RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 IGF1RP08069 1367 aa28.01■■■□□ 2.07
LAMA5-210ENST00000491036 CUL7Q14999 1698 aa27.99■■■□□ 2.07
LAMA5-210ENST00000491036 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.88■■■□□ 2.05
LAMA5-210ENST00000491036 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.86■■■□□ 2.05
LAMA5-210ENST00000491036 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
LAMA5-210ENST00000491036 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.74■■■□□ 2.03
LAMA5-210ENST00000491036 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.7■■■□□ 2.03
LAMA5-210ENST00000491036 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
LAMA5-210ENST00000491036 IQGAP2Q13576 1575 aa27.65■■■□□ 2.02
LAMA5-210ENST00000491036 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.64■■■□□ 2.02
LAMA5-210ENST00000491036 PTPRGP23470 1445 aa27.63■■■□□ 2.01
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LAMA5-210ENST00000491036 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.62■■■□□ 2.01
LAMA5-210ENST00000491036 MAPKBP1O60336 1514 aa27.62■■■□□ 2.01
LAMA5-210ENST00000491036 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.59■■■□□ 2.01
LAMA5-210ENST00000491036 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.59■■■□□ 2.01
LAMA5-210ENST00000491036 DIP2BQ9P265 1576 aa27.53■■■□□ 2
LAMA5-210ENST00000491036 DISP1Q96F81 1524 aa27.49■■□□□ 1.99
LAMA5-210ENST00000491036 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
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LAMA5-210ENST00000491036 TSPOAP1O95153 1857 aa27.45■■□□□ 1.99
LAMA5-210ENST00000491036 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.44■■□□□ 1.98
LAMA5-210ENST00000491036 ABCC2Q92887 1545 aa27.44■■□□□ 1.98
LAMA5-210ENST00000491036 UACAQ9BZF9 1416 aa27.41■■□□□ 1.98
LAMA5-210ENST00000491036 KIAA0556O60303 1618 aa27.4■■□□□ 1.98
LAMA5-210ENST00000491036 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.39■■□□□ 1.98
LAMA5-210ENST00000491036 ASXL2Q76L83 1435 aa27.35■■□□□ 1.97
LAMA5-210ENST00000491036 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.33■■□□□ 1.97
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LAMA5-210ENST00000491036 KDM6BO15054 1643 aa27.3■■□□□ 1.96
LAMA5-210ENST00000491036 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.27■■□□□ 1.96
LAMA5-210ENST00000491036 GOLGA3Q08378 1498 aa27.27■■□□□ 1.96
LAMA5-210ENST00000491036 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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LAMA5-210ENST00000491036 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
LAMA5-210ENST00000491036 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
LAMA5-210ENST00000491036 ABCA8O94911 1581 aa27.14■■□□□ 1.93
LAMA5-210ENST00000491036 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.12■■□□□ 1.93
LAMA5-210ENST00000491036 P3H3Q8IVL6 736 aa27.12■■□□□ 1.93
LAMA5-210ENST00000491036 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
LAMA5-210ENST00000491036 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.09■■□□□ 1.93
LAMA5-210ENST00000491036 EEA1Q15075 1411 aa27.07■■□□□ 1.92
LAMA5-210ENST00000491036 KCNH8Q96L42 1107 aa27.04■■□□□ 1.92
LAMA5-210ENST00000491036 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.04■■□□□ 1.92
LAMA5-210ENST00000491036 ARID3CA6NKF2 412 aa27■■□□□ 1.91
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LAMA5-210ENST00000491036 SAMD9Q5K651 1589 aa26.99■■□□□ 1.91
LAMA5-210ENST00000491036 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.96■■□□□ 1.91
LAMA5-210ENST00000491036 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
LAMA5-210ENST00000491036 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.95■■□□□ 1.9
LAMA5-210ENST00000491036 CD109Q6YHK3 1445 aa26.94■■□□□ 1.9
LAMA5-210ENST00000491036 ATP10BO94823 1461 aa26.92■■□□□ 1.9
LAMA5-210ENST00000491036 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.9■■□□□ 1.9
LAMA5-210ENST00000491036 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.88■■□□□ 1.89
LAMA5-210ENST00000491036 KIF21BO75037 1637 aa26.87■■□□□ 1.89
LAMA5-210ENST00000491036 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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LAMA5-210ENST00000491036 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.83■■□□□ 1.89
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LAMA5-210ENST00000491036 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.8■■□□□ 1.88
LAMA5-210ENST00000491036 ADGRL1O94910 1474 aa26.77■■□□□ 1.88
LAMA5-210ENST00000491036 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
LAMA5-210ENST00000491036 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.75■■□□□ 1.87
LAMA5-210ENST00000491036 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.75■■□□□ 1.87
LAMA5-210ENST00000491036 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
LAMA5-210ENST00000491036 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.67■■□□□ 1.86
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LAMA5-210ENST00000491036 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.63■■□□□ 1.85
LAMA5-210ENST00000491036 NEO1Q92859 1461 aa26.59■■□□□ 1.85
LAMA5-210ENST00000491036 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
LAMA5-210ENST00000491036 RAPGEF3O95398 923 aa26.56■■□□□ 1.84
LAMA5-210ENST00000491036 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
LAMA5-210ENST00000491036 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.53■■□□□ 1.84
LAMA5-210ENST00000491036 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
LAMA5-210ENST00000491036 FMN1Q68DA7 1419 aa26.51■■□□□ 1.83
LAMA5-210ENST00000491036 HECW1Q76N89 1606 aa26.49■■□□□ 1.83
LAMA5-210ENST00000491036 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.48■■□□□ 1.83
LAMA5-210ENST00000491036 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.46■■□□□ 1.83
LAMA5-210ENST00000491036 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.46■■□□□ 1.83
LAMA5-210ENST00000491036 FANCAO15360 1455 aa26.45■■□□□ 1.82
LAMA5-210ENST00000491036 AKNAQ7Z591 1439 aa26.45■■□□□ 1.82
LAMA5-210ENST00000491036 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
LAMA5-210ENST00000491036 RICTORQ6R327 1708 aa26.4■■□□□ 1.82
LAMA5-210ENST00000491036 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
LAMA5-210ENST00000491036 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
LAMA5-210ENST00000491036 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.37■■□□□ 1.81
LAMA5-210ENST00000491036 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.35■■□□□ 1.81
LAMA5-210ENST00000491036 PLCH2O75038 1416 aa26.34■■□□□ 1.81
LAMA5-210ENST00000491036 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.34■■□□□ 1.81
LAMA5-210ENST00000491036 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.34■■□□□ 1.81
LAMA5-210ENST00000491036 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.32■■□□□ 1.8
LAMA5-210ENST00000491036 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.31■■□□□ 1.8
LAMA5-210ENST00000491036 KIF14Q15058 1648 aa26.31■■□□□ 1.8
LAMA5-210ENST00000491036 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
LAMA5-210ENST00000491036 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.28■■□□□ 1.8
LAMA5-210ENST00000491036 CLIP1P30622 1438 aa26.28■■□□□ 1.8
LAMA5-210ENST00000491036 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.28■■□□□ 1.8
LAMA5-210ENST00000491036 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.27■■□□□ 1.8
LAMA5-210ENST00000491036 PTPRMP28827 1452 aa26.26■■□□□ 1.79
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