RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493133.1

PBXIP1-205, Transcript of PBX homeobox interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBXIP1, Length 707 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBXIP1-205ENST00000493133 JPH4Q96JJ6 628 aa22.98■■□□□ 1.27
PBXIP1-205ENST00000493133 CUL7Q14999 1698 aa22.97■■□□□ 1.27
PBXIP1-205ENST00000493133 KIF27Q86VH2 1401 aa22.94■■□□□ 1.26
PBXIP1-205ENST00000493133 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.9■■□□□ 1.26
PBXIP1-205ENST00000493133 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.87■■□□□ 1.25
PBXIP1-205ENST00000493133 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.81■■□□□ 1.24
PBXIP1-205ENST00000493133 DIP2BQ9P265 1576 aa22.74■■□□□ 1.23
PBXIP1-205ENST00000493133 MAPKBP1O60336 1514 aa22.73■■□□□ 1.23
PBXIP1-205ENST00000493133 IQGAP2Q13576 1575 aa22.72■■□□□ 1.23
PBXIP1-205ENST00000493133 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.71■■□□□ 1.23
PBXIP1-205ENST00000493133 TSPOAP1O95153 1857 aa22.69■■□□□ 1.22
PBXIP1-205ENST00000493133 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PBXIP1-205ENST00000493133 DISP1Q96F81 1524 aa22.66■■□□□ 1.22
PBXIP1-205ENST00000493133 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.64■■□□□ 1.21
PBXIP1-205ENST00000493133 PTPRGP23470 1445 aa22.63■■□□□ 1.21
PBXIP1-205ENST00000493133 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.61■■□□□ 1.21
PBXIP1-205ENST00000493133 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.59■■□□□ 1.21
PBXIP1-205ENST00000493133 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
PBXIP1-205ENST00000493133 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.59■■□□□ 1.21
PBXIP1-205ENST00000493133 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.57■■□□□ 1.2
PBXIP1-205ENST00000493133 KIAA0556O60303 1618 aa22.56■■□□□ 1.2
PBXIP1-205ENST00000493133 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.56■■□□□ 1.2
PBXIP1-205ENST00000493133 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PBXIP1-205ENST00000493133 ABCC2Q92887 1545 aa22.55■■□□□ 1.2
PBXIP1-205ENST00000493133 KDM6BO15054 1643 aa22.49■■□□□ 1.19
PBXIP1-205ENST00000493133 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PBXIP1-205ENST00000493133 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.49■■□□□ 1.19
PBXIP1-205ENST00000493133 ASXL2Q76L83 1435 aa22.48■■□□□ 1.19
PBXIP1-205ENST00000493133 UACAQ9BZF9 1416 aa22.48■■□□□ 1.19
PBXIP1-205ENST00000493133 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PBXIP1-205ENST00000493133 PRXQ9BXM0 1461 aa22.44■■□□□ 1.18
PBXIP1-205ENST00000493133 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.43■■□□□ 1.18
PBXIP1-205ENST00000493133 GLI2P10070 1586 aa22.42■■□□□ 1.18
PBXIP1-205ENST00000493133 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.4■■□□□ 1.18
PBXIP1-205ENST00000493133 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.39■■□□□ 1.17
PBXIP1-205ENST00000493133 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PBXIP1-205ENST00000493133 ABCA8O94911 1581 aa22.35■■□□□ 1.17
PBXIP1-205ENST00000493133 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PBXIP1-205ENST00000493133 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.26■■□□□ 1.15
PBXIP1-205ENST00000493133 GOLGA3Q08378 1498 aa22.26■■□□□ 1.15
PBXIP1-205ENST00000493133 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.25■■□□□ 1.15
PBXIP1-205ENST00000493133 P3H3Q8IVL6 736 aa22.23■■□□□ 1.15
PBXIP1-205ENST00000493133 SAMD9Q5K651 1589 aa22.22■■□□□ 1.15
PBXIP1-205ENST00000493133 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.19■■□□□ 1.14
PBXIP1-205ENST00000493133 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.18■■□□□ 1.14
PBXIP1-205ENST00000493133 ARID3CA6NKF2 412 aa22.18■■□□□ 1.14
PBXIP1-205ENST00000493133 KCNH8Q96L42 1107 aa22.13■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 ATP10BO94823 1461 aa22.13■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.12■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.11■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 ADGRL1O94910 1474 aa22.09■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 CD109Q6YHK3 1445 aa22.08■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.08■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PBXIP1-205ENST00000493133 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.06■■□□□ 1.12
PBXIP1-205ENST00000493133 KIF21BO75037 1637 aa22.04■■□□□ 1.12
PBXIP1-205ENST00000493133 EEA1Q15075 1411 aa22.04■■□□□ 1.12
PBXIP1-205ENST00000493133 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.03■■□□□ 1.12
PBXIP1-205ENST00000493133 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PBXIP1-205ENST00000493133 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.97■■□□□ 1.11
PBXIP1-205ENST00000493133 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.91■■□□□ 1.1
PBXIP1-205ENST00000493133 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.91■■□□□ 1.1
PBXIP1-205ENST00000493133 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.91■■□□□ 1.1
PBXIP1-205ENST00000493133 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.89■■□□□ 1.09
PBXIP1-205ENST00000493133 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PBXIP1-205ENST00000493133 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PBXIP1-205ENST00000493133 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PBXIP1-205ENST00000493133 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.86■■□□□ 1.09
PBXIP1-205ENST00000493133 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.85■■□□□ 1.09
PBXIP1-205ENST00000493133 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
PBXIP1-205ENST00000493133 RAPGEF3O95398 923 aa21.82■■□□□ 1.08
PBXIP1-205ENST00000493133 RICTORQ6R327 1708 aa21.81■■□□□ 1.08
PBXIP1-205ENST00000493133 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.81■■□□□ 1.08
PBXIP1-205ENST00000493133 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.81■■□□□ 1.08
PBXIP1-205ENST00000493133 NEO1Q92859 1461 aa21.79■■□□□ 1.08
PBXIP1-205ENST00000493133 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.77■■□□□ 1.08
PBXIP1-205ENST00000493133 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.76■■□□□ 1.07
PBXIP1-205ENST00000493133 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PBXIP1-205ENST00000493133 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.72■■□□□ 1.07
PBXIP1-205ENST00000493133 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.72■■□□□ 1.07
PBXIP1-205ENST00000493133 KIF14Q15058 1648 aa21.72■■□□□ 1.07
PBXIP1-205ENST00000493133 HECW1Q76N89 1606 aa21.71■■□□□ 1.07
PBXIP1-205ENST00000493133 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.71■■□□□ 1.07
PBXIP1-205ENST00000493133 AKNAQ7Z591 1439 aa21.7■■□□□ 1.06
PBXIP1-205ENST00000493133 FANCAO15360 1455 aa21.7■■□□□ 1.06
PBXIP1-205ENST00000493133 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.69■■□□□ 1.06
PBXIP1-205ENST00000493133 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.69■■□□□ 1.06
PBXIP1-205ENST00000493133 MADDQ8WXG6 1647 aa21.69■■□□□ 1.06
PBXIP1-205ENST00000493133 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.66■■□□□ 1.06
PBXIP1-205ENST00000493133 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PBXIP1-205ENST00000493133 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PBXIP1-205ENST00000493133 FMN1Q68DA7 1419 aa21.63■■□□□ 1.05
PBXIP1-205ENST00000493133 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.63■■□□□ 1.05
PBXIP1-205ENST00000493133 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PBXIP1-205ENST00000493133 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.62■■□□□ 1.05
PBXIP1-205ENST00000493133 PTPRMP28827 1452 aa21.62■■□□□ 1.05
PBXIP1-205ENST00000493133 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PBXIP1-205ENST00000493133 PLCH2O75038 1416 aa21.59■■□□□ 1.05
PBXIP1-205ENST00000493133 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.5 ms