95
FAM149A-215ENST00000514153 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
FAM149A-215ENST00000514153 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.96■■■■■ 4.95
FAM149A-215ENST00000514153 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.96■■■■■ 4.95
FAM149A-215ENST00000514153 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.93■■■■■ 4.94
FAM149A-215ENST00000514153 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
FAM149A-215ENST00000514153 ASXL2Q76L83 1435 aa45.9■■■■■ 4.94
FAM149A-215ENST00000514153 PTPRKQ15262 1439 aa45.87■■■■■ 4.93
FAM149A-215ENST00000514153 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa45.85■■■■■ 4.93
FAM149A-215ENST00000514153 PREX2Q70Z35 1606 aa45.82■■■■■ 4.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms