RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496573.1

PRRX1-206, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRX1, Length 362 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-206ENST00000496573 GAPVD1Q14C86 1478 aa5.92□□□□□ -1.46
PRRX1-206ENST00000496573 ADAMTS12P58397 1594 aa5.92□□□□□ -1.46
PRRX1-206ENST00000496573 FBLN2P98095 1184 aa5.91□□□□□ -1.46
PRRX1-206ENST00000496573 NUP160Q12769 1436 aa5.91□□□□□ -1.46
PRRX1-206ENST00000496573 GRIN2AQ12879 1464 aa5.9□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 CEP170Q5SW79 1584 aa5.89□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 TOP2BQ02880 1626 aa5.88□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.88□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.88□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 SHROOM2Q13796 1616 aa5.88□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.86□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 FHAD1B1AJZ9 1412 aa5.86□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 TRHP20396 242 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRRX1-206ENST00000496573 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.84□□□□□ -1.48
PRRX1-206ENST00000496573 MAPKBP1O60336 1514 aa5.79□□□□□ -1.48
PRRX1-206ENST00000496573 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRRX1-206ENST00000496573 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRRX1-206ENST00000496573 KIF13AQ9H1H9 1805 aa5.77□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.77□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 ABCC10Q5T3U5 1492 aa5.77□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 DIP2BQ9P265 1576 aa5.76□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 CUL7Q14999 1698 aa5.76□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 DCAF8L1A6NGE4 600 aa5.76□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa5.75□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 JPH4Q96JJ6 628 aa5.75□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 IGF1RP08069 1367 aa5.75□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 KIF27Q86VH2 1401 aa5.74□□□□□ -1.49
PRRX1-206ENST00000496573 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 ABCC2Q92887 1545 aa5.7□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 IQGAP2Q13576 1575 aa5.7□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.7□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 KDM6BO15054 1643 aa5.7□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.69□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 FAM69CQ0P6D2 419 aa5.69□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 DISP1Q96F81 1524 aa5.69□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 TNIKQ9UKE5 1360 aa5.68□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 GLI2P10070 1586 aa5.68□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 PTPRGP23470 1445 aa5.68□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.68□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 ASXL2Q76L83 1435 aa5.67□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.67□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 KIAA0556O60303 1618 aa5.66□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa5.66□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.66□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 UACAQ9BZF9 1416 aa5.65□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa5.65□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa5.65□□□□□ -1.5
PRRX1-206ENST00000496573 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.65□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa5.64□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 TSPOAP1O95153 1857 aa5.63□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 LHX8Q68G74 356 aa5.63□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 ADGRL1O94910 1474 aa5.62□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.62□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 PRXQ9BXM0 1461 aa5.62□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.62□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 ABCA8O94911 1581 aa5.62□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa5.61□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.6□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa5.6□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 GOLGA3Q08378 1498 aa5.59□□□□□ -1.51
PRRX1-206ENST00000496573 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.57□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 SAMD9Q5K651 1589 aa5.57□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.56□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 CD109Q6YHK3 1445 aa5.56□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.55□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.55□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5.54□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 ATP10BO94823 1461 aa5.53□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 KIF21BO75037 1637 aa5.53□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa5.53□□□□□ -1.52
PRRX1-206ENST00000496573 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.52□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa5.52□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 NEO1Q92859 1461 aa5.51□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.51□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 ADAMTSL3P82987 1691 aa5.5□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 EEA1Q15075 1411 aa5.5□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.49□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.49□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa5.48□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 PTPRMP28827 1452 aa5.48□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 DSG3P32926 999 aa5.48□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 KCNH8Q96L42 1107 aa5.48□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.48□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.47□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 RICTORQ6R327 1708 aa5.47□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 MADDQ8WXG6 1647 aa5.47□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
PRRX1-206ENST00000496573 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.46□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms