RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.7■□□□□ 0.42
TNS1-218ENST00000492338 GRIN2AQ12879 1464 aa17.69■□□□□ 0.42
TNS1-218ENST00000492338 KIF27Q86VH2 1401 aa17.69■□□□□ 0.42
TNS1-218ENST00000492338 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.67■□□□□ 0.42
TNS1-218ENST00000492338 ADAMTS12P58397 1594 aa17.66■□□□□ 0.42
TNS1-218ENST00000492338 IGF1RP08069 1367 aa17.64■□□□□ 0.41
TNS1-218ENST00000492338 ARAP1Q96P48 1450 aa17.63■□□□□ 0.41
TNS1-218ENST00000492338 NUP160Q12769 1436 aa17.62■□□□□ 0.41
TNS1-218ENST00000492338 JPH4Q96JJ6 628 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-218ENST00000492338 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
TNS1-218ENST00000492338 CEP170Q5SW79 1584 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-218ENST00000492338 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-218ENST00000492338 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
TNS1-218ENST00000492338 CUL7Q14999 1698 aa17.46■□□□□ 0.39
TNS1-218ENST00000492338 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.45■□□□□ 0.38
TNS1-218ENST00000492338 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
TNS1-218ENST00000492338 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.43■□□□□ 0.38
TNS1-218ENST00000492338 SHROOM2Q13796 1616 aa17.41■□□□□ 0.38
TNS1-218ENST00000492338 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.39■□□□□ 0.37
TNS1-218ENST00000492338 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
TNS1-218ENST00000492338 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.37■□□□□ 0.37
TNS1-218ENST00000492338 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TNS1-218ENST00000492338 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
TNS1-218ENST00000492338 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.33■□□□□ 0.36
TNS1-218ENST00000492338 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
TNS1-218ENST00000492338 PTPRGP23470 1445 aa17.3■□□□□ 0.36
TNS1-218ENST00000492338 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.27■□□□□ 0.35
TNS1-218ENST00000492338 IQGAP2Q13576 1575 aa17.26■□□□□ 0.35
TNS1-218ENST00000492338 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
TNS1-218ENST00000492338 PRXQ9BXM0 1461 aa17.23■□□□□ 0.35
TNS1-218ENST00000492338 EEA1Q15075 1411 aa17.21■□□□□ 0.35
TNS1-218ENST00000492338 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.18■□□□□ 0.34
TNS1-218ENST00000492338 ZBTB22O15209 634 aa17.17■□□□□ 0.34
TNS1-218ENST00000492338 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.16■□□□□ 0.34
TNS1-218ENST00000492338 DISP1Q96F81 1524 aa17.16■□□□□ 0.34
TNS1-218ENST00000492338 GOLGA3Q08378 1498 aa17.14■□□□□ 0.33
TNS1-218ENST00000492338 UACAQ9BZF9 1416 aa17.13■□□□□ 0.33
TNS1-218ENST00000492338 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.12■□□□□ 0.33
TNS1-218ENST00000492338 P3H3Q8IVL6 736 aa17.09■□□□□ 0.33
TNS1-218ENST00000492338 ABCC2Q92887 1545 aa17.09■□□□□ 0.33
TNS1-218ENST00000492338 MAPKBP1O60336 1514 aa17.08■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.08■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.08■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 KIAA0556O60303 1618 aa17.07■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.05■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.03■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.03■□□□□ 0.32
TNS1-218ENST00000492338 ASXL2Q76L83 1435 aa17.02■□□□□ 0.31
TNS1-218ENST00000492338 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.99■□□□□ 0.31
TNS1-218ENST00000492338 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.98■□□□□ 0.31
TNS1-218ENST00000492338 DIP2BQ9P265 1576 aa16.96■□□□□ 0.31
TNS1-218ENST00000492338 ARID3CA6NKF2 412 aa16.95■□□□□ 0.3
TNS1-218ENST00000492338 KCNH8Q96L42 1107 aa16.95■□□□□ 0.3
TNS1-218ENST00000492338 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TNS1-218ENST00000492338 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
TNS1-218ENST00000492338 KIF21BO75037 1637 aa16.93■□□□□ 0.3
TNS1-218ENST00000492338 ABCA8O94911 1581 aa16.9■□□□□ 0.3
TNS1-218ENST00000492338 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.88■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.88■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.87■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 GLI2P10070 1586 aa16.87■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 SAMD9Q5K651 1589 aa16.86■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 SLC24A1O60721 1099 aa16.85■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 ATP10BO94823 1461 aa16.85■□□□□ 0.29
TNS1-218ENST00000492338 TSPOAP1O95153 1857 aa16.83■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.82■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.82■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 CD109Q6YHK3 1445 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 KDM6BO15054 1643 aa16.78■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.78■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.77■□□□□ 0.28
TNS1-218ENST00000492338 FMN1Q68DA7 1419 aa16.76■□□□□ 0.27
TNS1-218ENST00000492338 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TNS1-218ENST00000492338 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TNS1-218ENST00000492338 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.73■□□□□ 0.27
TNS1-218ENST00000492338 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.72■□□□□ 0.27
TNS1-218ENST00000492338 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.71■□□□□ 0.27
TNS1-218ENST00000492338 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TNS1-218ENST00000492338 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TNS1-218ENST00000492338 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TNS1-218ENST00000492338 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.67■□□□□ 0.26
TNS1-218ENST00000492338 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.67■□□□□ 0.26
TNS1-218ENST00000492338 CLIP1P30622 1438 aa16.63■□□□□ 0.25
TNS1-218ENST00000492338 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TNS1-218ENST00000492338 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.63■□□□□ 0.25
TNS1-218ENST00000492338 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TNS1-218ENST00000492338 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-218ENST00000492338 FBXO41Q8TF61 875 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-218ENST00000492338 HECW1Q76N89 1606 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-218ENST00000492338 NEO1Q92859 1461 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-218ENST00000492338 RAPGEF3O95398 923 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-218ENST00000492338 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-218ENST00000492338 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms