RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 IGF1RP08069 1367 aa42.91■■■■■ 4.46
ALYREF-203ENST00000511412 JPH4Q96JJ6 628 aa42.88■■■■■ 4.45
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.76■■■■■ 4.44
ALYREF-203ENST00000511412 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.66■■■■■ 4.42
ALYREF-203ENST00000511412 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.48■■■■■ 4.39
ALYREF-203ENST00000511412 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.46■■■■■ 4.39
ALYREF-203ENST00000511412 IQGAP2Q13576 1575 aa42.44■■■■■ 4.39
ALYREF-203ENST00000511412 MAPKBP1O60336 1514 aa42.39■■■■■ 4.38
ALYREF-203ENST00000511412 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.37■■■■■ 4.37
ALYREF-203ENST00000511412 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.36■■■■■ 4.37
ALYREF-203ENST00000511412 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.34■■■■■ 4.37
ALYREF-203ENST00000511412 PTPRGP23470 1445 aa42.29■■■■■ 4.36
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.28■■■■■ 4.36
ALYREF-203ENST00000511412 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.26■■■■■ 4.35
ALYREF-203ENST00000511412 DIP2BQ9P265 1576 aa42.23■■■■■ 4.35
ALYREF-203ENST00000511412 DISP1Q96F81 1524 aa42.17■■■■■ 4.34
ALYREF-203ENST00000511412 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
ALYREF-203ENST00000511412 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.16■■■■■ 4.34
ALYREF-203ENST00000511412 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.15■■■■■ 4.34
ALYREF-203ENST00000511412 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.1■■■■■ 4.33
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC2Q92887 1545 aa42.09■■■■■ 4.33
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA0556O60303 1618 aa42.06■■■■■ 4.32
ALYREF-203ENST00000511412 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.03■■■■■ 4.32
ALYREF-203ENST00000511412 UACAQ9BZF9 1416 aa42■■■■■ 4.31
ALYREF-203ENST00000511412 PRXQ9BXM0 1461 aa41.97■■■■■ 4.31
ALYREF-203ENST00000511412 TSPOAP1O95153 1857 aa41.9■■■■■ 4.3
ALYREF-203ENST00000511412 ASXL2Q76L83 1435 aa41.89■■■■■ 4.3
ALYREF-203ENST00000511412 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.88■■■■■ 4.29
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA3Q08378 1498 aa41.84■■■■■ 4.29
ALYREF-203ENST00000511412 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.84■■■■■ 4.29
ALYREF-203ENST00000511412 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
ALYREF-203ENST00000511412 KDM6BO15054 1643 aa41.81■■■■■ 4.28
ALYREF-203ENST00000511412 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
ALYREF-203ENST00000511412 GLI2P10070 1586 aa41.79■■■■■ 4.28
ALYREF-203ENST00000511412 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
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ALYREF-203ENST00000511412 ABCA8O94911 1581 aa41.63■■■■■ 4.26
ALYREF-203ENST00000511412 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.62■■■■■ 4.25
ALYREF-203ENST00000511412 EEA1Q15075 1411 aa41.61■■■■■ 4.25
ALYREF-203ENST00000511412 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.59■■■■■ 4.25
ALYREF-203ENST00000511412 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.55■■■■■ 4.24
ALYREF-203ENST00000511412 SAMD9Q5K651 1589 aa41.46■■■■■ 4.23
ALYREF-203ENST00000511412 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.46■■■■■ 4.23
ALYREF-203ENST00000511412 P3H3Q8IVL6 736 aa41.38■■■■■ 4.21
ALYREF-203ENST00000511412 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
ALYREF-203ENST00000511412 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.34■■■■■ 4.21
ALYREF-203ENST00000511412 KIF21BO75037 1637 aa41.29■■■■■ 4.2
ALYREF-203ENST00000511412 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
ALYREF-203ENST00000511412 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.26■■■■■ 4.2
ALYREF-203ENST00000511412 CD109Q6YHK3 1445 aa41.24■■■■■ 4.19
ALYREF-203ENST00000511412 KCNH8Q96L42 1107 aa41.23■■■■■ 4.19
ALYREF-203ENST00000511412 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.23■■■■■ 4.19
ALYREF-203ENST00000511412 ATP10BO94823 1461 aa41.22■■■■■ 4.19
ALYREF-203ENST00000511412 ARID3CA6NKF2 412 aa41.2■■■■■ 4.19
ALYREF-203ENST00000511412 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
ALYREF-203ENST00000511412 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.14■■■■■ 4.18
ALYREF-203ENST00000511412 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.14■■■■■ 4.18
ALYREF-203ENST00000511412 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.11■■■■■ 4.17
ALYREF-203ENST00000511412 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
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ALYREF-203ENST00000511412 ADGRL1O94910 1474 aa40.99■■■■■ 4.15
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ALYREF-203ENST00000511412 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.89■■■■■ 4.14
ALYREF-203ENST00000511412 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.85■■■■■ 4.13
ALYREF-203ENST00000511412 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
ALYREF-203ENST00000511412 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.81■■■■■ 4.12
ALYREF-203ENST00000511412 NEO1Q92859 1461 aa40.78■■■■■ 4.12
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.75■■■■■ 4.11
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.71■■■■■ 4.11
ALYREF-203ENST00000511412 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
ALYREF-203ENST00000511412 FMN1Q68DA7 1419 aa40.69■■■■■ 4.1
ALYREF-203ENST00000511412 HECW1Q76N89 1606 aa40.67■■■■■ 4.1
ALYREF-203ENST00000511412 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.66■■■■■ 4.1
ALYREF-203ENST00000511412 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.63■■■■■ 4.09
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ALYREF-203ENST00000511412 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.62■■■■■ 4.09
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ALYREF-203ENST00000511412 FANCAO15360 1455 aa40.55■■■■■ 4.08
ALYREF-203ENST00000511412 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
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ALYREF-203ENST00000511412 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.4■■■■■ 4.06
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ALYREF-203ENST00000511412 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.35■■■■■ 4.05
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ALYREF-203ENST00000511412 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
ALYREF-203ENST00000511412 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.31■■■■■ 4.04
ALYREF-203ENST00000511412 CLIP1P30622 1438 aa40.3■■■■■ 4.04
ALYREF-203ENST00000511412 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.26■■■■■ 4.04
ALYREF-203ENST00000511412 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.26■■■■■ 4.03
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.26■■■■■ 4.03
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