RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491163.1

C7orf50-208, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C7orf50, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C7orf50-208	ENST00000491163	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
C7orf50-208	ENST00000491163	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.81	■■■■□ 3
C7orf50-208	ENST00000491163	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.8	■■■■□ 3
C7orf50-208	ENST00000491163	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.8	■■■■□ 3
C7orf50-208	ENST00000491163	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.75	■■■□□ 2.99
C7orf50-208	ENST00000491163	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.67	■■■□□ 2.98
C7orf50-208	ENST00000491163	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.66	■■■□□ 2.98
C7orf50-208	ENST00000491163	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
C7orf50-208	ENST00000491163	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.57	■■■□□ 2.96
C7orf50-208	ENST00000491163	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.55	■■■□□ 2.96
C7orf50-208	ENST00000491163	EEA1	Q15075	1411 aa		33.54	■■■□□ 2.96
C7orf50-208	ENST00000491163	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
C7orf50-208	ENST00000491163	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.44	■■■□□ 2.94
C7orf50-208	ENST00000491163	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.44	■■■□□ 2.94
C7orf50-208	ENST00000491163	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.43	■■■□□ 2.94
C7orf50-208	ENST00000491163	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
C7orf50-208	ENST00000491163	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.37	■■■□□ 2.93
C7orf50-208	ENST00000491163	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.36	■■■□□ 2.93
C7orf50-208	ENST00000491163	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.35	■■■□□ 2.93
C7orf50-208	ENST00000491163	PTPRG	P23470	1445 aa		33.35	■■■□□ 2.93
C7orf50-208	ENST00000491163	KIF21B	O75037	1637 aa		33.31	■■■□□ 2.92
C7orf50-208	ENST00000491163	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.26	■■■□□ 2.91
C7orf50-208	ENST00000491163	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.2	■■■□□ 2.91
C7orf50-208	ENST00000491163	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
C7orf50-208	ENST00000491163	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.13	■■■□□ 2.89
C7orf50-208	ENST00000491163	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.13	■■■□□ 2.89	2e-6	■■■■■ 46
C7orf50-208	ENST00000491163	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.11	■■■□□ 2.89
C7orf50-208	ENST00000491163	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.1	■■■□□ 2.89
C7orf50-208	ENST00000491163	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.1	■■■□□ 2.89
C7orf50-208	ENST00000491163	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.09	■■■□□ 2.89
C7orf50-208	ENST00000491163	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.08	■■■□□ 2.89
C7orf50-208	ENST00000491163	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.07	■■■□□ 2.88
C7orf50-208	ENST00000491163	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.05	■■■□□ 2.88
C7orf50-208	ENST00000491163	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
C7orf50-208	ENST00000491163	ABCA8	O94911	1581 aa		32.99	■■■□□ 2.87
C7orf50-208	ENST00000491163	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
C7orf50-208	ENST00000491163	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.96	■■■□□ 2.87
C7orf50-208	ENST00000491163	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.95	■■■□□ 2.87
C7orf50-208	ENST00000491163	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.95	■■■□□ 2.87
C7orf50-208	ENST00000491163	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.95	■■■□□ 2.87
C7orf50-208	ENST00000491163	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.91	■■■□□ 2.86
C7orf50-208	ENST00000491163	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.9	■■■□□ 2.86
C7orf50-208	ENST00000491163	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.88	■■■□□ 2.85
C7orf50-208	ENST00000491163	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.84	■■■□□ 2.85
C7orf50-208	ENST00000491163	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.81	■■■□□ 2.84
C7orf50-208	ENST00000491163	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.76	■■■□□ 2.84
C7orf50-208	ENST00000491163	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.74	■■■□□ 2.83
C7orf50-208	ENST00000491163	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.72	■■■□□ 2.83
C7orf50-208	ENST00000491163	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
C7orf50-208	ENST00000491163	ATP10B	O94823	1461 aa		32.7	■■■□□ 2.83
C7orf50-208	ENST00000491163	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
C7orf50-208	ENST00000491163	GLI2	P10070	1586 aa		32.68	■■■□□ 2.82
C7orf50-208	ENST00000491163	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
C7orf50-208	ENST00000491163	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.59	■■■□□ 2.81
C7orf50-208	ENST00000491163	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.58	■■■□□ 2.81
C7orf50-208	ENST00000491163	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
C7orf50-208	ENST00000491163	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
C7orf50-208	ENST00000491163	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.55	■■■□□ 2.8
C7orf50-208	ENST00000491163	CLIP1	P30622	1438 aa		32.51	■■■□□ 2.8
C7orf50-208	ENST00000491163	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
C7orf50-208	ENST00000491163	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.48	■■■□□ 2.79
C7orf50-208	ENST00000491163	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
C7orf50-208	ENST00000491163	KDM6B	O15054	1643 aa		32.45	■■■□□ 2.79
C7orf50-208	ENST00000491163	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.45	■■■□□ 2.79
C7orf50-208	ENST00000491163	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.43	■■■□□ 2.78
C7orf50-208	ENST00000491163	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
C7orf50-208	ENST00000491163	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.41	■■■□□ 2.78
C7orf50-208	ENST00000491163	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.4	■■■□□ 2.78
C7orf50-208	ENST00000491163	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.37	■■■□□ 2.77
C7orf50-208	ENST00000491163	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.36	■■■□□ 2.77
C7orf50-208	ENST00000491163	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.36	■■■□□ 2.77
C7orf50-208	ENST00000491163	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.33	■■■□□ 2.77
C7orf50-208	ENST00000491163	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.32	■■■□□ 2.76
C7orf50-208	ENST00000491163	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.32	■■■□□ 2.76
C7orf50-208	ENST00000491163	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
C7orf50-208	ENST00000491163	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.25	■■■□□ 2.75
C7orf50-208	ENST00000491163	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.24	■■■□□ 2.75
C7orf50-208	ENST00000491163	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75	2e-6	■■■■■ 26.8
C7orf50-208	ENST00000491163	KIF14	Q15058	1648 aa		32.18	■■■□□ 2.74
C7orf50-208	ENST00000491163	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.18	■■■□□ 2.74
C7orf50-208	ENST00000491163	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
C7orf50-208	ENST00000491163	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
C7orf50-208	ENST00000491163	NEO1	Q92859	1461 aa		32.06	■■■□□ 2.72
C7orf50-208	ENST00000491163	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.05	■■■□□ 2.72
C7orf50-208	ENST00000491163	FANCA	O15360	1455 aa		32.03	■■■□□ 2.72
C7orf50-208	ENST00000491163	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.03	■■■□□ 2.72
C7orf50-208	ENST00000491163	PLCH2	O75038	1416 aa		31.99	■■■□□ 2.71
C7orf50-208	ENST00000491163	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.98	■■■□□ 2.71
C7orf50-208	ENST00000491163	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.97	■■■□□ 2.71
C7orf50-208	ENST00000491163	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.96	■■■□□ 2.71
C7orf50-208	ENST00000491163	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.95	■■■□□ 2.71
C7orf50-208	ENST00000491163	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.95	■■■□□ 2.71
C7orf50-208	ENST00000491163	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.94	■■■□□ 2.7
C7orf50-208	ENST00000491163	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.9	■■■□□ 2.7
C7orf50-208	ENST00000491163	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.88	■■■□□ 2.69
C7orf50-208	ENST00000491163	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.87	■■■□□ 2.69
C7orf50-208	ENST00000491163	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.87	■■■□□ 2.69
C7orf50-208	ENST00000491163	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.87	■■■□□ 2.69
C7orf50-208	ENST00000491163	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.87	■■■□□ 2.69
C7orf50-208	ENST00000491163	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69

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