RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505760.5

HERC4-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 4

Gene HERC4, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-212ENST00000505760 IGF1RP08069 1367 aa42.99■■■■■ 4.47
HERC4-212ENST00000505760 CUL7Q14999 1698 aa42.95■■■■■ 4.47
HERC4-212ENST00000505760 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.82■■■■■ 4.45
HERC4-212ENST00000505760 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.73■■■■■ 4.43
HERC4-212ENST00000505760 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.62■■■■■ 4.41
HERC4-212ENST00000505760 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.61■■■■■ 4.41
HERC4-212ENST00000505760 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.56■■■■■ 4.4
HERC4-212ENST00000505760 MAPKBP1O60336 1514 aa42.47■■■■■ 4.39
HERC4-212ENST00000505760 IQGAP2Q13576 1575 aa42.45■■■■■ 4.39
HERC4-212ENST00000505760 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.44■■■■■ 4.38
HERC4-212ENST00000505760 PTPRGP23470 1445 aa42.42■■■■■ 4.38
HERC4-212ENST00000505760 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.42■■■■■ 4.38
HERC4-212ENST00000505760 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.41■■■■■ 4.38
HERC4-212ENST00000505760 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
HERC4-212ENST00000505760 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.36■■■■■ 4.37
HERC4-212ENST00000505760 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.35■■■■■ 4.37
HERC4-212ENST00000505760 DIP2BQ9P265 1576 aa42.33■■■■■ 4.37
HERC4-212ENST00000505760 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
HERC4-212ENST00000505760 DISP1Q96F81 1524 aa42.2■■■■■ 4.35
HERC4-212ENST00000505760 ABCC2Q92887 1545 aa42.17■■■■■ 4.34
HERC4-212ENST00000505760 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.15■■■■■ 4.34
HERC4-212ENST00000505760 TSPOAP1O95153 1857 aa42.1■■■■■ 4.33
HERC4-212ENST00000505760 UACAQ9BZF9 1416 aa42.09■■■■■ 4.33
HERC4-212ENST00000505760 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.09■■■■■ 4.33
HERC4-212ENST00000505760 KIAA0556O60303 1618 aa42.06■■■■■ 4.32
HERC4-212ENST00000505760 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.05■■■■■ 4.32
HERC4-212ENST00000505760 ASXL2Q76L83 1435 aa42.02■■■■■ 4.32
HERC4-212ENST00000505760 PLB1Q6P1J6 1458 aa42■■■■■ 4.31
HERC4-212ENST00000505760 KDM6BO15054 1643 aa41.96■■■■■ 4.31
HERC4-212ENST00000505760 PRXQ9BXM0 1461 aa41.92■■■■■ 4.3
HERC4-212ENST00000505760 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.9■■■■■ 4.3
HERC4-212ENST00000505760 GLI2P10070 1586 aa41.87■■■■■ 4.29
HERC4-212ENST00000505760 GOLGA3Q08378 1498 aa41.86■■■■■ 4.29
HERC4-212ENST00000505760 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
HERC4-212ENST00000505760 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
HERC4-212ENST00000505760 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
HERC4-212ENST00000505760 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.66■■■■■ 4.26
HERC4-212ENST00000505760 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.66■■■■■ 4.26
HERC4-212ENST00000505760 ABCA8O94911 1581 aa41.64■■■■■ 4.26
HERC4-212ENST00000505760 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.63■■■■■ 4.25
HERC4-212ENST00000505760 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
HERC4-212ENST00000505760 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.57■■■■■ 4.25
HERC4-212ENST00000505760 P3H3Q8IVL6 736 aa41.52■■■■■ 4.24
HERC4-212ENST00000505760 EEA1Q15075 1411 aa41.51■■■■■ 4.24
HERC4-212ENST00000505760 KCNH8Q96L42 1107 aa41.45■■■■■ 4.23
HERC4-212ENST00000505760 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.44■■■■■ 4.22
HERC4-212ENST00000505760 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
HERC4-212ENST00000505760 SAMD9Q5K651 1589 aa41.41■■■■■ 4.22
HERC4-212ENST00000505760 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.4■■■■■ 4.22
HERC4-212ENST00000505760 CD109Q6YHK3 1445 aa41.37■■■■■ 4.21
HERC4-212ENST00000505760 ARID3CA6NKF2 412 aa41.36■■■■■ 4.21
HERC4-212ENST00000505760 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.31■■■■■ 4.2
HERC4-212ENST00000505760 ATP10BO94823 1461 aa41.3■■■■■ 4.2
HERC4-212ENST00000505760 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
HERC4-212ENST00000505760 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.26■■■■■ 4.19
HERC4-212ENST00000505760 KIF21BO75037 1637 aa41.18■■■■■ 4.18
HERC4-212ENST00000505760 ADGRL1O94910 1474 aa41.17■■■■■ 4.18
HERC4-212ENST00000505760 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
HERC4-212ENST00000505760 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
HERC4-212ENST00000505760 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.14■■■■■ 4.18
HERC4-212ENST00000505760 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.08■■■■■ 4.17
HERC4-212ENST00000505760 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
HERC4-212ENST00000505760 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.04■■■■■ 4.16
HERC4-212ENST00000505760 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.99■■■■■ 4.15
HERC4-212ENST00000505760 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.97■■■■■ 4.15
HERC4-212ENST00000505760 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.94■■■■■ 4.14
HERC4-212ENST00000505760 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.94■■■■■ 4.14
HERC4-212ENST00000505760 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
HERC4-212ENST00000505760 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.89■■■■■ 4.14
HERC4-212ENST00000505760 NEO1Q92859 1461 aa40.86■■■■■ 4.13
HERC4-212ENST00000505760 RAPGEF3O95398 923 aa40.77■■■■■ 4.12
HERC4-212ENST00000505760 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
HERC4-212ENST00000505760 FMN1Q68DA7 1419 aa40.69■■■■■ 4.1
HERC4-212ENST00000505760 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.68■■■■■ 4.13e-17■□□□□ 8.7
HERC4-212ENST00000505760 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.66■■■■■ 4.1
HERC4-212ENST00000505760 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
HERC4-212ENST00000505760 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.65■■■■■ 4.1
HERC4-212ENST00000505760 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.64■■■■■ 4.1
HERC4-212ENST00000505760 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.63■■■■■ 4.09
HERC4-212ENST00000505760 FANCAO15360 1455 aa40.63■■■■■ 4.09
HERC4-212ENST00000505760 HECW1Q76N89 1606 aa40.62■■■■■ 4.09
HERC4-212ENST00000505760 AKNAQ7Z591 1439 aa40.6■■■■■ 4.09
HERC4-212ENST00000505760 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
HERC4-212ENST00000505760 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.57■■■■■ 4.09
HERC4-212ENST00000505760 RICTORQ6R327 1708 aa40.53■■■■■ 4.08
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HERC4-212ENST00000505760 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
HERC4-212ENST00000505760 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.47■■■■■ 4.07
HERC4-212ENST00000505760 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.46■■■■■ 4.07
HERC4-212ENST00000505760 PLCH2O75038 1416 aa40.43■■■■■ 4.06
HERC4-212ENST00000505760 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.42■■■■■ 4.06
HERC4-212ENST00000505760 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.39■■■■■ 4.06
HERC4-212ENST00000505760 PTPRMP28827 1452 aa40.38■■■■■ 4.05
HERC4-212ENST00000505760 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.37■■■■■ 4.05
HERC4-212ENST00000505760 KIF14Q15058 1648 aa40.35■■■■■ 4.05
HERC4-212ENST00000505760 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.35■■■■■ 4.05
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HERC4-212ENST00000505760 MADDQ8WXG6 1647 aa40.32■■■■■ 4.05
HERC4-212ENST00000505760 CLIP1P30622 1438 aa40.32■■■■■ 4.04
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