RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ARAP1Q96P48 1450 aa12.7□□□□□ -0.38
PDE4D-208ENST00000502484 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.7□□□□□ -0.38
PDE4D-208ENST00000502484 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PDE4D-208ENST00000502484 FBLN2P98095 1184 aa12.67□□□□□ -0.38
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.66□□□□□ -0.38
PDE4D-208ENST00000502484 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PDE4D-208ENST00000502484 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PDE4D-208ENST00000502484 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.64□□□□□ -0.39
PDE4D-208ENST00000502484 CHD1O14646 1710 aa12.64□□□□□ -0.39
PDE4D-208ENST00000502484 SYNJ2O15056 1496 aa12.63□□□□□ -0.39
PDE4D-208ENST00000502484 ADAMTS12P58397 1594 aa12.62□□□□□ -0.39
PDE4D-208ENST00000502484 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.62□□□□□ -0.39
PDE4D-208ENST00000502484 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PDE4D-208ENST00000502484 APLP2Q06481 763 aa12.6□□□□□ -0.39
PDE4D-208ENST00000502484 OSCARQ8IYS5 282 aa12.59□□□□□ -0.39
PDE4D-208ENST00000502484 GRIN2AQ12879 1464 aa12.58□□□□□ -0.4
PDE4D-208ENST00000502484 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PDE4D-208ENST00000502484 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.55□□□□□ -0.4
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K1Q13233 1512 aa12.52□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 CEP170Q5SW79 1584 aa12.5□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 TIAM1Q13009 1591 aa12.49□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 NUP160Q12769 1436 aa12.49□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD9Q5K651 1589 aa12.49□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.48□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.46□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.46□□□□□ -0.41
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.45□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.45□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.44□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 FMN1Q68DA7 1419 aa12.43□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.43□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 P3H3Q8IVL6 736 aa12.42□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.42□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 IQGAP2Q13576 1575 aa12.41□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 JPH4Q96JJ6 628 aa12.41□□□□□ -0.42
PDE4D-208ENST00000502484 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.38□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 SHROOM2Q13796 1616 aa12.38□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF11O15085 1522 aa12.37□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.35□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.35□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.35□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.35□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.35□□□□□ -0.43
PDE4D-208ENST00000502484 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.33□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.32□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.31□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 HECW1Q76N89 1606 aa12.3□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 DISP1Q96F81 1524 aa12.29□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA0556O60303 1618 aa12.29□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.28□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.28□□□□□ -0.44
PDE4D-208ENST00000502484 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.26□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.24□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRGP23470 1445 aa12.24□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.22□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 NCOA2Q15596 1464 aa12.21□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.21□□□□□ -0.45
PDE4D-208ENST00000502484 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.21□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.2□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.18□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 ITGAEP38570 1179 aa12.18□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.16□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.16□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.15□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.15□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 UACAQ9BZF9 1416 aa12.15□□□□□ -0.46
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY10Q96PN6 1610 aa12.14□□□□□ -0.47
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC2Q92887 1545 aa12.12□□□□□ -0.47
PDE4D-208ENST00000502484 ABCA8O94911 1581 aa12.12□□□□□ -0.47
PDE4D-208ENST00000502484 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PDE4D-208ENST00000502484 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
PDE4D-208ENST00000502484 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa12.1□□□□□ -0.47
PDE4D-208ENST00000502484 MIA2Q96PC5 1412 aa12.09□□□□□ -0.47
PDE4D-208ENST00000502484 ARID3CA6NKF2 412 aa12.09□□□□□ -0.47
PDE4D-208ENST00000502484 MAPKBP1O60336 1514 aa12.08□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRKQ15262 1439 aa12.08□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 HFM1A2PYH4 1435 aa12.07□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.06□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.05□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.05□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 ATP10BO94823 1461 aa12.04□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
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