RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	CUL7	Q14999	1698 aa		29.14	■■■□□ 2.26
MIB2-223	ENST00000508148	IGF1R	P08069	1367 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MIB2-223	ENST00000508148	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MIB2-223	ENST00000508148	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MIB2-223	ENST00000508148	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MIB2-223	ENST00000508148	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MIB2-223	ENST00000508148	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-223	ENST00000508148	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MIB2-223	ENST00000508148	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MIB2-223	ENST00000508148	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-223	ENST00000508148	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MIB2-223	ENST00000508148	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	28.74	■■■□□ 2.19
MIB2-223	ENST00000508148	PTPRG	P23470	1445 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MIB2-223	ENST00000508148	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MIB2-223	ENST00000508148	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-223	ENST00000508148	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
MIB2-223	ENST00000508148	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MIB2-223	ENST00000508148	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MIB2-223	ENST00000508148	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MIB2-223	ENST00000508148	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
MIB2-223	ENST00000508148	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MIB2-223	ENST00000508148	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MIB2-223	ENST00000508148	KDM6B	O15054	1643 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MIB2-223	ENST00000508148	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MIB2-223	ENST00000508148	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MIB2-223	ENST00000508148	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
MIB2-223	ENST00000508148	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.58	■■■□□ 2.16
MIB2-223	ENST00000508148	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MIB2-223	ENST00000508148	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MIB2-223	ENST00000508148	GLI2	P10070	1586 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MIB2-223	ENST00000508148	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
MIB2-223	ENST00000508148	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MIB2-223	ENST00000508148	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MIB2-223	ENST00000508148	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.41	■■■□□ 2.14
MIB2-223	ENST00000508148	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.4	■■■□□ 2.14
MIB2-223	ENST00000508148	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
MIB2-223	ENST00000508148	ABCA8	O94911	1581 aa		28.33	■■■□□ 2.12
MIB2-223	ENST00000508148	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
MIB2-223	ENST00000508148	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.29	■■■□□ 2.12
MIB2-223	ENST00000508148	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MIB2-223	ENST00000508148	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.26	■■■□□ 2.11
MIB2-223	ENST00000508148	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MIB2-223	ENST00000508148	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MIB2-223	ENST00000508148	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MIB2-223	ENST00000508148	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MIB2-223	ENST00000508148	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.08	■■■□□ 2.08
MIB2-223	ENST00000508148	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.06	■■■□□ 2.08
MIB2-223	ENST00000508148	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MIB2-223	ENST00000508148	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MIB2-223	ENST00000508148	ATP10B	O94823	1461 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MIB2-223	ENST00000508148	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MIB2-223	ENST00000508148	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-223	ENST00000508148	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-223	ENST00000508148	EEA1	Q15075	1411 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-223	ENST00000508148	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		27.95	■■■□□ 2.06
MIB2-223	ENST00000508148	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
MIB2-223	ENST00000508148	KIF21B	O75037	1637 aa		27.89	■■■□□ 2.05
MIB2-223	ENST00000508148	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-223	ENST00000508148	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MIB2-223	ENST00000508148	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MIB2-223	ENST00000508148	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MIB2-223	ENST00000508148	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MIB2-223	ENST00000508148	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MIB2-223	ENST00000508148	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-223	ENST00000508148	NEO1	Q92859	1461 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MIB2-223	ENST00000508148	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.66	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	RAPGEF3	O95398	923 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MIB2-223	ENST00000508148	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.64	■■■□□ 2.01
MIB2-223	ENST00000508148	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-223	ENST00000508148	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	FANCA	O15360	1455 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.52	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.51	■■■□□ 2
MIB2-223	ENST00000508148	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MIB2-223	ENST00000508148	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MIB2-223	ENST00000508148	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MIB2-223	ENST00000508148	PTPRM	P28827	1452 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MIB2-223	ENST00000508148	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.47	■■□□□ 1.99
MIB2-223	ENST00000508148	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
MIB2-223	ENST00000508148	FMN1	Q68DA7	1419 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MIB2-223	ENST00000508148	KIF14	Q15058	1648 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MIB2-223	ENST00000508148	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.42	■■□□□ 1.98
MIB2-223	ENST00000508148	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
MIB2-223	ENST00000508148	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
MIB2-223	ENST00000508148	PLCH2	O75038	1416 aa		27.4	■■□□□ 1.98
MIB2-223	ENST00000508148	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.4	■■□□□ 1.98
MIB2-223	ENST00000508148	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.39	■■□□□ 1.98
MIB2-223	ENST00000508148	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97

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