RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493114.1

IRF4-204, Transcript of interferon regulatory factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene IRF4, Length 1,607 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4-204ENST00000493114 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.71■■■■□ 3.31
IRF4-204ENST00000493114 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
IRF4-204ENST00000493114 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.68■■■■□ 3.3
IRF4-204ENST00000493114 ARAP1Q96P48 1450 aa35.67■■■■□ 3.3
IRF4-204ENST00000493114 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
IRF4-204ENST00000493114 SYNJ2O15056 1496 aa35.64■■■■□ 3.3
IRF4-204ENST00000493114 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.64■■■■□ 3.3
IRF4-204ENST00000493114 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.49■■■■□ 3.27
IRF4-204ENST00000493114 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
IRF4-204ENST00000493114 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.44■■■■□ 3.26
IRF4-204ENST00000493114 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.41■■■■□ 3.26
IRF4-204ENST00000493114 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.41■■■■□ 3.26
IRF4-204ENST00000493114 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.41■■■■□ 3.26
IRF4-204ENST00000493114 GRIN2AQ12879 1464 aa35.41■■■■□ 3.26
IRF4-204ENST00000493114 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.39■■■■□ 3.26
IRF4-204ENST00000493114 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
IRF4-204ENST00000493114 ARHGEF11O15085 1522 aa35.38■■■■□ 3.25
IRF4-204ENST00000493114 SAMD9Q5K651 1589 aa35.37■■■■□ 3.25
IRF4-204ENST00000493114 IQGAP2Q13576 1575 aa35.35■■■■□ 3.25
IRF4-204ENST00000493114 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.26■■■■□ 3.23
IRF4-204ENST00000493114 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.23■■■■□ 3.23
IRF4-204ENST00000493114 NUP160Q12769 1436 aa35.23■■■■□ 3.23
IRF4-204ENST00000493114 APLP2Q06481 763 aa35.21■■■■□ 3.23
IRF4-204ENST00000493114 CEP170Q5SW79 1584 aa35.21■■■■□ 3.23
IRF4-204ENST00000493114 P3H3Q8IVL6 736 aa35.19■■■■□ 3.22
IRF4-204ENST00000493114 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.19■■■■□ 3.22
IRF4-204ENST00000493114 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
IRF4-204ENST00000493114 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
IRF4-204ENST00000493114 FMN1Q68DA7 1419 aa35.1■■■■□ 3.21
IRF4-204ENST00000493114 MAP3K1Q13233 1512 aa35.08■■■■□ 3.21
IRF4-204ENST00000493114 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.08■■■■□ 3.21
IRF4-204ENST00000493114 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.07■■■■□ 3.21
IRF4-204ENST00000493114 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.05■■■■□ 3.2
IRF4-204ENST00000493114 TIAM1Q13009 1591 aa35.05■■■■□ 3.2
IRF4-204ENST00000493114 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.03■■■■□ 3.2
IRF4-204ENST00000493114 KIAA0556O60303 1618 aa35.02■■■■□ 3.2
IRF4-204ENST00000493114 SHROOM2Q13796 1616 aa34.99■■■■□ 3.19
IRF4-204ENST00000493114 DISP1Q96F81 1524 aa34.98■■■■□ 3.19
IRF4-204ENST00000493114 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
IRF4-204ENST00000493114 JPH4Q96JJ6 628 aa34.93■■■■□ 3.18
IRF4-204ENST00000493114 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.88■■■■□ 3.17
IRF4-204ENST00000493114 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.87■■■■□ 3.17
IRF4-204ENST00000493114 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.84■■■■□ 3.17
IRF4-204ENST00000493114 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
IRF4-204ENST00000493114 HECW1Q76N89 1606 aa34.81■■■■□ 3.16
IRF4-204ENST00000493114 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
IRF4-204ENST00000493114 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.76■■■■□ 3.16
IRF4-204ENST00000493114 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.71■■■■□ 3.15
IRF4-204ENST00000493114 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.67■■■■□ 3.14
IRF4-204ENST00000493114 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
IRF4-204ENST00000493114 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
IRF4-204ENST00000493114 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.58■■■■□ 3.13
IRF4-204ENST00000493114 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
IRF4-204ENST00000493114 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
IRF4-204ENST00000493114 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.54■■■■□ 3.12
IRF4-204ENST00000493114 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.52■■■■□ 3.12
IRF4-204ENST00000493114 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.51■■■■□ 3.11
IRF4-204ENST00000493114 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.5■■■■□ 3.11
IRF4-204ENST00000493114 ABCA8O94911 1581 aa34.5■■■■□ 3.11
IRF4-204ENST00000493114 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
IRF4-204ENST00000493114 HRCP23327 699 aa34.48■■■■□ 3.11
IRF4-204ENST00000493114 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.47■■■■□ 3.11
IRF4-204ENST00000493114 PTPRGP23470 1445 aa34.43■■■■□ 3.1
IRF4-204ENST00000493114 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
IRF4-204ENST00000493114 NCOA2Q15596 1464 aa34.4■■■■□ 3.1
IRF4-204ENST00000493114 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
IRF4-204ENST00000493114 ARID3CA6NKF2 412 aa34.34■■■■□ 3.09
IRF4-204ENST00000493114 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.31■■■■□ 3.08
IRF4-204ENST00000493114 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.27■■■■□ 3.08
IRF4-204ENST00000493114 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.27■■■■□ 3.08
IRF4-204ENST00000493114 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.27■■■■□ 3.08
IRF4-204ENST00000493114 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.23■■■■□ 3.07
IRF4-204ENST00000493114 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
IRF4-204ENST00000493114 UACAQ9BZF9 1416 aa34.22■■■■□ 3.07
IRF4-204ENST00000493114 ATP10BO94823 1461 aa34.21■■■■□ 3.07
IRF4-204ENST00000493114 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
IRF4-204ENST00000493114 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
IRF4-204ENST00000493114 ABCC2Q92887 1545 aa34.17■■■■□ 3.06
IRF4-204ENST00000493114 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.15■■■■□ 3.06
IRF4-204ENST00000493114 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
IRF4-204ENST00000493114 MAPKBP1O60336 1514 aa34.14■■■■□ 3.06
IRF4-204ENST00000493114 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.14■■■■□ 3.06
IRF4-204ENST00000493114 KIF14Q15058 1648 aa34.09■■■■□ 3.05
IRF4-204ENST00000493114 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
IRF4-204ENST00000493114 MIA2Q96PC5 1412 aa34.07■■■■□ 3.04
IRF4-204ENST00000493114 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
IRF4-204ENST00000493114 ITGAEP38570 1179 aa34.05■■■■□ 3.04
IRF4-204ENST00000493114 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
IRF4-204ENST00000493114 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.03■■■■□ 3.04
IRF4-204ENST00000493114 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.03■■■■□ 3.04
IRF4-204ENST00000493114 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.01■■■■□ 3.03
IRF4-204ENST00000493114 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.99■■■■□ 3.03
IRF4-204ENST00000493114 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.98■■■■□ 3.03
IRF4-204ENST00000493114 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
IRF4-204ENST00000493114 DIP2BQ9P265 1576 aa33.93■■■■□ 3.02
IRF4-204ENST00000493114 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.93■■■■□ 3.02
IRF4-204ENST00000493114 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
IRF4-204ENST00000493114 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.9■■■■□ 3.02
IRF4-204ENST00000493114 ASXL2Q76L83 1435 aa33.9■■■■□ 3.02
IRF4-204ENST00000493114 PTPRKQ15262 1439 aa33.87■■■■□ 3.01
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