RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498448.1

C1orf109-212, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-212ENST00000498448 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.37■■■□□ 2.45
C1orf109-212ENST00000498448 JPH4Q96JJ6 628 aa30.36■■■□□ 2.45
C1orf109-212ENST00000498448 PRXQ9BXM0 1461 aa30.31■■■□□ 2.44
C1orf109-212ENST00000498448 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.31■■■□□ 2.44
C1orf109-212ENST00000498448 SHROOM2Q13796 1616 aa30.29■■■□□ 2.44
C1orf109-212ENST00000498448 ARAP1Q96P48 1450 aa30.27■■■□□ 2.44
C1orf109-212ENST00000498448 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
C1orf109-212ENST00000498448 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
C1orf109-212ENST00000498448 IQGAP2Q13576 1575 aa30.15■■■□□ 2.42
C1orf109-212ENST00000498448 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.15■■■□□ 2.42
C1orf109-212ENST00000498448 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.1■■■□□ 2.41
C1orf109-212ENST00000498448 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.01■■■□□ 2.4
C1orf109-212ENST00000498448 KIF21BO75037 1637 aa30.01■■■□□ 2.39
C1orf109-212ENST00000498448 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.01■■■□□ 2.39
C1orf109-212ENST00000498448 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.97■■■□□ 2.39
C1orf109-212ENST00000498448 PTPRGP23470 1445 aa29.94■■■□□ 2.38
C1orf109-212ENST00000498448 GOLGA3Q08378 1498 aa29.93■■■□□ 2.38
C1orf109-212ENST00000498448 DISP1Q96F81 1524 aa29.93■■■□□ 2.38
C1orf109-212ENST00000498448 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
C1orf109-212ENST00000498448 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
C1orf109-212ENST00000498448 KIAA0556O60303 1618 aa29.85■■■□□ 2.37
C1orf109-212ENST00000498448 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.82■■■□□ 2.36
C1orf109-212ENST00000498448 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.81■■■□□ 2.36
C1orf109-212ENST00000498448 UACAQ9BZF9 1416 aa29.72■■■□□ 2.35
C1orf109-212ENST00000498448 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
C1orf109-212ENST00000498448 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
C1orf109-212ENST00000498448 P3H3Q8IVL6 736 aa29.7■■■□□ 2.35
C1orf109-212ENST00000498448 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.68■■■□□ 2.34
C1orf109-212ENST00000498448 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.68■■■□□ 2.34
C1orf109-212ENST00000498448 SAMD9Q5K651 1589 aa29.67■■■□□ 2.34
C1orf109-212ENST00000498448 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.63■■■□□ 2.33
C1orf109-212ENST00000498448 ABCC2Q92887 1545 aa29.62■■■□□ 2.33
C1orf109-212ENST00000498448 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.56■■■□□ 2.32
C1orf109-212ENST00000498448 MAPKBP1O60336 1514 aa29.55■■■□□ 2.32
C1orf109-212ENST00000498448 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.54■■■□□ 2.32
C1orf109-212ENST00000498448 ABCA8O94911 1581 aa29.52■■■□□ 2.32
C1orf109-212ENST00000498448 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.51■■■□□ 2.32
C1orf109-212ENST00000498448 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.45■■■□□ 2.31
C1orf109-212ENST00000498448 ASXL2Q76L83 1435 aa29.42■■■□□ 2.3
C1orf109-212ENST00000498448 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.42■■■□□ 2.3
C1orf109-212ENST00000498448 FMN1Q68DA7 1419 aa29.41■■■□□ 2.3
C1orf109-212ENST00000498448 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.4■■■□□ 2.3
C1orf109-212ENST00000498448 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
C1orf109-212ENST00000498448 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.38■■■□□ 2.29
C1orf109-212ENST00000498448 CLIP1P30622 1438 aa29.37■■■□□ 2.29
C1orf109-212ENST00000498448 ATP10BO94823 1461 aa29.32■■■□□ 2.28
C1orf109-212ENST00000498448 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.32■■■□□ 2.28
C1orf109-212ENST00000498448 ARID3CA6NKF2 412 aa29.31■■■□□ 2.28
C1orf109-212ENST00000498448 DIP2BQ9P265 1576 aa29.3■■■□□ 2.28
C1orf109-212ENST00000498448 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
C1orf109-212ENST00000498448 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
C1orf109-212ENST00000498448 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
C1orf109-212ENST00000498448 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf109-212ENST00000498448 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
C1orf109-212ENST00000498448 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf109-212ENST00000498448 CEP162Q5TB80 1403 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf109-212ENST00000498448 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
C1orf109-212ENST00000498448 GLI2P10070 1586 aa29.22■■■□□ 2.27
C1orf109-212ENST00000498448 KCNH8Q96L42 1107 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf109-212ENST00000498448 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf109-212ENST00000498448 HECW1Q76N89 1606 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf109-212ENST00000498448 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf109-212ENST00000498448 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
C1orf109-212ENST00000498448 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.07■■■□□ 2.24
C1orf109-212ENST00000498448 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
C1orf109-212ENST00000498448 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
C1orf109-212ENST00000498448 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf109-212ENST00000498448 CD109Q6YHK3 1445 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf109-212ENST00000498448 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.02■■■□□ 2.24
C1orf109-212ENST00000498448 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.01■■■□□ 2.23
C1orf109-212ENST00000498448 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.99■■■□□ 2.23
C1orf109-212ENST00000498448 TSPOAP1O95153 1857 aa28.97■■■□□ 2.23
C1orf109-212ENST00000498448 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.96■■■□□ 2.23
C1orf109-212ENST00000498448 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf109-212ENST00000498448 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
C1orf109-212ENST00000498448 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf109-212ENST00000498448 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
C1orf109-212ENST00000498448 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.86■■■□□ 2.21
C1orf109-212ENST00000498448 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.85■■■□□ 2.21
C1orf109-212ENST00000498448 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
C1orf109-212ENST00000498448 KDM6BO15054 1643 aa28.84■■■□□ 2.21
C1orf109-212ENST00000498448 KIF14Q15058 1648 aa28.8■■■□□ 2.2
C1orf109-212ENST00000498448 NEO1Q92859 1461 aa28.78■■■□□ 2.2
C1orf109-212ENST00000498448 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.77■■■□□ 2.2
C1orf109-212ENST00000498448 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.75■■■□□ 2.19
C1orf109-212ENST00000498448 PLCH2O75038 1416 aa28.75■■■□□ 2.19
C1orf109-212ENST00000498448 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.71■■■□□ 2.19
C1orf109-212ENST00000498448 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.7■■■□□ 2.19
C1orf109-212ENST00000498448 FANCAO15360 1455 aa28.7■■■□□ 2.18
C1orf109-212ENST00000498448 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
C1orf109-212ENST00000498448 APLP2Q06481 763 aa28.69■■■□□ 2.18
C1orf109-212ENST00000498448 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.67■■■□□ 2.18
C1orf109-212ENST00000498448 AKNAQ7Z591 1439 aa28.67■■■□□ 2.18
C1orf109-212ENST00000498448 MAP3K1Q13233 1512 aa28.65■■■□□ 2.18
C1orf109-212ENST00000498448 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.65■■■□□ 2.18
C1orf109-212ENST00000498448 TIAM1Q13009 1591 aa28.64■■■□□ 2.18
C1orf109-212ENST00000498448 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.63■■■□□ 2.17
C1orf109-212ENST00000498448 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.6■■■□□ 2.17
C1orf109-212ENST00000498448 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.6■■■□□ 2.17
C1orf109-212ENST00000498448 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116 ms