RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505685.1

ZBED3-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ZBED3, Length 432 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-202ENST00000505685 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.68■□□□□ 0.1
ZBED3-202ENST00000505685 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.68■□□□□ 0.1
ZBED3-202ENST00000505685 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.68■□□□□ 0.1
ZBED3-202ENST00000505685 CEP170Q5SW79 1584 aa15.66■□□□□ 0.1
ZBED3-202ENST00000505685 EEA1Q15075 1411 aa15.64■□□□□ 0.09
ZBED3-202ENST00000505685 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.63■□□□□ 0.09
ZBED3-202ENST00000505685 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.63■□□□□ 0.09
ZBED3-202ENST00000505685 JPH4Q96JJ6 628 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED3-202ENST00000505685 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED3-202ENST00000505685 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED3-202ENST00000505685 ARAP1Q96P48 1450 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED3-202ENST00000505685 SHROOM2Q13796 1616 aa15.58■□□□□ 0.09
ZBED3-202ENST00000505685 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.58■□□□□ 0.08
ZBED3-202ENST00000505685 PRXQ9BXM0 1461 aa15.56■□□□□ 0.08
ZBED3-202ENST00000505685 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
ZBED3-202ENST00000505685 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ZBED3-202ENST00000505685 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.49■□□□□ 0.07
ZBED3-202ENST00000505685 IQGAP2Q13576 1575 aa15.49■□□□□ 0.07
ZBED3-202ENST00000505685 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.47■□□□□ 0.07
ZBED3-202ENST00000505685 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ZBED3-202ENST00000505685 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.43■□□□□ 0.06
ZBED3-202ENST00000505685 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.41■□□□□ 0.06
ZBED3-202ENST00000505685 PTPRGP23470 1445 aa15.4■□□□□ 0.06
ZBED3-202ENST00000505685 GOLGA3Q08378 1498 aa15.4■□□□□ 0.06
ZBED3-202ENST00000505685 KIF21BO75037 1637 aa15.38■□□□□ 0.05
ZBED3-202ENST00000505685 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.38■□□□□ 0.05
ZBED3-202ENST00000505685 DISP1Q96F81 1524 aa15.37■□□□□ 0.05
ZBED3-202ENST00000505685 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
ZBED3-202ENST00000505685 KIAA0556O60303 1618 aa15.32■□□□□ 0.04
ZBED3-202ENST00000505685 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
ZBED3-202ENST00000505685 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.29■□□□□ 0.04
ZBED3-202ENST00000505685 UACAQ9BZF9 1416 aa15.29■□□□□ 0.04
ZBED3-202ENST00000505685 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ZBED3-202ENST00000505685 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
ZBED3-202ENST00000505685 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.25■□□□□ 0.03
ZBED3-202ENST00000505685 ABCC2Q92887 1545 aa15.25■□□□□ 0.03
ZBED3-202ENST00000505685 MSH5O43196 834 aa15.24■□□□□ 0.03
ZBED3-202ENST00000505685 MAPKBP1O60336 1514 aa15.23■□□□□ 0.03
ZBED3-202ENST00000505685 SAMD9Q5K651 1589 aa15.22■□□□□ 0.03
ZBED3-202ENST00000505685 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.22■□□□□ 0.03
ZBED3-202ENST00000505685 P3H3Q8IVL6 736 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED3-202ENST00000505685 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.19■□□□□ 0.02
ZBED3-202ENST00000505685 ABCA8O94911 1581 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED3-202ENST00000505685 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED3-202ENST00000505685 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ZBED3-202ENST00000505685 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED3-202ENST00000505685 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.16■□□□□ 0.02
ZBED3-202ENST00000505685 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED3-202ENST00000505685 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED3-202ENST00000505685 ASXL2Q76L83 1435 aa15.13■□□□□ 0.01
ZBED3-202ENST00000505685 FMN1Q68DA7 1419 aa15.11■□□□□ 0.01
ZBED3-202ENST00000505685 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.09■□□□□ 0.01
ZBED3-202ENST00000505685 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
ZBED3-202ENST00000505685 DIP2BQ9P265 1576 aa15.07■□□□□ 0
ZBED3-202ENST00000505685 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.07■□□□□ 0
ZBED3-202ENST00000505685 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.07■□□□□ 0
ZBED3-202ENST00000505685 ATP10BO94823 1461 aa15.06■□□□□ 0
ZBED3-202ENST00000505685 GLI2P10070 1586 aa15.06■□□□□ 0
ZBED3-202ENST00000505685 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.04■□□□□ -0
ZBED3-202ENST00000505685 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ZBED3-202ENST00000505685 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ZBED3-202ENST00000505685 CLIP1P30622 1438 aa15.04■□□□□ -0
ZBED3-202ENST00000505685 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
ZBED3-202ENST00000505685 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
ZBED3-202ENST00000505685 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15□□□□□ -0.01
ZBED3-202ENST00000505685 ARID3CA6NKF2 412 aa15□□□□□ -0.01
ZBED3-202ENST00000505685 KCNH8Q96L42 1107 aa14.99□□□□□ -0.01
ZBED3-202ENST00000505685 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ZBED3-202ENST00000505685 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ZBED3-202ENST00000505685 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.97□□□□□ -0.01
ZBED3-202ENST00000505685 HECW1Q76N89 1606 aa14.96□□□□□ -0.01
ZBED3-202ENST00000505685 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.95□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 CEP162Q5TB80 1403 aa14.95□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.95□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 CD109Q6YHK3 1445 aa14.94□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.92□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.92□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.92□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.92□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.9□□□□□ -0.02
ZBED3-202ENST00000505685 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.89□□□□□ -0.03
ZBED3-202ENST00000505685 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ZBED3-202ENST00000505685 TSPOAP1O95153 1857 aa14.88□□□□□ -0.03
ZBED3-202ENST00000505685 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.88□□□□□ -0.03
ZBED3-202ENST00000505685 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ZBED3-202ENST00000505685 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ZBED3-202ENST00000505685 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ZBED3-202ENST00000505685 KDM6BO15054 1643 aa14.84□□□□□ -0.03
ZBED3-202ENST00000505685 NEO1Q92859 1461 aa14.82□□□□□ -0.04
ZBED3-202ENST00000505685 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.8□□□□□ -0.04
ZBED3-202ENST00000505685 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
ZBED3-202ENST00000505685 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.8□□□□□ -0.04
ZBED3-202ENST00000505685 KIF14Q15058 1648 aa14.78□□□□□ -0.04
ZBED3-202ENST00000505685 PLCH2O75038 1416 aa14.78□□□□□ -0.04
ZBED3-202ENST00000505685 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.77□□□□□ -0.05
ZBED3-202ENST00000505685 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ZBED3-202ENST00000505685 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.76□□□□□ -0.05
ZBED3-202ENST00000505685 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.76□□□□□ -0.05
ZBED3-202ENST00000505685 FANCAO15360 1455 aa14.76□□□□□ -0.05
ZBED3-202ENST00000505685 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.8 ms