RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510734.5

CLTB-207, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

TSL 2

Gene CLTB, Length 1,489 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-207ENST00000510734 CEP170Q5SW79 1584 aa37.28■■■■□ 3.56
CLTB-207ENST00000510734 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.23■■■■□ 3.55
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CLTB-207ENST00000510734 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.12■■■■□ 3.53
CLTB-207ENST00000510734 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
CLTB-207ENST00000510734 IQGAP2Q13576 1575 aa37.09■■■■□ 3.53
CLTB-207ENST00000510734 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.07■■■■□ 3.53
CLTB-207ENST00000510734 JPH4Q96JJ6 628 aa37.07■■■■□ 3.53
CLTB-207ENST00000510734 CEP162Q5TB80 1403 aa36.92■■■■□ 3.5
CLTB-207ENST00000510734 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.92■■■■□ 3.5
CLTB-207ENST00000510734 CLIP1P30622 1438 aa36.88■■■■□ 3.5
CLTB-207ENST00000510734 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
CLTB-207ENST00000510734 SHROOM2Q13796 1616 aa36.86■■■■□ 3.49
CLTB-207ENST00000510734 P3H3Q8IVL6 736 aa36.85■■■■□ 3.49
CLTB-207ENST00000510734 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.82■■■■□ 3.49
CLTB-207ENST00000510734 DISP1Q96F81 1524 aa36.79■■■■□ 3.48
CLTB-207ENST00000510734 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.78■■■■□ 3.48
CLTB-207ENST00000510734 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.77■■■■□ 3.48
CLTB-207ENST00000510734 SAMD9Q5K651 1589 aa36.74■■■■□ 3.47
CLTB-207ENST00000510734 KIAA0556O60303 1618 aa36.71■■■■□ 3.47
CLTB-207ENST00000510734 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.7■■■■□ 3.46
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CLTB-207ENST00000510734 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
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CLTB-207ENST00000510734 ARHGEF11O15085 1522 aa36.6■■■■□ 3.45
CLTB-207ENST00000510734 PTPRGP23470 1445 aa36.57■■■■□ 3.45
CLTB-207ENST00000510734 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.5■■■■□ 3.43
CLTB-207ENST00000510734 FMN1Q68DA7 1419 aa36.48■■■■□ 3.43
CLTB-207ENST00000510734 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.48■■■■□ 3.43
CLTB-207ENST00000510734 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.48■■■■□ 3.43
CLTB-207ENST00000510734 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.48■■■■□ 3.43
CLTB-207ENST00000510734 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.4■■■■□ 3.42
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CLTB-207ENST00000510734 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.36■■■■□ 3.41
CLTB-207ENST00000510734 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.34■■■■□ 3.41
CLTB-207ENST00000510734 UACAQ9BZF9 1416 aa36.32■■■■□ 3.4
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CLTB-207ENST00000510734 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.18■■■■□ 3.38
CLTB-207ENST00000510734 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
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CLTB-207ENST00000510734 APLP2Q06481 763 aa36.12■■■■□ 3.37
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CLTB-207ENST00000510734 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.07■■■■□ 3.37
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CLTB-207ENST00000510734 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.02■■■■□ 3.36
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CLTB-207ENST00000510734 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
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CLTB-207ENST00000510734 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.83■■■■□ 3.33
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CLTB-207ENST00000510734 ASXL2Q76L83 1435 aa35.78■■■■□ 3.32
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CLTB-207ENST00000510734 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.69■■■■□ 3.3
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CLTB-207ENST00000510734 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
CLTB-207ENST00000510734 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.23■■■■□ 3.23
CLTB-207ENST00000510734 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.23■■■■□ 3.23
CLTB-207ENST00000510734 MIA2Q96PC5 1412 aa35.23■■■■□ 3.23
CLTB-207ENST00000510734 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.22■■■■□ 3.23
CLTB-207ENST00000510734 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.22■■■■□ 3.23
CLTB-207ENST00000510734 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.21■■■■□ 3.23
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