RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510836.5

TUSC3-210, Transcript of tumor suppressor candidate 3, humanhuman

TSL 5

Gene TUSC3, Length 1,452 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3-210ENST00000510836 SHROOM2Q13796 1616 aa42.23■■■■■ 4.35
TUSC3-210ENST00000510836 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.21■■■■■ 4.35
TUSC3-210ENST00000510836 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.18■■■■■ 4.34
TUSC3-210ENST00000510836 JPH4Q96JJ6 628 aa42.05■■■■■ 4.32
TUSC3-210ENST00000510836 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.03■■■■■ 4.32
TUSC3-210ENST00000510836 ARAP1Q96P48 1450 aa42.03■■■■■ 4.32
TUSC3-210ENST00000510836 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
TUSC3-210ENST00000510836 IQGAP2Q13576 1575 aa41.95■■■■■ 4.31
TUSC3-210ENST00000510836 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
TUSC3-210ENST00000510836 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.91■■■■■ 4.3
TUSC3-210ENST00000510836 KIF21BO75037 1637 aa41.89■■■■■ 4.3
TUSC3-210ENST00000510836 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.85■■■■■ 4.29
TUSC3-210ENST00000510836 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.79■■■■■ 4.28
TUSC3-210ENST00000510836 DISP1Q96F81 1524 aa41.69■■■■■ 4.26
TUSC3-210ENST00000510836 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.63■■■■■ 4.26
TUSC3-210ENST00000510836 GOLGA3Q08378 1498 aa41.59■■■■■ 4.25
TUSC3-210ENST00000510836 KIAA0556O60303 1618 aa41.57■■■■■ 4.24
TUSC3-210ENST00000510836 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.52■■■■■ 4.24
TUSC3-210ENST00000510836 PTPRGP23470 1445 aa41.46■■■■■ 4.23
TUSC3-210ENST00000510836 SAMD9Q5K651 1589 aa41.43■■■■■ 4.22
TUSC3-210ENST00000510836 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
TUSC3-210ENST00000510836 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.38■■■■■ 4.21
TUSC3-210ENST00000510836 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.34■■■■■ 4.21
TUSC3-210ENST00000510836 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
TUSC3-210ENST00000510836 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.22■■■■■ 4.19
TUSC3-210ENST00000510836 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.22■■■■■ 4.19
TUSC3-210ENST00000510836 UACAQ9BZF9 1416 aa41.22■■■■■ 4.19
TUSC3-210ENST00000510836 P3H3Q8IVL6 736 aa41.18■■■■■ 4.18
TUSC3-210ENST00000510836 ABCC2Q92887 1545 aa41.17■■■■■ 4.18
TUSC3-210ENST00000510836 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
TUSC3-210ENST00000510836 ABCA8O94911 1581 aa41.13■■■■■ 4.18
TUSC3-210ENST00000510836 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.12■■■■■ 4.17
TUSC3-210ENST00000510836 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.09■■■■■ 4.17
TUSC3-210ENST00000510836 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.09■■■■■ 4.17
TUSC3-210ENST00000510836 MAPKBP1O60336 1514 aa41.03■■■■■ 4.16
TUSC3-210ENST00000510836 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.03■■■■■ 4.16
TUSC3-210ENST00000510836 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.16
TUSC3-210ENST00000510836 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
TUSC3-210ENST00000510836 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.92■■■■■ 4.14
TUSC3-210ENST00000510836 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.92■■■■■ 4.14
TUSC3-210ENST00000510836 CLIP1P30622 1438 aa40.84■■■■■ 4.13
TUSC3-210ENST00000510836 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
TUSC3-210ENST00000510836 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.82■■■■■ 4.13
TUSC3-210ENST00000510836 FMN1Q68DA7 1419 aa40.81■■■■■ 4.12
TUSC3-210ENST00000510836 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
TUSC3-210ENST00000510836 ASXL2Q76L83 1435 aa40.79■■■■■ 4.12
TUSC3-210ENST00000510836 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.79■■■■■ 4.12
TUSC3-210ENST00000510836 ATP10BO94823 1461 aa40.77■■■■■ 4.12
TUSC3-210ENST00000510836 DIP2BQ9P265 1576 aa40.74■■■■■ 4.11
TUSC3-210ENST00000510836 CEP162Q5TB80 1403 aa40.74■■■■■ 4.11
TUSC3-210ENST00000510836 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.63■■■■■ 4.1
TUSC3-210ENST00000510836 ARID3CA6NKF2 412 aa40.6■■■■■ 4.09
TUSC3-210ENST00000510836 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.6■■■■■ 4.09
TUSC3-210ENST00000510836 GLI2P10070 1586 aa40.59■■■■■ 4.09
TUSC3-210ENST00000510836 HECW1Q76N89 1606 aa40.59■■■■■ 4.09
TUSC3-210ENST00000510836 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
TUSC3-210ENST00000510836 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.55■■■■■ 4.08
TUSC3-210ENST00000510836 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.54■■■■■ 4.08
TUSC3-210ENST00000510836 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
TUSC3-210ENST00000510836 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
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TUSC3-210ENST00000510836 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
TUSC3-210ENST00000510836 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
TUSC3-210ENST00000510836 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.42■■■■■ 4.06
TUSC3-210ENST00000510836 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
TUSC3-210ENST00000510836 TSPOAP1O95153 1857 aa40.36■■■■■ 4.05
TUSC3-210ENST00000510836 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
TUSC3-210ENST00000510836 KCNH8Q96L42 1107 aa40.36■■■■■ 4.05
TUSC3-210ENST00000510836 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.35■■■■■ 4.05
TUSC3-210ENST00000510836 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.33■■■■■ 4.05
TUSC3-210ENST00000510836 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.33■■■■■ 4.05
TUSC3-210ENST00000510836 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.3■■■■■ 4.04
TUSC3-210ENST00000510836 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.25■■■■■ 4.03
TUSC3-210ENST00000510836 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
TUSC3-210ENST00000510836 CD109Q6YHK3 1445 aa40.21■■■■■ 4.03
TUSC3-210ENST00000510836 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.19■■■■■ 4.02
TUSC3-210ENST00000510836 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
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TUSC3-210ENST00000510836 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.1■■■■■ 4.01
TUSC3-210ENST00000510836 KIF14Q15058 1648 aa40.09■■■■■ 4.01
TUSC3-210ENST00000510836 TIAM1Q13009 1591 aa39.97■■■■□ 3.99
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TUSC3-210ENST00000510836 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
TUSC3-210ENST00000510836 MAP3K1Q13233 1512 aa39.94■■■■□ 3.98
TUSC3-210ENST00000510836 PLCH2O75038 1416 aa39.92■■■■□ 3.98
TUSC3-210ENST00000510836 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.91■■■■□ 3.98
TUSC3-210ENST00000510836 NEO1Q92859 1461 aa39.9■■■■□ 3.98
TUSC3-210ENST00000510836 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.89■■■■□ 3.98
TUSC3-210ENST00000510836 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.88■■■■□ 3.98
TUSC3-210ENST00000510836 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.88■■■■□ 3.97
TUSC3-210ENST00000510836 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.87■■■■□ 3.97
TUSC3-210ENST00000510836 FANCAO15360 1455 aa39.83■■■■□ 3.97
TUSC3-210ENST00000510836 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.82■■■■□ 3.96
TUSC3-210ENST00000510836 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.8■■■■□ 3.96
TUSC3-210ENST00000510836 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.8■■■■□ 3.96
TUSC3-210ENST00000510836 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.79■■■■□ 3.96
TUSC3-210ENST00000510836 PREX2Q70Z35 1606 aa39.78■■■■□ 3.96
TUSC3-210ENST00000510836 AKNAQ7Z591 1439 aa39.75■■■■□ 3.95
TUSC3-210ENST00000510836 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
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