RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493826.1

ATP11B-209, Transcript of ATPase phospholipid transporting 11B (putative), human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP11B, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP11B-209	ENST00000493826	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.41	■■■■■ 4.22
ATP11B-209	ENST00000493826	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.38	■■■■■ 4.21
ATP11B-209	ENST00000493826	IGF1R	P08069	1367 aa		41.36	■■■■■ 4.21
ATP11B-209	ENST00000493826	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		41.32	■■■■■ 4.2
ATP11B-209	ENST00000493826	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		41.22	■■■■■ 4.19
ATP11B-209	ENST00000493826	MAPKBP1	O60336	1514 aa		41.19	■■■■■ 4.18
ATP11B-209	ENST00000493826	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.14	■■■■■ 4.18
ATP11B-209	ENST00000493826	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.14	■■■■■ 4.18
ATP11B-209	ENST00000493826	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.11	■■■■■ 4.17
ATP11B-209	ENST00000493826	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.09	■■■■■ 4.17
ATP11B-209	ENST00000493826	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.08	■■■■■ 4.17
ATP11B-209	ENST00000493826	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.02	■■■■■ 4.16
ATP11B-209	ENST00000493826	IQGAP2	Q13576	1575 aa		40.95	■■■■■ 4.15
ATP11B-209	ENST00000493826	PTPRG	P23470	1445 aa		40.92	■■■■■ 4.14
ATP11B-209	ENST00000493826	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		40.9	■■■■■ 4.14
ATP11B-209	ENST00000493826	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		40.86	■■■■■ 4.13
ATP11B-209	ENST00000493826	ABCC2	Q92887	1545 aa		40.77	■■■■■ 4.12
ATP11B-209	ENST00000493826	TSPOAP1	O95153	1857 aa		40.77	■■■■■ 4.12
ATP11B-209	ENST00000493826	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
ATP11B-209	ENST00000493826	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.74	■■■■■ 4.11
ATP11B-209	ENST00000493826	KDM6B	O15054	1643 aa		40.74	■■■■■ 4.11
ATP11B-209	ENST00000493826	DISP1	Q96F81	1524 aa		40.73	■■■■■ 4.11
ATP11B-209	ENST00000493826	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		40.7	■■■■■ 4.11
ATP11B-209	ENST00000493826	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		40.67	■■■■■ 4.1
ATP11B-209	ENST00000493826	UACA	Q9BZF9	1416 aa		40.64	■■■■■ 4.1
ATP11B-209	ENST00000493826	ASXL2	Q76L83	1435 aa		40.62	■■■■■ 4.09
ATP11B-209	ENST00000493826	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		40.62	■■■■■ 4.09
ATP11B-209	ENST00000493826	KIAA0556	O60303	1618 aa		40.59	■■■■■ 4.09
ATP11B-209	ENST00000493826	GLI2	P10070	1586 aa		40.58	■■■■■ 4.09
ATP11B-209	ENST00000493826	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ATP11B-209	ENST00000493826	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	40.51	■■■■■ 4.08
ATP11B-209	ENST00000493826	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		40.51	■■■■■ 4.08
ATP11B-209	ENST00000493826	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
ATP11B-209	ENST00000493826	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
ATP11B-209	ENST00000493826	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		40.38	■■■■■ 4.05
ATP11B-209	ENST00000493826	GOLGA3	Q08378	1498 aa		40.32	■■■■■ 4.04
ATP11B-209	ENST00000493826	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.3	■■■■■ 4.04
ATP11B-209	ENST00000493826	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.27	■■■■■ 4.04
ATP11B-209	ENST00000493826	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		40.24	■■■■■ 4.03
ATP11B-209	ENST00000493826	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		40.24	■■■■■ 4.03
ATP11B-209	ENST00000493826	ABCA8	O94911	1581 aa		40.21	■■■■■ 4.03
ATP11B-209	ENST00000493826	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
ATP11B-209	ENST00000493826	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.06	■■■■■ 4
ATP11B-209	ENST00000493826	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.01	■■■■■ 4
ATP11B-209	ENST00000493826	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		39.99	■■■■□ 3.99
ATP11B-209	ENST00000493826	CD109	Q6YHK3	1445 aa		39.96	■■■■□ 3.99
ATP11B-209	ENST00000493826	SAMD9	Q5K651	1589 aa		39.91	■■■■□ 3.98
ATP11B-209	ENST00000493826	KCNH8	Q96L42	1107 aa		39.89	■■■■□ 3.98
ATP11B-209	ENST00000493826	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		39.87	■■■■□ 3.97
ATP11B-209	ENST00000493826	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	39.84	■■■■□ 3.97
