RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495360.5

APTX-232, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 5

Gene APTX, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-232ENST00000495360 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
APTX-232ENST00000495360 JPH4Q96JJ6 628 aa29.81■■■□□ 2.36
APTX-232ENST00000495360 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.75■■■□□ 2.35
APTX-232ENST00000495360 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.73■■■□□ 2.35
APTX-232ENST00000495360 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.53■■■□□ 2.32
APTX-232ENST00000495360 IQGAP2Q13576 1575 aa29.52■■■□□ 2.32
APTX-232ENST00000495360 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.45■■■□□ 2.3
APTX-232ENST00000495360 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.45■■■□□ 2.3
APTX-232ENST00000495360 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
APTX-232ENST00000495360 PTPRGP23470 1445 aa29.39■■■□□ 2.3
APTX-232ENST00000495360 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.37■■■□□ 2.29
APTX-232ENST00000495360 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
APTX-232ENST00000495360 MAPKBP1O60336 1514 aa29.35■■■□□ 2.29
APTX-232ENST00000495360 DISP1Q96F81 1524 aa29.33■■■□□ 2.29
APTX-232ENST00000495360 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.32■■■□□ 2.28
APTX-232ENST00000495360 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.32■■■□□ 2.28
APTX-232ENST00000495360 PRXQ9BXM0 1461 aa29.3■■■□□ 2.28
APTX-232ENST00000495360 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.28■■■□□ 2.28
APTX-232ENST00000495360 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.28■■■□□ 2.28
APTX-232ENST00000495360 KIAA0556O60303 1618 aa29.25■■■□□ 2.27
APTX-232ENST00000495360 DIP2BQ9P265 1576 aa29.23■■■□□ 2.27
APTX-232ENST00000495360 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.22■■■□□ 2.27
APTX-232ENST00000495360 ABCC2Q92887 1545 aa29.21■■■□□ 2.27
APTX-232ENST00000495360 UACAQ9BZF9 1416 aa29.2■■■□□ 2.26
APTX-232ENST00000495360 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.19■■■□□ 2.26
APTX-232ENST00000495360 GOLGA3Q08378 1498 aa29.13■■■□□ 2.25
APTX-232ENST00000495360 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.13■■■□□ 2.25
APTX-232ENST00000495360 EEA1Q15075 1411 aa29.1■■■□□ 2.25
APTX-232ENST00000495360 ASXL2Q76L83 1435 aa29.08■■■□□ 2.24
APTX-232ENST00000495360 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.05■■■□□ 2.24
APTX-232ENST00000495360 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.05■■■□□ 2.24
APTX-232ENST00000495360 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
APTX-232ENST00000495360 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
APTX-232ENST00000495360 TSPOAP1O95153 1857 aa28.96■■■□□ 2.23
APTX-232ENST00000495360 GLI2P10070 1586 aa28.95■■■□□ 2.23
APTX-232ENST00000495360 ABCA8O94911 1581 aa28.95■■■□□ 2.22
APTX-232ENST00000495360 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
APTX-232ENST00000495360 KDM6BO15054 1643 aa28.9■■■□□ 2.22
APTX-232ENST00000495360 P3H3Q8IVL6 736 aa28.89■■■□□ 2.21
APTX-232ENST00000495360 SAMD9Q5K651 1589 aa28.88■■■□□ 2.21
APTX-232ENST00000495360 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.87■■■□□ 2.21
APTX-232ENST00000495360 KIF21BO75037 1637 aa28.86■■■□□ 2.21
APTX-232ENST00000495360 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.85■■■□□ 2.21
APTX-232ENST00000495360 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
APTX-232ENST00000495360 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.82■■■□□ 2.2
APTX-232ENST00000495360 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
APTX-232ENST00000495360 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
APTX-232ENST00000495360 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.73■■■□□ 2.19
APTX-232ENST00000495360 ARID3CA6NKF2 412 aa28.72■■■□□ 2.19
APTX-232ENST00000495360 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.71■■■□□ 2.19
APTX-232ENST00000495360 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.7■■■□□ 2.19
APTX-232ENST00000495360 ATP10BO94823 1461 aa28.7■■■□□ 2.18
APTX-232ENST00000495360 KCNH8Q96L42 1107 aa28.69■■■□□ 2.18
APTX-232ENST00000495360 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.66■■■□□ 2.18
APTX-232ENST00000495360 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.66■■■□□ 2.18
APTX-232ENST00000495360 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.65■■■□□ 2.18
APTX-232ENST00000495360 CD109Q6YHK3 1445 aa28.63■■■□□ 2.17
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APTX-232ENST00000495360 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
APTX-232ENST00000495360 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
APTX-232ENST00000495360 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.49■■■□□ 2.15
APTX-232ENST00000495360 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.44■■■□□ 2.14
APTX-232ENST00000495360 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.42■■■□□ 2.14
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APTX-232ENST00000495360 FMN1Q68DA7 1419 aa28.39■■■□□ 2.14
APTX-232ENST00000495360 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
APTX-232ENST00000495360 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.36■■■□□ 2.13
APTX-232ENST00000495360 HECW1Q76N89 1606 aa28.34■■■□□ 2.13
APTX-232ENST00000495360 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.33■■■□□ 2.13
APTX-232ENST00000495360 ADGRL1O94910 1474 aa28.32■■■□□ 2.12
APTX-232ENST00000495360 NEO1Q92859 1461 aa28.31■■■□□ 2.12
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APTX-232ENST00000495360 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.25■■■□□ 2.11
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APTX-232ENST00000495360 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.19■■■□□ 2.1
APTX-232ENST00000495360 FANCAO15360 1455 aa28.18■■■□□ 2.1
APTX-232ENST00000495360 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.17■■■□□ 2.1
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APTX-232ENST00000495360 CLIP1P30622 1438 aa28.12■■■□□ 2.09
APTX-232ENST00000495360 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.12■■■□□ 2.09
APTX-232ENST00000495360 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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APTX-232ENST00000495360 RICTORQ6R327 1708 aa28.07■■■□□ 2.08
APTX-232ENST00000495360 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.05■■■□□ 2.08
APTX-232ENST00000495360 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.04■■■□□ 2.08
APTX-232ENST00000495360 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.02■■■□□ 2.08
APTX-232ENST00000495360 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.99■■■□□ 2.07
APTX-232ENST00000495360 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.98■■■□□ 2.07
APTX-232ENST00000495360 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.97■■■□□ 2.07
APTX-232ENST00000495360 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.96■■■□□ 2.07
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