RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513678.5

MATR3-222, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-222	ENST00000513678	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
MATR3-222	ENST00000513678	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.25	■■■□□ 2.27
MATR3-222	ENST00000513678	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.2	■■■□□ 2.26
MATR3-222	ENST00000513678	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.13	■■■□□ 2.25
MATR3-222	ENST00000513678	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.95	■■■□□ 2.23
MATR3-222	ENST00000513678	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MATR3-222	ENST00000513678	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MATR3-222	ENST00000513678	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MATR3-222	ENST00000513678	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MATR3-222	ENST00000513678	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MATR3-222	ENST00000513678	PTPRG	P23470	1445 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MATR3-222	ENST00000513678	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MATR3-222	ENST00000513678	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MATR3-222	ENST00000513678	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MATR3-222	ENST00000513678	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	28.8	■■■□□ 2.2
MATR3-222	ENST00000513678	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MATR3-222	ENST00000513678	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MATR3-222	ENST00000513678	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MATR3-222	ENST00000513678	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MATR3-222	ENST00000513678	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MATR3-222	ENST00000513678	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.7	■■■□□ 2.18
MATR3-222	ENST00000513678	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MATR3-222	ENST00000513678	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MATR3-222	ENST00000513678	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MATR3-222	ENST00000513678	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.17
MATR3-222	ENST00000513678	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MATR3-222	ENST00000513678	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MATR3-222	ENST00000513678	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MATR3-222	ENST00000513678	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MATR3-222	ENST00000513678	GLI2	P10070	1586 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MATR3-222	ENST00000513678	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
MATR3-222	ENST00000513678	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MATR3-222	ENST00000513678	KDM6B	O15054	1643 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MATR3-222	ENST00000513678	ABCA8	O94911	1581 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MATR3-222	ENST00000513678	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MATR3-222	ENST00000513678	EEA1	Q15075	1411 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MATR3-222	ENST00000513678	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
MATR3-222	ENST00000513678	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
MATR3-222	ENST00000513678	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.35	■■■□□ 2.13
MATR3-222	ENST00000513678	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
MATR3-222	ENST00000513678	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.34	■■■□□ 2.13
MATR3-222	ENST00000513678	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.31	■■■□□ 2.12
MATR3-222	ENST00000513678	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MATR3-222	ENST00000513678	KIF21B	O75037	1637 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MATR3-222	ENST00000513678	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
MATR3-222	ENST00000513678	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MATR3-222	ENST00000513678	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.15	■■■□□ 2.1
MATR3-222	ENST00000513678	ATP10B	O94823	1461 aa		28.15	■■■□□ 2.1
MATR3-222	ENST00000513678	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MATR3-222	ENST00000513678	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
MATR3-222	ENST00000513678	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.11	■■■□□ 2.09
MATR3-222	ENST00000513678	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.1	■■■□□ 2.09
MATR3-222	ENST00000513678	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.09	■■■□□ 2.09
MATR3-222	ENST00000513678	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MATR3-222	ENST00000513678	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MATR3-222	ENST00000513678	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MATR3-222	ENST00000513678	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MATR3-222	ENST00000513678	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
MATR3-222	ENST00000513678	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MATR3-222	ENST00000513678	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28	■■■□□ 2.07
MATR3-222	ENST00000513678	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MATR3-222	ENST00000513678	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MATR3-222	ENST00000513678	ADGRL1	O94910	1474 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MATR3-222	ENST00000513678	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MATR3-222	ENST00000513678	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MATR3-222	ENST00000513678	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MATR3-222	ENST00000513678	NEO1	Q92859	1461 aa		27.83	■■■□□ 2.04
MATR3-222	ENST00000513678	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MATR3-222	ENST00000513678	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MATR3-222	ENST00000513678	FMN1	Q68DA7	1419 aa		27.76	■■■□□ 2.04
MATR3-222	ENST00000513678	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MATR3-222	ENST00000513678	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MATR3-222	ENST00000513678	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
MATR3-222	ENST00000513678	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.73	■■■□□ 2.03	3e-7	■□□□□ 11.1
MATR3-222	ENST00000513678	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MATR3-222	ENST00000513678	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MATR3-222	ENST00000513678	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.7	■■■□□ 2.03
MATR3-222	ENST00000513678	RAPGEF3	O95398	923 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MATR3-222	ENST00000513678	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.64	■■■□□ 2.01
MATR3-222	ENST00000513678	FANCA	O15360	1455 aa		27.64	■■■□□ 2.01
MATR3-222	ENST00000513678	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MATR3-222	ENST00000513678	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
MATR3-222	ENST00000513678	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MATR3-222	ENST00000513678	PLCH2	O75038	1416 aa		27.56	■■■□□ 2
MATR3-222	ENST00000513678	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.56	■■■□□ 2
MATR3-222	ENST00000513678	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.54	■■■□□ 2
MATR3-222	ENST00000513678	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.54	■■■□□ 2
MATR3-222	ENST00000513678	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
MATR3-222	ENST00000513678	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
MATR3-222	ENST00000513678	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	KIF14	Q15058	1648 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.47	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		27.46	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.45	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.45	■■□□□ 1.99
MATR3-222	ENST00000513678	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.45	■■□□□ 1.98
MATR3-222	ENST00000513678	CLIP1	P30622	1438 aa		27.44	■■□□□ 1.98

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