RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491731.1

USP20-207, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-207ENST00000491731 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
USP20-207ENST00000491731 SHROOM2Q13796 1616 aa22.25■■□□□ 1.15
USP20-207ENST00000491731 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.24■■□□□ 1.15
USP20-207ENST00000491731 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.21■■□□□ 1.15
USP20-207ENST00000491731 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP20-207ENST00000491731 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.11■■□□□ 1.13
USP20-207ENST00000491731 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.09■■□□□ 1.13
USP20-207ENST00000491731 IQGAP2Q13576 1575 aa22.08■■□□□ 1.12
USP20-207ENST00000491731 PRXQ9BXM0 1461 aa22.07■■□□□ 1.12
USP20-207ENST00000491731 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP20-207ENST00000491731 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP20-207ENST00000491731 EEA1Q15075 1411 aa22.04■■□□□ 1.12
USP20-207ENST00000491731 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.04■■□□□ 1.12
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USP20-207ENST00000491731 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.97■■□□□ 1.11
USP20-207ENST00000491731 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
USP20-207ENST00000491731 DISP1Q96F81 1524 aa21.94■■□□□ 1.1
USP20-207ENST00000491731 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.94■■□□□ 1.1
USP20-207ENST00000491731 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.91■■□□□ 1.1
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USP20-207ENST00000491731 KIAA0556O60303 1618 aa21.86■■□□□ 1.09
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USP20-207ENST00000491731 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.83■■□□□ 1.09
USP20-207ENST00000491731 UACAQ9BZF9 1416 aa21.8■■□□□ 1.08
USP20-207ENST00000491731 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP20-207ENST00000491731 P3H3Q8IVL6 736 aa21.79■■□□□ 1.08
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USP20-207ENST00000491731 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.76■■□□□ 1.07
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USP20-207ENST00000491731 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.71■■□□□ 1.07
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USP20-207ENST00000491731 SAMD9Q5K651 1589 aa21.65■■□□□ 1.06
USP20-207ENST00000491731 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.65■■□□□ 1.06
USP20-207ENST00000491731 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.64■■□□□ 1.05
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USP20-207ENST00000491731 ABCA8O94911 1581 aa21.62■■□□□ 1.05
USP20-207ENST00000491731 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.61■■□□□ 1.05
USP20-207ENST00000491731 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
USP20-207ENST00000491731 ARID3CA6NKF2 412 aa21.59■■□□□ 1.05
USP20-207ENST00000491731 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.55■■□□□ 1.04
USP20-207ENST00000491731 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
USP20-207ENST00000491731 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
USP20-207ENST00000491731 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.52■■□□□ 1.03
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USP20-207ENST00000491731 KCNH8Q96L42 1107 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-207ENST00000491731 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-207ENST00000491731 GLI2P10070 1586 aa21.48■■□□□ 1.03
USP20-207ENST00000491731 ATP10BO94823 1461 aa21.48■■□□□ 1.03
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USP20-207ENST00000491731 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.45■■□□□ 1.03
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USP20-207ENST00000491731 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.37■■□□□ 1.01
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USP20-207ENST00000491731 CD109Q6YHK3 1445 aa21.36■■□□□ 1.01
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USP20-207ENST00000491731 CLIP1P30622 1438 aa21.33■■□□□ 1.01
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USP20-207ENST00000491731 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
USP20-207ENST00000491731 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.27■■□□□ 1
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USP20-207ENST00000491731 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
USP20-207ENST00000491731 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.22■□□□□ 0.99
USP20-207ENST00000491731 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
USP20-207ENST00000491731 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.21■□□□□ 0.99
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USP20-207ENST00000491731 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.96■□□□□ 0.95
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USP20-207ENST00000491731 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.93■□□□□ 0.94
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