RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490755.2

TIMM17B-207, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM17B, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-207ENST00000490755 FBLN2P98095 1184 aa29.59■■■□□ 2.33
TIMM17B-207ENST00000490755 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
TIMM17B-207ENST00000490755 NUP160Q12769 1436 aa29.48■■■□□ 2.31
TIMM17B-207ENST00000490755 CHD1O14646 1710 aa29.48■■■□□ 2.31
TIMM17B-207ENST00000490755 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.46■■■□□ 2.31
TIMM17B-207ENST00000490755 CEP170Q5SW79 1584 aa29.46■■■□□ 2.31
TIMM17B-207ENST00000490755 IQGAP2Q13576 1575 aa29.45■■■□□ 2.31
TIMM17B-207ENST00000490755 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.41■■■□□ 2.3
TIMM17B-207ENST00000490755 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.39■■■□□ 2.3
TIMM17B-207ENST00000490755 ARAP1Q96P48 1450 aa29.34■■■□□ 2.29
TIMM17B-207ENST00000490755 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.32■■■□□ 2.28
TIMM17B-207ENST00000490755 SAMD9Q5K651 1589 aa29.3■■■□□ 2.28
TIMM17B-207ENST00000490755 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.28■■■□□ 2.28
TIMM17B-207ENST00000490755 P3H3Q8IVL6 736 aa29.24■■■□□ 2.27
TIMM17B-207ENST00000490755 JPH4Q96JJ6 628 aa29.22■■■□□ 2.27
TIMM17B-207ENST00000490755 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.21■■■□□ 2.27
TIMM17B-207ENST00000490755 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.18■■■□□ 2.26
TIMM17B-207ENST00000490755 DISP1Q96F81 1524 aa29.17■■■□□ 2.26
TIMM17B-207ENST00000490755 KIAA0556O60303 1618 aa29.16■■■□□ 2.26
TIMM17B-207ENST00000490755 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.13■■■□□ 2.25
TIMM17B-207ENST00000490755 SHROOM2Q13796 1616 aa29.12■■■□□ 2.25
TIMM17B-207ENST00000490755 FMN1Q68DA7 1419 aa29.11■■■□□ 2.25
TIMM17B-207ENST00000490755 OSCARQ8IYS5 282 aa29.1■■■□□ 2.25
TIMM17B-207ENST00000490755 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TIMM17B-207ENST00000490755 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.01■■■□□ 2.23
TIMM17B-207ENST00000490755 APLP2Q06481 763 aa29■■■□□ 2.23
TIMM17B-207ENST00000490755 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
TIMM17B-207ENST00000490755 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.98■■■□□ 2.23
TIMM17B-207ENST00000490755 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TIMM17B-207ENST00000490755 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
TIMM17B-207ENST00000490755 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.88■■■□□ 2.21
TIMM17B-207ENST00000490755 MAP3K1Q13233 1512 aa28.87■■■□□ 2.21
TIMM17B-207ENST00000490755 PTPRGP23470 1445 aa28.86■■■□□ 2.21
TIMM17B-207ENST00000490755 HECW1Q76N89 1606 aa28.85■■■□□ 2.21
TIMM17B-207ENST00000490755 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TIMM17B-207ENST00000490755 TIAM1Q13009 1591 aa28.82■■■□□ 2.2
TIMM17B-207ENST00000490755 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.82■■■□□ 2.2
TIMM17B-207ENST00000490755 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.79■■■□□ 2.2
TIMM17B-207ENST00000490755 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.78■■■□□ 2.2
TIMM17B-207ENST00000490755 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.78■■■□□ 2.2
TIMM17B-207ENST00000490755 ABCA8O94911 1581 aa28.77■■■□□ 2.2
TIMM17B-207ENST00000490755 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
TIMM17B-207ENST00000490755 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
TIMM17B-207ENST00000490755 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.72■■■□□ 2.19
TIMM17B-207ENST00000490755 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TIMM17B-207ENST00000490755 UACAQ9BZF9 1416 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM17B-207ENST00000490755 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM17B-207ENST00000490755 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.65■■■□□ 2.18
TIMM17B-207ENST00000490755 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
TIMM17B-207ENST00000490755 ABCC2Q92887 1545 aa28.61■■■□□ 2.17
TIMM17B-207ENST00000490755 ARID3CA6NKF2 412 aa28.61■■■□□ 2.17
TIMM17B-207ENST00000490755 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.6■■■□□ 2.17
TIMM17B-207ENST00000490755 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
TIMM17B-207ENST00000490755 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.6■■■□□ 2.17
TIMM17B-207ENST00000490755 ARHGEF11O15085 1522 aa28.59■■■□□ 2.17
TIMM17B-207ENST00000490755 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
TIMM17B-207ENST00000490755 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
TIMM17B-207ENST00000490755 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.57■■■□□ 2.16
TIMM17B-207ENST00000490755 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
TIMM17B-207ENST00000490755 ATP10BO94823 1461 aa28.55■■■□□ 2.16
TIMM17B-207ENST00000490755 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.52■■■□□ 2.16
TIMM17B-207ENST00000490755 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.47■■■□□ 2.15
TIMM17B-207ENST00000490755 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.47■■■□□ 2.15
TIMM17B-207ENST00000490755 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.47■■■□□ 2.15
TIMM17B-207ENST00000490755 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.46■■■□□ 2.15
TIMM17B-207ENST00000490755 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TIMM17B-207ENST00000490755 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
TIMM17B-207ENST00000490755 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.44■■■□□ 2.14
TIMM17B-207ENST00000490755 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.44■■■□□ 2.14
TIMM17B-207ENST00000490755 NCOA2Q15596 1464 aa28.41■■■□□ 2.14
TIMM17B-207ENST00000490755 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.41■■■□□ 2.14
TIMM17B-207ENST00000490755 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TIMM17B-207ENST00000490755 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.37■■■□□ 2.13
TIMM17B-207ENST00000490755 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TIMM17B-207ENST00000490755 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
TIMM17B-207ENST00000490755 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.3■■■□□ 2.12
TIMM17B-207ENST00000490755 KIF14Q15058 1648 aa28.29■■■□□ 2.12
TIMM17B-207ENST00000490755 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.28■■■□□ 2.12
TIMM17B-207ENST00000490755 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.27■■■□□ 2.12
TIMM17B-207ENST00000490755 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.23■■■□□ 2.11
TIMM17B-207ENST00000490755 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM17B-207ENST00000490755 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM17B-207ENST00000490755 ASXL2Q76L83 1435 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM17B-207ENST00000490755 MIA2Q96PC5 1412 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM17B-207ENST00000490755 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
TIMM17B-207ENST00000490755 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TIMM17B-207ENST00000490755 KCNH8Q96L42 1107 aa28.15■■■□□ 2.1
TIMM17B-207ENST00000490755 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.15■■■□□ 2.1
TIMM17B-207ENST00000490755 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TIMM17B-207ENST00000490755 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.11■■■□□ 2.09
TIMM17B-207ENST00000490755 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
TIMM17B-207ENST00000490755 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TIMM17B-207ENST00000490755 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM17B-207ENST00000490755 MAPKBP1O60336 1514 aa28.08■■■□□ 2.08
TIMM17B-207ENST00000490755 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM17B-207ENST00000490755 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TIMM17B-207ENST00000490755 PREX2Q70Z35 1606 aa28.03■■■□□ 2.08
TIMM17B-207ENST00000490755 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.01■■■□□ 2.07
TIMM17B-207ENST00000490755 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28■■■□□ 2.07
TIMM17B-207ENST00000490755 ITGAEP38570 1179 aa27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms