RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.11■■■■■ 4.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.05■■■■■ 4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40■■■■□ 3.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.71■■■■□ 3.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.7■■■■□ 3.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQGAP2Q13576 1575 aa39.67■■■■□ 3.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPRGP23470 1445 aa39.59■■■■□ 3.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.58■■■■□ 3.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.54■■■■□ 3.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.48■■■■□ 3.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAPKBP1O60336 1514 aa39.45■■■■□ 3.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DISP1Q96F81 1524 aa39.43■■■■□ 3.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.42■■■■□ 3.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.41■■■■□ 3.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.38■■■■□ 3.9
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRXQ9BXM0 1461 aa39.37■■■■□ 3.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.36■■■■□ 3.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA0556O60303 1618 aa39.29■■■■□ 3.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UACAQ9BZF9 1416 aa39.28■■■■□ 3.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC2Q92887 1545 aa39.28■■■■□ 3.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIP2BQ9P265 1576 aa39.28■■■■□ 3.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.26■■■■□ 3.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.24■■■■□ 3.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA3Q08378 1498 aa39.18■■■■□ 3.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASXL2Q76L83 1435 aa39.13■■■■□ 3.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EEA1Q15075 1411 aa39.11■■■■□ 3.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.1■■■■□ 3.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPOAP1O95153 1857 aa39.08■■■■□ 3.85
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.06■■■■□ 3.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 P3H3Q8IVL6 736 aa38.96■■■■□ 3.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLI2P10070 1586 aa38.93■■■■□ 3.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCA8O94911 1581 aa38.91■■■■□ 3.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.88■■■■□ 3.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM6BO15054 1643 aa38.88■■■■□ 3.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.79■■■■□ 3.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAMD9Q5K651 1589 aa38.78■■■■□ 3.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF21BO75037 1637 aa38.74■■■■□ 3.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.74■■■■□ 3.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARID3CA6NKF2 412 aa38.72■■■■□ 3.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNH8Q96L42 1107 aa38.72■■■■□ 3.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.66■■■■□ 3.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.64■■■■□ 3.78
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP10BO94823 1461 aa38.61■■■■□ 3.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.6■■■■□ 3.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.59■■■■□ 3.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD109Q6YHK3 1445 aa38.55■■■■□ 3.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.53■■■■□ 3.76
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.46■■■■□ 3.75
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.31■■■■□ 3.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.3■■■■□ 3.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.3■■■■□ 3.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.22■■■■□ 3.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FMN1Q68DA7 1419 aa38.19■■■■□ 3.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.14■■■■□ 3.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRL1O94910 1474 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEO1Q92859 1461 aa38.08■■■■□ 3.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HECW1Q76N89 1606 aa38.07■■■■□ 3.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.02■■■■□ 3.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAPGEF3O95398 923 aa38.01■■■■□ 3.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.95■■■■□ 3.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FANCAO15360 1455 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKNAQ7Z591 1439 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.82■■■■□ 3.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLIP1P30622 1438 aa37.81■■■■□ 3.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLCH2O75038 1416 aa37.8■■■■□ 3.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.8■■■■□ 3.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF14Q15058 1648 aa37.76■■■■□ 3.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RICTORQ6R327 1708 aa37.75■■■■□ 3.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.68■■■■□ 3.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.67■■■■□ 3.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.61■■■■□ 3.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.61■■■■□ 3.61
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