RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491659.5

USP39-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 3

Gene USP39, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-217ENST00000491659 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
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USP39-217ENST00000491659 JPH4Q96JJ6 628 aa25.72■■□□□ 1.71
USP39-217ENST00000491659 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.64■■□□□ 1.69
USP39-217ENST00000491659 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
USP39-217ENST00000491659 IQGAP2Q13576 1575 aa25.63■■□□□ 1.69
USP39-217ENST00000491659 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.53■■□□□ 1.68
USP39-217ENST00000491659 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.5■■□□□ 1.67
USP39-217ENST00000491659 PRXQ9BXM0 1461 aa25.46■■□□□ 1.67
USP39-217ENST00000491659 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.45■■□□□ 1.67
USP39-217ENST00000491659 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.43■■□□□ 1.66
USP39-217ENST00000491659 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.41■■□□□ 1.66
USP39-217ENST00000491659 PTPRGP23470 1445 aa25.39■■□□□ 1.66
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USP39-217ENST00000491659 DISP1Q96F81 1524 aa25.39■■□□□ 1.66
USP39-217ENST00000491659 KIAA0556O60303 1618 aa25.39■■□□□ 1.66
USP39-217ENST00000491659 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
USP39-217ENST00000491659 MAPKBP1O60336 1514 aa25.35■■□□□ 1.65
USP39-217ENST00000491659 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.35■■□□□ 1.65
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USP39-217ENST00000491659 GOLGA3Q08378 1498 aa25.29■■□□□ 1.64
USP39-217ENST00000491659 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.25■■□□□ 1.63
USP39-217ENST00000491659 ABCC2Q92887 1545 aa25.25■■□□□ 1.63
USP39-217ENST00000491659 UACAQ9BZF9 1416 aa25.24■■□□□ 1.63
USP39-217ENST00000491659 DIP2BQ9P265 1576 aa25.23■■□□□ 1.63
USP39-217ENST00000491659 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.23■■□□□ 1.63
USP39-217ENST00000491659 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.21■■□□□ 1.63
USP39-217ENST00000491659 KIF21BO75037 1637 aa25.19■■□□□ 1.62
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USP39-217ENST00000491659 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.12■■□□□ 1.61
USP39-217ENST00000491659 SAMD9Q5K651 1589 aa25.12■■□□□ 1.61
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USP39-217ENST00000491659 ASXL2Q76L83 1435 aa25.1■■□□□ 1.61
USP39-217ENST00000491659 ABCA8O94911 1581 aa25.09■■□□□ 1.61
USP39-217ENST00000491659 TSPOAP1O95153 1857 aa25.06■■□□□ 1.6
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USP39-217ENST00000491659 P3H3Q8IVL6 736 aa25■■□□□ 1.59
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USP39-217ENST00000491659 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
USP39-217ENST00000491659 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.96■■□□□ 1.59
USP39-217ENST00000491659 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.95■■□□□ 1.58
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USP39-217ENST00000491659 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.93■■□□□ 1.58
USP39-217ENST00000491659 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
USP39-217ENST00000491659 KDM6BO15054 1643 aa24.92■■□□□ 1.58
USP39-217ENST00000491659 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.91■■□□□ 1.58
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USP39-217ENST00000491659 ATP10BO94823 1461 aa24.83■■□□□ 1.56
USP39-217ENST00000491659 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.82■■□□□ 1.56
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USP39-217ENST00000491659 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
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USP39-217ENST00000491659 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.7■■□□□ 1.54
USP39-217ENST00000491659 FMN1Q68DA7 1419 aa24.69■■□□□ 1.54
USP39-217ENST00000491659 HECW1Q76N89 1606 aa24.68■■□□□ 1.54
USP39-217ENST00000491659 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
USP39-217ENST00000491659 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
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USP39-217ENST00000491659 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
USP39-217ENST00000491659 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
USP39-217ENST00000491659 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.52■■□□□ 1.52
USP39-217ENST00000491659 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
USP39-217ENST00000491659 CLIP1P30622 1438 aa24.51■■□□□ 1.51
USP39-217ENST00000491659 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
USP39-217ENST00000491659 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.5■■□□□ 1.51
USP39-217ENST00000491659 NEO1Q92859 1461 aa24.5■■□□□ 1.51
USP39-217ENST00000491659 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.5■■□□□ 1.51
USP39-217ENST00000491659 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.49■■□□□ 1.51
USP39-217ENST00000491659 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.49■■□□□ 1.51
USP39-217ENST00000491659 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.46■■□□□ 1.51
USP39-217ENST00000491659 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.45■■□□□ 1.5
USP39-217ENST00000491659 KIF14Q15058 1648 aa24.44■■□□□ 1.5
USP39-217ENST00000491659 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
USP39-217ENST00000491659 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.43■■□□□ 1.5
USP39-217ENST00000491659 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.41■■□□□ 1.5
USP39-217ENST00000491659 FANCAO15360 1455 aa24.39■■□□□ 1.5
USP39-217ENST00000491659 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
USP39-217ENST00000491659 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.36■■□□□ 1.49
USP39-217ENST00000491659 ADGRL1O94910 1474 aa24.35■■□□□ 1.49
USP39-217ENST00000491659 AKNAQ7Z591 1439 aa24.34■■□□□ 1.49
USP39-217ENST00000491659 RICTORQ6R327 1708 aa24.33■■□□□ 1.49
USP39-217ENST00000491659 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.33■■□□□ 1.49
USP39-217ENST00000491659 CEP162Q5TB80 1403 aa24.33■■□□□ 1.49
USP39-217ENST00000491659 PLCH2O75038 1416 aa24.32■■□□□ 1.48
USP39-217ENST00000491659 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP39-217ENST00000491659 RAPGEF3O95398 923 aa24.29■■□□□ 1.48
USP39-217ENST00000491659 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.25■■□□□ 1.47
USP39-217ENST00000491659 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.25■■□□□ 1.47
USP39-217ENST00000491659 PREX2Q70Z35 1606 aa24.24■■□□□ 1.47
USP39-217ENST00000491659 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.24■■□□□ 1.47
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