RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, human

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDR1-255	ENST00000504927	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.74	■■■■□ 3.15
DDR1-255	ENST00000504927	JPH4	Q96JJ6	628 aa		34.64	■■■■□ 3.14
DDR1-255	ENST00000504927	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		34.62	■■■■□ 3.13
DDR1-255	ENST00000504927	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.6	■■■■□ 3.13
DDR1-255	ENST00000504927	EEA1	Q15075	1411 aa		34.56	■■■■□ 3.12
DDR1-255	ENST00000504927	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		34.56	■■■■□ 3.12
DDR1-255	ENST00000504927	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.54	■■■■□ 3.12
DDR1-255	ENST00000504927	PRX	Q9BXM0	1461 aa		34.49	■■■■□ 3.11
DDR1-255	ENST00000504927	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	34.37	■■■■□ 3.09
DDR1-255	ENST00000504927	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.34	■■■■□ 3.09
DDR1-255	ENST00000504927	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		34.27	■■■■□ 3.08
DDR1-255	ENST00000504927	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		34.18	■■■■□ 3.06
DDR1-255	ENST00000504927	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		34.17	■■■■□ 3.06
DDR1-255	ENST00000504927	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	34.16	■■■■□ 3.06
DDR1-255	ENST00000504927	DISP1	Q96F81	1524 aa		34.14	■■■■□ 3.06
DDR1-255	ENST00000504927	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		34.14	■■■■□ 3.06
DDR1-255	ENST00000504927	PTPRG	P23470	1445 aa		34.13	■■■■□ 3.05
DDR1-255	ENST00000504927	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		34.11	■■■■□ 3.05
DDR1-255	ENST00000504927	KIF21B	O75037	1637 aa		34.08	■■■■□ 3.05
DDR1-255	ENST00000504927	GOLGA3	Q08378	1498 aa		34.05	■■■■□ 3.04
DDR1-255	ENST00000504927	KIAA0556	O60303	1618 aa		34.04	■■■■□ 3.04
DDR1-255	ENST00000504927	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	34.04	■■■■□ 3.04
DDR1-255	ENST00000504927	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	34	■■■■□ 3.03
DDR1-255	ENST00000504927	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.95	■■■■□ 3.03
DDR1-255	ENST00000504927	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.88	■■■■□ 3.01
DDR1-255	ENST00000504927	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.87	■■■■□ 3.01
DDR1-255	ENST00000504927	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.87	■■■■□ 3.01
DDR1-255	ENST00000504927	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.84	■■■■□ 3.01
DDR1-255	ENST00000504927	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.83	■■■■□ 3.01
DDR1-255	ENST00000504927	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.82	■■■■□ 3
DDR1-255	ENST00000504927	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.82	■■■■□ 3
DDR1-255	ENST00000504927	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
DDR1-255	ENST00000504927	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.75	■■■□□ 2.99
DDR1-255	ENST00000504927	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.75	■■■□□ 2.99
DDR1-255	ENST00000504927	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.74	■■■□□ 2.99
DDR1-255	ENST00000504927	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.73	■■■□□ 2.99
DDR1-255	ENST00000504927	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.69	■■■□□ 2.98
DDR1-255	ENST00000504927	ABCA8	O94911	1581 aa		33.68	■■■□□ 2.98
DDR1-255	ENST00000504927	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.67	■■■□□ 2.98
DDR1-255	ENST00000504927	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
DDR1-255	ENST00000504927	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.64	■■■□□ 2.98
DDR1-255	ENST00000504927	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.63	■■■□□ 2.97
DDR1-255	ENST00000504927	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.6	■■■□□ 2.97
DDR1-255	ENST00000504927	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.49	■■■□□ 2.95
DDR1-255	ENST00000504927	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.46	■■■□□ 2.95
DDR1-255	ENST00000504927	GLI2	P10070	1586 aa		33.45	■■■□□ 2.95
DDR1-255	ENST00000504927	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
DDR1-255	ENST00000504927	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.44	■■■□□ 2.94
DDR1-255	ENST00000504927	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.44	■■■□□ 2.94
DDR1-255	ENST00000504927	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.43	■■■□□ 2.94
DDR1-255	ENST00000504927	ATP10B	O94823	1461 aa		33.42	■■■□□ 2.94
DDR1-255	ENST00000504927	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.41	■■■□□ 2.94
DDR1-255	ENST00000504927	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
DDR1-255	ENST00000504927	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
DDR1-255	ENST00000504927	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
DDR1-255	ENST00000504927	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
DDR1-255	ENST00000504927	CLIP1	P30622	1438 aa		33.34	■■■□□ 2.93
DDR1-255	ENST00000504927	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.33	■■■□□ 2.93
DDR1-255	ENST00000504927	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.31	■■■□□ 2.92
DDR1-255	ENST00000504927	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.3	■■■□□ 2.92
DDR1-255	ENST00000504927	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
DDR1-255	ENST00000504927	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		33.25	■■■□□ 2.91
DDR1-255	ENST00000504927	KDM6B	O15054	1643 aa		33.21	■■■□□ 2.91
DDR1-255	ENST00000504927	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.17	■■■□□ 2.9
DDR1-255	ENST00000504927	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.16	■■■□□ 2.9
DDR1-255	ENST00000504927	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.16	■■■□□ 2.9
DDR1-255	ENST00000504927	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
DDR1-255	ENST00000504927	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.14	■■■□□ 2.9
DDR1-255	ENST00000504927	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
DDR1-255	ENST00000504927	CD109	Q6YHK3	1445 aa		33.11	■■■□□ 2.89
DDR1-255	ENST00000504927	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33.09	■■■□□ 2.89
DDR1-255	ENST00000504927	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
DDR1-255	ENST00000504927	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		33.07	■■■□□ 2.88
DDR1-255	ENST00000504927	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.07	■■■□□ 2.88
DDR1-255	ENST00000504927	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.02	■■■□□ 2.88
DDR1-255	ENST00000504927	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33	■■■□□ 2.87
DDR1-255	ENST00000504927	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.99	■■■□□ 2.87
DDR1-255	ENST00000504927	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
DDR1-255	ENST00000504927	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
DDR1-255	ENST00000504927	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.9	■■■□□ 2.86	6e-7	■■■■□ 21.9
DDR1-255	ENST00000504927	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.9	■■■□□ 2.86
DDR1-255	ENST00000504927	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.89	■■■□□ 2.86
DDR1-255	ENST00000504927	KIF14	Q15058	1648 aa		32.8	■■■□□ 2.84
DDR1-255	ENST00000504927	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.79	■■■□□ 2.84
DDR1-255	ENST00000504927	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.79	■■■□□ 2.84
DDR1-255	ENST00000504927	NEO1	Q92859	1461 aa		32.79	■■■□□ 2.84
DDR1-255	ENST00000504927	PLCH2	O75038	1416 aa		32.76	■■■□□ 2.83
DDR1-255	ENST00000504927	FANCA	O15360	1455 aa		32.7	■■■□□ 2.83
DDR1-255	ENST00000504927	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.7	■■■□□ 2.82
DDR1-255	ENST00000504927	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.69	■■■□□ 2.82
DDR1-255	ENST00000504927	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.67	■■■□□ 2.82
DDR1-255	ENST00000504927	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.67	■■■□□ 2.82
DDR1-255	ENST00000504927	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.65	■■■□□ 2.82
DDR1-255	ENST00000504927	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.65	■■■□□ 2.82
DDR1-255	ENST00000504927	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.63	■■■□□ 2.81
DDR1-255	ENST00000504927	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.58	■■■□□ 2.81
DDR1-255	ENST00000504927	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.57	■■■□□ 2.81
DDR1-255	ENST00000504927	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
DDR1-255	ENST00000504927	APLP2	Q06481	763 aa		32.55	■■■□□ 2.8
DDR1-255	ENST00000504927	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8

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