RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495221.1

PDE1C-211, Transcript of phosphodiesterase 1C, humanhuman

TSL 4

Gene PDE1C, Length 540 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1C-211ENST00000495221 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
PDE1C-211ENST00000495221 JPH4Q96JJ6 628 aa37.52■■■■□ 3.6
PDE1C-211ENST00000495221 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.46■■■■□ 3.59
PDE1C-211ENST00000495221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.39■■■■□ 3.58
PDE1C-211ENST00000495221 IQGAP2Q13576 1575 aa37.2■■■■□ 3.55
PDE1C-211ENST00000495221 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.17■■■■□ 3.54
PDE1C-211ENST00000495221 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.17■■■■□ 3.54
PDE1C-211ENST00000495221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.13■■■■□ 3.54
PDE1C-211ENST00000495221 MAPKBP1O60336 1514 aa37.1■■■■□ 3.53
PDE1C-211ENST00000495221 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.07■■■■□ 3.52
PDE1C-211ENST00000495221 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.02■■■■□ 3.52
PDE1C-211ENST00000495221 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.99■■■■□ 3.51
PDE1C-211ENST00000495221 PTPRGP23470 1445 aa36.99■■■■□ 3.51
PDE1C-211ENST00000495221 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.97■■■■□ 3.51
PDE1C-211ENST00000495221 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.97■■■■□ 3.51
PDE1C-211ENST00000495221 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.95■■■■□ 3.51
PDE1C-211ENST00000495221 DISP1Q96F81 1524 aa36.94■■■■□ 3.5
PDE1C-211ENST00000495221 DIP2BQ9P265 1576 aa36.93■■■■□ 3.5
PDE1C-211ENST00000495221 KIAA0556O60303 1618 aa36.86■■■■□ 3.49
PDE1C-211ENST00000495221 PRXQ9BXM0 1461 aa36.84■■■■□ 3.49
PDE1C-211ENST00000495221 ABCC2Q92887 1545 aa36.83■■■■□ 3.49
PDE1C-211ENST00000495221 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.82■■■■□ 3.49
PDE1C-211ENST00000495221 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.79■■■■□ 3.48
PDE1C-211ENST00000495221 UACAQ9BZF9 1416 aa36.76■■■■□ 3.47
PDE1C-211ENST00000495221 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
PDE1C-211ENST00000495221 GOLGA3Q08378 1498 aa36.69■■■■□ 3.46
PDE1C-211ENST00000495221 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
PDE1C-211ENST00000495221 TSPOAP1O95153 1857 aa36.66■■■■□ 3.46
PDE1C-211ENST00000495221 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.65■■■■□ 3.46
PDE1C-211ENST00000495221 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.64■■■■□ 3.46
PDE1C-211ENST00000495221 ASXL2Q76L83 1435 aa36.62■■■■□ 3.45
PDE1C-211ENST00000495221 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
PDE1C-211ENST00000495221 GLI2P10070 1586 aa36.59■■■■□ 3.45
PDE1C-211ENST00000495221 EEA1Q15075 1411 aa36.59■■■■□ 3.45
PDE1C-211ENST00000495221 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.53■■■■□ 3.44
PDE1C-211ENST00000495221 KDM6BO15054 1643 aa36.52■■■■□ 3.44
PDE1C-211ENST00000495221 ABCA8O94911 1581 aa36.49■■■■□ 3.43
PDE1C-211ENST00000495221 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
PDE1C-211ENST00000495221 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
PDE1C-211ENST00000495221 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.41■■■■□ 3.42
PDE1C-211ENST00000495221 SAMD9Q5K651 1589 aa36.4■■■■□ 3.42
PDE1C-211ENST00000495221 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.37■■■■□ 3.41
PDE1C-211ENST00000495221 KIF21BO75037 1637 aa36.3■■■■□ 3.4
PDE1C-211ENST00000495221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
PDE1C-211ENST00000495221 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.25■■■■□ 3.39
PDE1C-211ENST00000495221 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.23■■■■□ 3.39
PDE1C-211ENST00000495221 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.18■■■■□ 3.38
PDE1C-211ENST00000495221 P3H3Q8IVL6 736 aa36.17■■■■□ 3.38
PDE1C-211ENST00000495221 ATP10BO94823 1461 aa36.11■■■■□ 3.37
PDE1C-211ENST00000495221 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.09■■■■□ 3.37
PDE1C-211ENST00000495221 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.09■■■■□ 3.37
PDE1C-211ENST00000495221 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.09■■■■□ 3.37
PDE1C-211ENST00000495221 CD109Q6YHK3 1445 aa36.06■■■■□ 3.36
PDE1C-211ENST00000495221 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
PDE1C-211ENST00000495221 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.02■■■■□ 3.36
PDE1C-211ENST00000495221 KCNH8Q96L42 1107 aa36.01■■■■□ 3.36
PDE1C-211ENST00000495221 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.97■■■■□ 3.35
PDE1C-211ENST00000495221 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
PDE1C-211ENST00000495221 ARID3CA6NKF2 412 aa35.93■■■■□ 3.34
PDE1C-211ENST00000495221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
PDE1C-211ENST00000495221 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.85■■■■□ 3.33
PDE1C-211ENST00000495221 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.8■■■■□ 3.32
PDE1C-211ENST00000495221 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
PDE1C-211ENST00000495221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PDE1C-211ENST00000495221 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PDE1C-211ENST00000495221 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.76■■■■□ 3.32
PDE1C-211ENST00000495221 ADGRL1O94910 1474 aa35.74■■■■□ 3.31
PDE1C-211ENST00000495221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.73■■■■□ 3.31
PDE1C-211ENST00000495221 NEO1Q92859 1461 aa35.72■■■■□ 3.31
PDE1C-211ENST00000495221 FMN1Q68DA7 1419 aa35.71■■■■□ 3.31
PDE1C-211ENST00000495221 HECW1Q76N89 1606 aa35.68■■■■□ 3.3
PDE1C-211ENST00000495221 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.68■■■■□ 3.3
PDE1C-211ENST00000495221 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.68■■■■□ 3.3
PDE1C-211ENST00000495221 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
PDE1C-211ENST00000495221 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.62■■■■□ 3.29
PDE1C-211ENST00000495221 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.62■■■■□ 3.29
PDE1C-211ENST00000495221 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.58■■■■□ 3.29
PDE1C-211ENST00000495221 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.54■■■■□ 3.28
PDE1C-211ENST00000495221 RICTORQ6R327 1708 aa35.49■■■■□ 3.27
PDE1C-211ENST00000495221 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.49■■■■□ 3.27
PDE1C-211ENST00000495221 FANCAO15360 1455 aa35.48■■■■□ 3.27
PDE1C-211ENST00000495221 AKNAQ7Z591 1439 aa35.44■■■■□ 3.26
PDE1C-211ENST00000495221 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.43■■■■□ 3.26
PDE1C-211ENST00000495221 RAPGEF3O95398 923 aa35.43■■■■□ 3.26
PDE1C-211ENST00000495221 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PDE1C-211ENST00000495221 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PDE1C-211ENST00000495221 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PDE1C-211ENST00000495221 KIF14Q15058 1648 aa35.39■■■■□ 3.26
PDE1C-211ENST00000495221 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
PDE1C-211ENST00000495221 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.37■■■■□ 3.25
PDE1C-211ENST00000495221 PLCH2O75038 1416 aa35.36■■■■□ 3.25
PDE1C-211ENST00000495221 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
PDE1C-211ENST00000495221 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.35■■■■□ 3.25
PDE1C-211ENST00000495221 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.33■■■■□ 3.25
PDE1C-211ENST00000495221 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.33■■■■□ 3.25
PDE1C-211ENST00000495221 CLIP1P30622 1438 aa35.32■■■■□ 3.24
PDE1C-211ENST00000495221 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.3■■■■□ 3.24
PDE1C-211ENST00000495221 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.28■■■■□ 3.24
PDE1C-211ENST00000495221 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.26■■■■□ 3.23
PDE1C-211ENST00000495221 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.23■■■■□ 3.23
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