RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493112.5

SUCLG2-204, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-204ENST00000493112 IGF1RP08069 1367 aa21.55■■□□□ 1.04
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SUCLG2-204ENST00000493112 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.42■■□□□ 1.02
SUCLG2-204ENST00000493112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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SUCLG2-204ENST00000493112 IQGAP2Q13576 1575 aa21.33■■□□□ 1
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SUCLG2-204ENST00000493112 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.17■□□□□ 0.98
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SUCLG2-204ENST00000493112 KIAA0556O60303 1618 aa21.14■□□□□ 0.98
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SUCLG2-204ENST00000493112 GOLGA3Q08378 1498 aa20.99■□□□□ 0.95
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SUCLG2-204ENST00000493112 FMN1Q68DA7 1419 aa20.47■□□□□ 0.87
SUCLG2-204ENST00000493112 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.47■□□□□ 0.87
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SUCLG2-204ENST00000493112 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
SUCLG2-204ENST00000493112 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.42■□□□□ 0.86
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SUCLG2-204ENST00000493112 NEO1Q92859 1461 aa20.38■□□□□ 0.85
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SUCLG2-204ENST00000493112 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.33■□□□□ 0.84
SUCLG2-204ENST00000493112 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.32■□□□□ 0.84
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SUCLG2-204ENST00000493112 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.26■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 RAPGEF3O95398 923 aa20.26■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.24■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 PLCH2O75038 1416 aa20.22■□□□□ 0.83
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SUCLG2-204ENST00000493112 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.2■□□□□ 0.82
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