ATP11B-209	ENST00000493826	P3H3	Q8IVL6	736 aa		39.82	■■■■□ 3.97
ATP11B-209	ENST00000493826	ATP10B	O94823	1461 aa		39.81	■■■■□ 3.96
ATP11B-209	ENST00000493826	EEA1	Q15075	1411 aa		39.78	■■■■□ 3.96
ATP11B-209	ENST00000493826	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		39.76	■■■■□ 3.96
ATP11B-209	ENST00000493826	ARID3C	A6NKF2	412 aa		39.74	■■■■□ 3.95
ATP11B-209	ENST00000493826	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		39.72	■■■■□ 3.95
ATP11B-209	ENST00000493826	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		39.67	■■■■□ 3.94
ATP11B-209	ENST00000493826	KIF21B	O75037	1637 aa		39.6	■■■■□ 3.93
ATP11B-209	ENST00000493826	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	39.58	■■■■□ 3.93
ATP11B-209	ENST00000493826	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		39.56	■■■■□ 3.92
ATP11B-209	ENST00000493826	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		39.56	■■■■□ 3.92
ATP11B-209	ENST00000493826	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		39.52	■■■■□ 3.92
ATP11B-209	ENST00000493826	NEO1	Q92859	1461 aa		39.49	■■■■□ 3.91
ATP11B-209	ENST00000493826	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	39.48	■■■■□ 3.91
ATP11B-209	ENST00000493826	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	39.48	■■■■□ 3.91
ATP11B-209	ENST00000493826	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	39.48	■■■■□ 3.91
ATP11B-209	ENST00000493826	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		39.48	■■■■□ 3.91
ATP11B-209	ENST00000493826	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		39.38	■■■■□ 3.9
ATP11B-209	ENST00000493826	RAPGEF3	O95398	923 aa		39.34	■■■■□ 3.89
ATP11B-209	ENST00000493826	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		39.3	■■■■□ 3.88
ATP11B-209	ENST00000493826	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		39.29	■■■■□ 3.88
ATP11B-209	ENST00000493826	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		39.28	■■■■□ 3.88
ATP11B-209	ENST00000493826	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	39.26	■■■■□ 3.88	5e-7	■□□□□ 8.9
ATP11B-209	ENST00000493826	RICTOR	Q6R327	1708 aa		39.23	■■■■□ 3.87
ATP11B-209	ENST00000493826	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		39.23	■■■■□ 3.87
ATP11B-209	ENST00000493826	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		39.21	■■■■□ 3.87
ATP11B-209	ENST00000493826	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		39.2	■■■■□ 3.87
ATP11B-209	ENST00000493826	FANCA	O15360	1455 aa		39.19	■■■■□ 3.86
ATP11B-209	ENST00000493826	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	39.19	■■■■□ 3.86
ATP11B-209	ENST00000493826	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	39.18	■■■■□ 3.86
ATP11B-209	ENST00000493826	AKNA	Q7Z591	1439 aa		39.17	■■■■□ 3.86
ATP11B-209	ENST00000493826	PTPRM	P28827	1452 aa		39.17	■■■■□ 3.86
ATP11B-209	ENST00000493826	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	39.15	■■■■□ 3.86
ATP11B-209	ENST00000493826	MADD	Q8WXG6	1647 aa		39.11	■■■■□ 3.85
ATP11B-209	ENST00000493826	HECW1	Q76N89	1606 aa		39.1	■■■■□ 3.85
ATP11B-209	ENST00000493826	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		39.09	■■■■□ 3.85
ATP11B-209	ENST00000493826	FMN1	Q68DA7	1419 aa		39.08	■■■■□ 3.85
ATP11B-209	ENST00000493826	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	39.07	■■■■□ 3.85
ATP11B-209	ENST00000493826	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	39.06	■■■■□ 3.84
ATP11B-209	ENST00000493826	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		39.05	■■■■□ 3.84
ATP11B-209	ENST00000493826	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		39.02	■■■■□ 3.84
ATP11B-209	ENST00000493826	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		38.99	■■■■□ 3.83
ATP11B-209	ENST00000493826	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		38.98	■■■■□ 3.83
ATP11B-209	ENST00000493826	PLCH2	O75038	1416 aa		38.97	■■■■□ 3.83
ATP11B-209	ENST00000493826	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		38.96	■■■■□ 3.83
ATP11B-209	ENST00000493826	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	38.96	■■■■□ 3.83
ATP11B-209	ENST00000493826	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		38.95	■■■■□ 3.83
ATP11B-209	ENST00000493826	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		38.92	■■■■□ 3.82
ATP11B-209	ENST00000493826	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		38.91	■■■■□ 3.82
ATP11B-209	ENST00000493826	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		38.91	■■■■□ 3.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms