RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493902.5

STX4-211, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 5

Gene STX4, Length 1,588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-211ENST00000493902 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
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STX4-211ENST00000493902 CEP170Q5SW79 1584 aa35.17■■■■□ 3.22
STX4-211ENST00000493902 IQGAP2Q13576 1575 aa35.15■■■■□ 3.22
STX4-211ENST00000493902 NUP160Q12769 1436 aa35.14■■■■□ 3.22
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STX4-211ENST00000493902 TIAM1Q13009 1591 aa34.42■■■■□ 3.1
STX4-211ENST00000493902 MAP3K1Q13233 1512 aa34.42■■■■□ 3.1
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STX4-211ENST00000493902 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.41■■■■□ 3.1
STX4-211ENST00000493902 PTPRGP23470 1445 aa34.39■■■■□ 3.1
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STX4-211ENST00000493902 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.96■■■■□ 3.03
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STX4-211ENST00000493902 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.7■■■□□ 2.99
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STX4-211ENST00000493902 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.59■■■□□ 2.97
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STX4-211ENST00000493902 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.963e-8■□□□□ 8.2
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STX4-211ENST00000493902 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.96
STX4-211ENST00000493902 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.55■■■□□ 2.96
STX4-211ENST00000493902 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
STX4-211ENST00000493902 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
STX4-211ENST00000493902 PREX2Q70Z35 1606 aa33.47■■■□□ 2.95
STX4-211ENST00000493902 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.45■■■□□ 2.95
STX4-211ENST00000493902 ITGAEP38570 1179 aa33.45■■■□□ 2.95
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STX4-211ENST00000493902 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.43■■■□□ 2.94
STX4-211ENST00000493902 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.4■■■□□ 2.94
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