RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513272.5

TMA16-209, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMA16, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-209ENST00000513272 CUL7Q14999 1698 aa32.72■■■□□ 2.83
TMA16-209ENST00000513272 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.72■■■□□ 2.83
TMA16-209ENST00000513272 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.65■■■□□ 2.82
TMA16-209ENST00000513272 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.62■■■□□ 2.81
TMA16-209ENST00000513272 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.37■■■□□ 2.77
TMA16-209ENST00000513272 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
TMA16-209ENST00000513272 IQGAP2Q13576 1575 aa32.33■■■□□ 2.77
TMA16-209ENST00000513272 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.31■■■□□ 2.76
TMA16-209ENST00000513272 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
TMA16-209ENST00000513272 PTPRGP23470 1445 aa32.3■■■□□ 2.76
TMA16-209ENST00000513272 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.29■■■□□ 2.76
TMA16-209ENST00000513272 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.25■■■□□ 2.75
TMA16-209ENST00000513272 MAPKBP1O60336 1514 aa32.19■■■□□ 2.74
TMA16-209ENST00000513272 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.17■■■□□ 2.74
TMA16-209ENST00000513272 DISP1Q96F81 1524 aa32.17■■■□□ 2.74
TMA16-209ENST00000513272 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.17■■■□□ 2.74
TMA16-209ENST00000513272 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.15■■■□□ 2.74
TMA16-209ENST00000513272 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.14■■■□□ 2.74
TMA16-209ENST00000513272 PRXQ9BXM0 1461 aa32.1■■■□□ 2.73
TMA16-209ENST00000513272 ABCC2Q92887 1545 aa32.05■■■□□ 2.72
TMA16-209ENST00000513272 DIP2BQ9P265 1576 aa32.05■■■□□ 2.72
TMA16-209ENST00000513272 UACAQ9BZF9 1416 aa32.04■■■□□ 2.72
TMA16-209ENST00000513272 KIAA0556O60303 1618 aa32.04■■■□□ 2.72
TMA16-209ENST00000513272 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.03■■■□□ 2.72
TMA16-209ENST00000513272 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.01■■■□□ 2.71
TMA16-209ENST00000513272 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.99■■■□□ 2.71
TMA16-209ENST00000513272 GOLGA3Q08378 1498 aa31.93■■■□□ 2.7
TMA16-209ENST00000513272 ASXL2Q76L83 1435 aa31.92■■■□□ 2.7
TMA16-209ENST00000513272 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.89■■■□□ 2.7
TMA16-209ENST00000513272 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.87■■■□□ 2.69
TMA16-209ENST00000513272 EEA1Q15075 1411 aa31.85■■■□□ 2.69
TMA16-209ENST00000513272 TSPOAP1O95153 1857 aa31.81■■■□□ 2.68
TMA16-209ENST00000513272 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
TMA16-209ENST00000513272 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
TMA16-209ENST00000513272 P3H3Q8IVL6 736 aa31.76■■■□□ 2.67
TMA16-209ENST00000513272 GLI2P10070 1586 aa31.75■■■□□ 2.67
TMA16-209ENST00000513272 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
TMA16-209ENST00000513272 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
TMA16-209ENST00000513272 ABCA8O94911 1581 aa31.72■■■□□ 2.67
TMA16-209ENST00000513272 KDM6BO15054 1643 aa31.71■■■□□ 2.67
TMA16-209ENST00000513272 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.66■■■□□ 2.66
TMA16-209ENST00000513272 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.65■■■□□ 2.66
TMA16-209ENST00000513272 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
TMA16-209ENST00000513272 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
TMA16-209ENST00000513272 SAMD9Q5K651 1589 aa31.61■■■□□ 2.65
TMA16-209ENST00000513272 ARID3CA6NKF2 412 aa31.59■■■□□ 2.65
TMA16-209ENST00000513272 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.59■■■□□ 2.65
TMA16-209ENST00000513272 KCNH8Q96L42 1107 aa31.57■■■□□ 2.64
TMA16-209ENST00000513272 KIF21BO75037 1637 aa31.55■■■□□ 2.64
TMA16-209ENST00000513272 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.52■■■□□ 2.64
TMA16-209ENST00000513272 ATP10BO94823 1461 aa31.5■■■□□ 2.63
TMA16-209ENST00000513272 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.49■■■□□ 2.63
TMA16-209ENST00000513272 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.47■■■□□ 2.63
TMA16-209ENST00000513272 CD109Q6YHK3 1445 aa31.45■■■□□ 2.63
TMA16-209ENST00000513272 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.44■■■□□ 2.62
TMA16-209ENST00000513272 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
TMA16-209ENST00000513272 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
TMA16-209ENST00000513272 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
TMA16-209ENST00000513272 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
TMA16-209ENST00000513272 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.39■■■□□ 2.62
TMA16-209ENST00000513272 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.38■■■□□ 2.61
TMA16-209ENST00000513272 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.37■■■□□ 2.61
TMA16-209ENST00000513272 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
TMA16-209ENST00000513272 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.3■■■□□ 2.6
TMA16-209ENST00000513272 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.23■■■□□ 2.59
TMA16-209ENST00000513272 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.21■■■□□ 2.59
TMA16-209ENST00000513272 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.16■■■□□ 2.58
TMA16-209ENST00000513272 FMN1Q68DA7 1419 aa31.13■■■□□ 2.57
TMA16-209ENST00000513272 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.13■■■□□ 2.57
TMA16-209ENST00000513272 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
TMA16-209ENST00000513272 ADGRL1O94910 1474 aa31.11■■■□□ 2.57
TMA16-209ENST00000513272 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.1■■■□□ 2.57
TMA16-209ENST00000513272 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
TMA16-209ENST00000513272 NEO1Q92859 1461 aa31.06■■■□□ 2.56
TMA16-209ENST00000513272 RAPGEF3O95398 923 aa31.02■■■□□ 2.56
TMA16-209ENST00000513272 HECW1Q76N89 1606 aa31.02■■■□□ 2.56
TMA16-209ENST00000513272 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31■■■□□ 2.55
TMA16-209ENST00000513272 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.95■■■□□ 2.54
TMA16-209ENST00000513272 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
TMA16-209ENST00000513272 FANCAO15360 1455 aa30.93■■■□□ 2.54
TMA16-209ENST00000513272 AKNAQ7Z591 1439 aa30.9■■■□□ 2.54
TMA16-209ENST00000513272 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.87■■■□□ 2.53
TMA16-209ENST00000513272 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
TMA16-209ENST00000513272 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.86■■■□□ 2.53
TMA16-209ENST00000513272 PLCH2O75038 1416 aa30.83■■■□□ 2.53
TMA16-209ENST00000513272 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
TMA16-209ENST00000513272 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.81■■■□□ 2.52
TMA16-209ENST00000513272 CLIP1P30622 1438 aa30.81■■■□□ 2.52
TMA16-209ENST00000513272 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
TMA16-209ENST00000513272 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.79■■■□□ 2.52
TMA16-209ENST00000513272 KIF14Q15058 1648 aa30.77■■■□□ 2.52
TMA16-209ENST00000513272 RICTORQ6R327 1708 aa30.76■■■□□ 2.52
TMA16-209ENST00000513272 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.74■■■□□ 2.51
TMA16-209ENST00000513272 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.74■■■□□ 2.51
TMA16-209ENST00000513272 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
TMA16-209ENST00000513272 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.73■■■□□ 2.51
TMA16-209ENST00000513272 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.72■■■□□ 2.51
TMA16-209ENST00000513272 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.7■■■□□ 2.5
TMA16-209ENST00000513272 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.69■■■□□ 2.5
TMA16-209ENST00000513272 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms