RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511562.5

TMA16-207, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

TSL 2

Gene TMA16, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-207ENST00000511562 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-207ENST00000511562 OSCARQ8IYS5 282 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-207ENST00000511562 CHD1O14646 1710 aa22.72■■□□□ 1.23
TMA16-207ENST00000511562 CEP170Q5SW79 1584 aa22.71■■□□□ 1.23
TMA16-207ENST00000511562 CEP162Q5TB80 1403 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-207ENST00000511562 JPH4Q96JJ6 628 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-207ENST00000511562 CLIP1P30622 1438 aa22.65■■□□□ 1.22
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TMA16-207ENST00000511562 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.64■■□□□ 1.21
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TMA16-207ENST00000511562 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.56■■□□□ 1.2
TMA16-207ENST00000511562 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.55■■□□□ 1.2
TMA16-207ENST00000511562 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.53■■□□□ 1.2
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TMA16-207ENST00000511562 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.51■■□□□ 1.19
TMA16-207ENST00000511562 DISP1Q96F81 1524 aa22.47■■□□□ 1.19
TMA16-207ENST00000511562 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.44■■□□□ 1.18
TMA16-207ENST00000511562 SAMD9Q5K651 1589 aa22.44■■□□□ 1.18
TMA16-207ENST00000511562 ARAP1Q96P48 1450 aa22.44■■□□□ 1.18
TMA16-207ENST00000511562 SHROOM2Q13796 1616 aa22.43■■□□□ 1.18
TMA16-207ENST00000511562 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TMA16-207ENST00000511562 KIAA0556O60303 1618 aa22.39■■□□□ 1.18
TMA16-207ENST00000511562 FMN1Q68DA7 1419 aa22.37■■□□□ 1.17
TMA16-207ENST00000511562 PTPRGP23470 1445 aa22.36■■□□□ 1.17
TMA16-207ENST00000511562 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.36■■□□□ 1.17
TMA16-207ENST00000511562 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TMA16-207ENST00000511562 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.31■■□□□ 1.16
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TMA16-207ENST00000511562 ARHGEF11O15085 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
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TMA16-207ENST00000511562 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.19■■□□□ 1.14
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TMA16-207ENST00000511562 ABCA8O94911 1581 aa22.13■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 ARID3CA6NKF2 412 aa22.13■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.13■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 HECW1Q76N89 1606 aa22.09■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.09■■□□□ 1.13
TMA16-207ENST00000511562 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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TMA16-207ENST00000511562 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.07■■□□□ 1.12
TMA16-207ENST00000511562 MAP3K1Q13233 1512 aa22.06■■□□□ 1.12
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TMA16-207ENST00000511562 ATP10BO94823 1461 aa22.03■■□□□ 1.12
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TMA16-207ENST00000511562 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.96■■□□□ 1.11
TMA16-207ENST00000511562 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.96■■□□□ 1.11
TMA16-207ENST00000511562 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.96■■□□□ 1.11
TMA16-207ENST00000511562 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.92■■□□□ 1.1
TMA16-207ENST00000511562 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.91■■□□□ 1.1
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TMA16-207ENST00000511562 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.85■■□□□ 1.09
TMA16-207ENST00000511562 ASXL2Q76L83 1435 aa21.81■■□□□ 1.08
TMA16-207ENST00000511562 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.78■■□□□ 1.08
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TMA16-207ENST00000511562 MAPKBP1O60336 1514 aa21.72■■□□□ 1.07
TMA16-207ENST00000511562 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TMA16-207ENST00000511562 KIF14Q15058 1648 aa21.7■■□□□ 1.06
TMA16-207ENST00000511562 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.68■■□□□ 1.06
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TMA16-207ENST00000511562 CD109Q6YHK3 1445 aa21.57■■□□□ 1.04
TMA16-207ENST00000511562 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.57■■□□□ 1.04
TMA16-207ENST00000511562 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.55■■□□□ 1.04
TMA16-207ENST00000511562 GLI2P10070 1586 aa21.54■■□□□ 1.04
TMA16-207ENST00000511562 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
TMA16-207ENST00000511562 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.54■■□□□ 1.04
TMA16-207ENST00000511562 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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