RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496810.1

COL20A1-208, Transcript of collagen type XX alpha 1 chain, human

TSL 1 (best)

Gene COL20A1, Length 723 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COL20A1-208	ENST00000496810	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.64	■■■□□ 2.98
COL20A1-208	ENST00000496810	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.63	■■■□□ 2.97
COL20A1-208	ENST00000496810	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.61	■■■□□ 2.97
COL20A1-208	ENST00000496810	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
COL20A1-208	ENST00000496810	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.45	■■■□□ 2.95
COL20A1-208	ENST00000496810	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.42	■■■□□ 2.94
COL20A1-208	ENST00000496810	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.39	■■■□□ 2.94
COL20A1-208	ENST00000496810	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.3	■■■□□ 2.92
COL20A1-208	ENST00000496810	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.29	■■■□□ 2.92
COL20A1-208	ENST00000496810	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.26	■■■□□ 2.91
COL20A1-208	ENST00000496810	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.24	■■■□□ 2.91
COL20A1-208	ENST00000496810	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.23	■■■□□ 2.91
COL20A1-208	ENST00000496810	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.19	■■■□□ 2.9
COL20A1-208	ENST00000496810	PTPRG	P23470	1445 aa		33.18	■■■□□ 2.9
COL20A1-208	ENST00000496810	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.17	■■■□□ 2.9
COL20A1-208	ENST00000496810	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
COL20A1-208	ENST00000496810	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.17	■■■□□ 2.9
COL20A1-208	ENST00000496810	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.16	■■■□□ 2.9
COL20A1-208	ENST00000496810	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.09	■■■□□ 2.89
COL20A1-208	ENST00000496810	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.05	■■■□□ 2.88
COL20A1-208	ENST00000496810	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.02	■■■□□ 2.88
COL20A1-208	ENST00000496810	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.01	■■■□□ 2.87
COL20A1-208	ENST00000496810	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.98	■■■□□ 2.87
COL20A1-208	ENST00000496810	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.97	■■■□□ 2.87
COL20A1-208	ENST00000496810	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.95	■■■□□ 2.87
COL20A1-208	ENST00000496810	EEA1	Q15075	1411 aa		32.92	■■■□□ 2.86
COL20A1-208	ENST00000496810	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.91	■■■□□ 2.86
COL20A1-208	ENST00000496810	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
COL20A1-208	ENST00000496810	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.89	■■■□□ 2.86
COL20A1-208	ENST00000496810	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.88	■■■□□ 2.85
COL20A1-208	ENST00000496810	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.86	■■■□□ 2.85
COL20A1-208	ENST00000496810	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.86	■■■□□ 2.85
COL20A1-208	ENST00000496810	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.85	■■■□□ 2.85
COL20A1-208	ENST00000496810	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
COL20A1-208	ENST00000496810	ABCA8	O94911	1581 aa		32.82	■■■□□ 2.84
COL20A1-208	ENST00000496810	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.81	■■■□□ 2.84
COL20A1-208	ENST00000496810	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.8	■■■□□ 2.84
COL20A1-208	ENST00000496810	KIF21B	O75037	1637 aa		32.79	■■■□□ 2.84
COL20A1-208	ENST00000496810	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
COL20A1-208	ENST00000496810	GLI2	P10070	1586 aa		32.72	■■■□□ 2.83
COL20A1-208	ENST00000496810	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.69	■■■□□ 2.82
COL20A1-208	ENST00000496810	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
COL20A1-208	ENST00000496810	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.65	■■■□□ 2.82
COL20A1-208	ENST00000496810	KDM6B	O15054	1643 aa		32.64	■■■□□ 2.82
COL20A1-208	ENST00000496810	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.62	■■■□□ 2.81
COL20A1-208	ENST00000496810	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
COL20A1-208	ENST00000496810	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.56	■■■□□ 2.8
COL20A1-208	ENST00000496810	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.56	■■■□□ 2.8
COL20A1-208	ENST00000496810	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.53	■■■□□ 2.8
COL20A1-208	ENST00000496810	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.52	■■■□□ 2.8
COL20A1-208	ENST00000496810	ATP10B	O94823	1461 aa		32.48	■■■□□ 2.79
COL20A1-208	ENST00000496810	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.48	■■■□□ 2.79
COL20A1-208	ENST00000496810	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.44	■■■□□ 2.78
COL20A1-208	ENST00000496810	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
COL20A1-208	ENST00000496810	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
COL20A1-208	ENST00000496810	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.36	■■■□□ 2.77
COL20A1-208	ENST00000496810	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.36	■■■□□ 2.77
COL20A1-208	ENST00000496810	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
COL20A1-208	ENST00000496810	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.31	■■■□□ 2.76
COL20A1-208	ENST00000496810	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.3	■■■□□ 2.76
COL20A1-208	ENST00000496810	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.3	■■■□□ 2.76
COL20A1-208	ENST00000496810	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.29	■■■□□ 2.76
COL20A1-208	ENST00000496810	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
COL20A1-208	ENST00000496810	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
COL20A1-208	ENST00000496810	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
COL20A1-208	ENST00000496810	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
COL20A1-208	ENST00000496810	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.13	■■■□□ 2.73
COL20A1-208	ENST00000496810	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.13	■■■□□ 2.73
COL20A1-208	ENST00000496810	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.09	■■■□□ 2.73
COL20A1-208	ENST00000496810	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.09	■■■□□ 2.73
COL20A1-208	ENST00000496810	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.05	■■■□□ 2.72
COL20A1-208	ENST00000496810	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.04	■■■□□ 2.72
COL20A1-208	ENST00000496810	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.03	■■■□□ 2.72
COL20A1-208	ENST00000496810	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
COL20A1-208	ENST00000496810	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.99	■■■□□ 2.71
COL20A1-208	ENST00000496810	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.98	■■■□□ 2.71
COL20A1-208	ENST00000496810	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.97	■■■□□ 2.71
COL20A1-208	ENST00000496810	NEO1	Q92859	1461 aa		31.97	■■■□□ 2.71
COL20A1-208	ENST00000496810	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
COL20A1-208	ENST00000496810	KIF14	Q15058	1648 aa		31.95	■■■□□ 2.71
COL20A1-208	ENST00000496810	CLIP1	P30622	1438 aa		31.88	■■■□□ 2.69
COL20A1-208	ENST00000496810	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.88	■■■□□ 2.69
COL20A1-208	ENST00000496810	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.87	■■■□□ 2.69
COL20A1-208	ENST00000496810	FANCA	O15360	1455 aa		31.86	■■■□□ 2.69
COL20A1-208	ENST00000496810	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.86	■■■□□ 2.69
COL20A1-208	ENST00000496810	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.85	■■■□□ 2.69
COL20A1-208	ENST00000496810	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.85	■■■□□ 2.69
COL20A1-208	ENST00000496810	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.84	■■■□□ 2.69
COL20A1-208	ENST00000496810	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
COL20A1-208	ENST00000496810	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.8	■■■□□ 2.68
COL20A1-208	ENST00000496810	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.79	■■■□□ 2.68
COL20A1-208	ENST00000496810	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.77	■■■□□ 2.68
COL20A1-208	ENST00000496810	PLCH2	O75038	1416 aa		31.75	■■■□□ 2.67
COL20A1-208	ENST00000496810	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
COL20A1-208	ENST00000496810	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.73	■■■□□ 2.67
COL20A1-208	ENST00000496810	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
COL20A1-208	ENST00000496810	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.69	■■■□□ 2.66
COL20A1-208	ENST00000496810	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.69	■■■□□ 2.66
COL20A1-208	ENST00000496810	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.67	■■■□□ 2.66
COL20A1-208	ENST00000496810	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.65	■■■□□ 2.66

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