RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492068.2

PTGDS-209, Transcript of prostaglandin D2 synthase, humanhuman

TSL 2

Gene PTGDS, Length 754 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDS-209ENST00000492068 JPH4Q96JJ6 628 aa41.62■■■■■ 4.25
PTGDS-209ENST00000492068 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.6■■■■■ 4.25
PTGDS-209ENST00000492068 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.58■■■■■ 4.25
PTGDS-209ENST00000492068 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.56■■■■■ 4.24
PTGDS-209ENST00000492068 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
PTGDS-209ENST00000492068 PRXQ9BXM0 1461 aa41.43■■■■■ 4.22
PTGDS-209ENST00000492068 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.37■■■■■ 4.21
PTGDS-209ENST00000492068 IQGAP2Q13576 1575 aa41.36■■■■■ 4.21
PTGDS-209ENST00000492068 EEA1Q15075 1411 aa41.33■■■■■ 4.21
PTGDS-209ENST00000492068 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
PTGDS-209ENST00000492068 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.21■■■■■ 4.19
PTGDS-209ENST00000492068 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.13■■■■■ 4.18
PTGDS-209ENST00000492068 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.13■■■■■ 4.17
PTGDS-209ENST00000492068 DISP1Q96F81 1524 aa41.11■■■■■ 4.17
PTGDS-209ENST00000492068 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.03■■■■■ 4.16
PTGDS-209ENST00000492068 PTPRGP23470 1445 aa41.02■■■■■ 4.16
PTGDS-209ENST00000492068 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PTGDS-209ENST00000492068 KIAA0556O60303 1618 aa40.97■■■■■ 4.15
PTGDS-209ENST00000492068 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
PTGDS-209ENST00000492068 KIF21BO75037 1637 aa40.96■■■■■ 4.15
PTGDS-209ENST00000492068 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.95■■■■■ 4.15
PTGDS-209ENST00000492068 GOLGA3Q08378 1498 aa40.85■■■■■ 4.13
PTGDS-209ENST00000492068 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
PTGDS-209ENST00000492068 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.76■■■■■ 4.12
PTGDS-209ENST00000492068 UACAQ9BZF9 1416 aa40.75■■■■■ 4.11
PTGDS-209ENST00000492068 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
PTGDS-209ENST00000492068 P3H3Q8IVL6 736 aa40.68■■■■■ 4.1
PTGDS-209ENST00000492068 SAMD9Q5K651 1589 aa40.68■■■■■ 4.1
PTGDS-209ENST00000492068 MAPKBP1O60336 1514 aa40.67■■■■■ 4.1
PTGDS-209ENST00000492068 ABCC2Q92887 1545 aa40.67■■■■■ 4.1
PTGDS-209ENST00000492068 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
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PTGDS-209ENST00000492068 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.56■■■■■ 4.08
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PTGDS-209ENST00000492068 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.52■■■■■ 4.08
PTGDS-209ENST00000492068 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.51■■■■■ 4.07
PTGDS-209ENST00000492068 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
PTGDS-209ENST00000492068 DIP2BQ9P265 1576 aa40.45■■■■■ 4.07
PTGDS-209ENST00000492068 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.45■■■■■ 4.07
PTGDS-209ENST00000492068 ASXL2Q76L83 1435 aa40.43■■■■■ 4.06
PTGDS-209ENST00000492068 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.43■■■■■ 4.06
PTGDS-209ENST00000492068 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.43■■■■■ 4.06
PTGDS-209ENST00000492068 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.31■■■■■ 4.04
PTGDS-209ENST00000492068 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.28■■■■■ 4.04
PTGDS-209ENST00000492068 ARID3CA6NKF2 412 aa40.25■■■■■ 4.03
PTGDS-209ENST00000492068 ATP10BO94823 1461 aa40.23■■■■■ 4.03
PTGDS-209ENST00000492068 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
PTGDS-209ENST00000492068 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.19■■■■■ 4.03
PTGDS-209ENST00000492068 GLI2P10070 1586 aa40.19■■■■■ 4.02
PTGDS-209ENST00000492068 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
PTGDS-209ENST00000492068 TSPOAP1O95153 1857 aa40.14■■■■■ 4.02
PTGDS-209ENST00000492068 FMN1Q68DA7 1419 aa40.06■■■■■ 4
PTGDS-209ENST00000492068 KCNH8Q96L42 1107 aa40.05■■■■■ 4
PTGDS-209ENST00000492068 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.03■■■■■ 4
PTGDS-209ENST00000492068 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
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PTGDS-209ENST00000492068 CLIP1P30622 1438 aa39.98■■■■□ 3.99
PTGDS-209ENST00000492068 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.91■■■■□ 3.98
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PTGDS-209ENST00000492068 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
PTGDS-209ENST00000492068 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.88■■■■□ 3.97
PTGDS-209ENST00000492068 CD109Q6YHK3 1445 aa39.84■■■■□ 3.97
PTGDS-209ENST00000492068 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.83■■■■□ 3.97
PTGDS-209ENST00000492068 KDM6BO15054 1643 aa39.81■■■■□ 3.96
PTGDS-209ENST00000492068 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.79■■■■□ 3.96
PTGDS-209ENST00000492068 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
PTGDS-209ENST00000492068 CEP162Q5TB80 1403 aa39.78■■■■□ 3.96
PTGDS-209ENST00000492068 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.78■■■■□ 3.96
PTGDS-209ENST00000492068 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.78■■■■□ 3.96
PTGDS-209ENST00000492068 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.76■■■■□ 3.96
PTGDS-209ENST00000492068 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.76■■■■□ 3.96
PTGDS-209ENST00000492068 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
PTGDS-209ENST00000492068 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.65■■■■□ 3.94
PTGDS-209ENST00000492068 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.61■■■■□ 3.93
PTGDS-209ENST00000492068 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
PTGDS-209ENST00000492068 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.59■■■■□ 3.93
PTGDS-209ENST00000492068 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.56■■■■□ 3.92
PTGDS-209ENST00000492068 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
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PTGDS-209ENST00000492068 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.43■■■■□ 3.9
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PTGDS-209ENST00000492068 PLCH2O75038 1416 aa39.36■■■■□ 3.89
PTGDS-209ENST00000492068 FANCAO15360 1455 aa39.36■■■■□ 3.89
PTGDS-209ENST00000492068 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.33■■■■□ 3.89
PTGDS-209ENST00000492068 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.31■■■■□ 3.88
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PTGDS-209ENST00000492068 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.3■■■■□ 3.88
PTGDS-209ENST00000492068 RAPGEF3O95398 923 aa39.27■■■■□ 3.88
PTGDS-209ENST00000492068 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.21■■■■□ 3.87
PTGDS-209ENST00000492068 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.19■■■■□ 3.86
PTGDS-209ENST00000492068 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.19■■■■□ 3.86
PTGDS-209ENST00000492068 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.18■■■■□ 3.86
PTGDS-209ENST00000492068 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
PTGDS-209ENST00000492068 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
PTGDS-209ENST00000492068 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.17■■■■□ 3.86
PTGDS-209ENST00000492068 PREX2Q70Z35 1606 aa39.14■■■■□ 3.86
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