RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNJ2O15056 1496 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 ARAP1Q96P48 1450 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-213ENST00000496055 CHD1O14646 1710 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-213ENST00000496055 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-213ENST00000496055 CUX1P39880 1505 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP6R1Q9UPN7 881 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXD1Q16676 465 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-213ENST00000496055 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.09□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 GRIN2AQ12879 1464 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 JPH4Q96JJ6 628 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 ADRA2BP18089 450 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 HRCP23327 699 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF27Q86VH2 1401 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 PBRM1Q86U86 1689 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP160Q12769 1436 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-213ENST00000496055 HOMEZQ8IX15 550 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTS12P58397 1594 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 TOP2BQ02880 1626 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP170Q5SW79 1584 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRGP23470 1445 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 IGF1RP08069 1367 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 CUL7Q14999 1698 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 SHROOM2Q13796 1616 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPKBP1O60336 1514 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA3Q08378 1498 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNA4P22459 653 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE4CQ08493 712 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 UACAQ9BZF9 1416 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM6BO15054 1643 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC2Q92887 1545 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 ASXL2Q76L83 1435 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNH8Q96L42 1107 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 IQGAP2Q13576 1575 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 NEFLP07196 543 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 DIP2BQ9P265 1576 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-213ENST00000496055 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 CD109Q6YHK3 1445 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 GLI2P10070 1586 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 C14orf37Q86TY3 774 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPOAP1O95153 1857 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 P3H3Q8IVL6 736 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 EEA1Q15075 1411 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRL1O94910 1474 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 ARID3CA6NKF2 412 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-213ENST00000496055 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0556O60303 1618 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms