RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496786.5

SPEG-222, Transcript of SPEG complex locus, human

TSL 4

Gene SPEG, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPEG-222	ENST00000496786	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SPEG-222	ENST00000496786	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SPEG-222	ENST00000496786	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SPEG-222	ENST00000496786	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SPEG-222	ENST00000496786	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SPEG-222	ENST00000496786	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SPEG-222	ENST00000496786	EEA1	Q15075	1411 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SPEG-222	ENST00000496786	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SPEG-222	ENST00000496786	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SPEG-222	ENST00000496786	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SPEG-222	ENST00000496786	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SPEG-222	ENST00000496786	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SPEG-222	ENST00000496786	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
SPEG-222	ENST00000496786	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SPEG-222	ENST00000496786	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SPEG-222	ENST00000496786	PTPRG	P23470	1445 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SPEG-222	ENST00000496786	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SPEG-222	ENST00000496786	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SPEG-222	ENST00000496786	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SPEG-222	ENST00000496786	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32	■■■□□ 2.71
SPEG-222	ENST00000496786	KIF21B	O75037	1637 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SPEG-222	ENST00000496786	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	31.97	■■■□□ 2.71
SPEG-222	ENST00000496786	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
SPEG-222	ENST00000496786	MAPKBP1	O60336	1514 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SPEG-222	ENST00000496786	UACA	Q9BZF9	1416 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SPEG-222	ENST00000496786	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SPEG-222	ENST00000496786	ABCC2	Q92887	1545 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SPEG-222	ENST00000496786	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SPEG-222	ENST00000496786	SAMD9	Q5K651	1589 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SPEG-222	ENST00000496786	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SPEG-222	ENST00000496786	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SPEG-222	ENST00000496786	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SPEG-222	ENST00000496786	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SPEG-222	ENST00000496786	ABCA8	O94911	1581 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SPEG-222	ENST00000496786	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SPEG-222	ENST00000496786	P3H3	Q8IVL6	736 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SPEG-222	ENST00000496786	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SPEG-222	ENST00000496786	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SPEG-222	ENST00000496786	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
SPEG-222	ENST00000496786	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SPEG-222	ENST00000496786	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
SPEG-222	ENST00000496786	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SPEG-222	ENST00000496786	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SPEG-222	ENST00000496786	GLI2	P10070	1586 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SPEG-222	ENST00000496786	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SPEG-222	ENST00000496786	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SPEG-222	ENST00000496786	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
SPEG-222	ENST00000496786	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SPEG-222	ENST00000496786	ATP10B	O94823	1461 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SPEG-222	ENST00000496786	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SPEG-222	ENST00000496786	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SPEG-222	ENST00000496786	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
SPEG-222	ENST00000496786	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
SPEG-222	ENST00000496786	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SPEG-222	ENST00000496786	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.32	■■■□□ 2.61
SPEG-222	ENST00000496786	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.29	■■■□□ 2.6
SPEG-222	ENST00000496786	KDM6B	O15054	1643 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SPEG-222	ENST00000496786	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SPEG-222	ENST00000496786	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
SPEG-222	ENST00000496786	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
SPEG-222	ENST00000496786	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SPEG-222	ENST00000496786	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SPEG-222	ENST00000496786	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SPEG-222	ENST00000496786	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SPEG-222	ENST00000496786	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SPEG-222	ENST00000496786	CLIP1	P30622	1438 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SPEG-222	ENST00000496786	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SPEG-222	ENST00000496786	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
SPEG-222	ENST00000496786	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
SPEG-222	ENST00000496786	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
SPEG-222	ENST00000496786	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SPEG-222	ENST00000496786	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SPEG-222	ENST00000496786	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
SPEG-222	ENST00000496786	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
SPEG-222	ENST00000496786	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		30.98	■■■□□ 2.55
SPEG-222	ENST00000496786	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	30.97	■■■□□ 2.55
SPEG-222	ENST00000496786	CEP162	Q5TB80	1403 aa		30.97	■■■□□ 2.55
SPEG-222	ENST00000496786	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		30.96	■■■□□ 2.55
SPEG-222	ENST00000496786	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		30.94	■■■□□ 2.54
SPEG-222	ENST00000496786	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		30.92	■■■□□ 2.54
SPEG-222	ENST00000496786	NEO1	Q92859	1461 aa		30.91	■■■□□ 2.54
SPEG-222	ENST00000496786	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		30.91	■■■□□ 2.54
SPEG-222	ENST00000496786	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	30.9	■■■□□ 2.54
SPEG-222	ENST00000496786	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		30.88	■■■□□ 2.53
SPEG-222	ENST00000496786	KIF14	Q15058	1648 aa		30.87	■■■□□ 2.53
SPEG-222	ENST00000496786	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		30.86	■■■□□ 2.53
SPEG-222	ENST00000496786	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		30.8	■■■□□ 2.52
SPEG-222	ENST00000496786	FANCA	O15360	1455 aa		30.8	■■■□□ 2.52
SPEG-222	ENST00000496786	PLCH2	O75038	1416 aa		30.78	■■■□□ 2.52
SPEG-222	ENST00000496786	AKNA	Q7Z591	1439 aa		30.75	■■■□□ 2.51
SPEG-222	ENST00000496786	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		30.69	■■■□□ 2.5
SPEG-222	ENST00000496786	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	30.68	■■■□□ 2.5
SPEG-222	ENST00000496786	RAPGEF3	O95398	923 aa		30.67	■■■□□ 2.5
SPEG-222	ENST00000496786	RICTOR	Q6R327	1708 aa		30.67	■■■□□ 2.5
SPEG-222	ENST00000496786	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	30.66	■■■□□ 2.5
SPEG-222	ENST00000496786	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		30.65	■■■□□ 2.5
SPEG-222	ENST00000496786	ADGRL1	O94910	1474 aa		30.63	■■■□□ 2.49
SPEG-222	ENST00000496786	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		30.63	■■■□□ 2.49
SPEG-222	ENST00000496786	PREX2	Q70Z35	1606 aa		30.63	■■■□□ 2.49
SPEG-222	ENST00000496786	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		30.63	■■■□□ 2.49

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